Pseudomonadati

Pseudomonadati ^{[ 6 ]} es un reino procariota que contiene aproximadamente un tercio de las especies procariotas , principalmente bacterias gramnegativas y sus parientes. ^{[ 5 ]} Es el pariente más cercano de un reino aún mayor de Bacteria , los Bacillati , que son principalmente bacterias grampositivas . ^{[ 7 ] [ 5 ]}

El nombre sinónimo "Hidrobacteria" (hidro = "agua") se refiere al ambiente húmedo inferido para el ancestro común de esas especies. En contraste, las especies de Bacillati poseen adaptaciones para la vida terrestre. ^{[ 7 ] [ 5 ]} Desde 2024, el único nombre válidamente publicado para este grupo es reino Pseudomonadati (antes no existía ninguno, porque no podían existir niveles superiores al filo en versiones anteriores del Código Procariota ). ^{[ 8 ]}

El término "Gracilicutes", descrito en 1978 por Gibbons y Murray, ^{[ 9 ]} se utiliza a veces en lugar de Pseudomonadati. Sin embargo, "Gracilicutes" incluía Cyanobacteria (un miembro de Bacillati) y no se construyó bajo el sistema de tres dominios ahora generalmente aceptado . ^{[ 9 ]} Más recientemente, se propuso una redefinición de "Gracilicutes" ^{[ 10 ]} , pero no incluía una filogenia molecular ni análisis estadísticos. Además, no seguía el sistema de tres dominios , sino que afirmaba que el linaje de eucariotas + Archaea está anidado dentro de Bacteria como un pariente cercano de Actinomycetota , un árbol que no está respaldado por ninguna filogenia molecular.

Se infirió que los Pseudomonadati y los Bacillati divergieron hace aproximadamente 3 mil millones de años, lo que sugiere que la tierra (continentes) había sido colonizada por procariotas en ese momento. ^{[ 5 ]}

Incluyen estos superfilos y filos: Acidobacteriota , Aquificota , Bdellovibrionota , Campylobacterota , Deferribacterota , Dependentiae, Desulfobacterota , Desulfuromonadota, Elusimicrobiota , superfilo FCB , Myxococcota , Nitrospirota , Proteobacteria , superfilo PVC y Spirochaetota . ^{[ 11 ] [ 12 ]}

Algunos análisis filogenéticos moleculares sin raíz ^{[ 13 ] [ 14 ]} no han respaldado esta dicotomía de Bacillati y Pseudomonadati, pero los análisis genómicos más recientes, ^{[ 11 ] [ 12 ]} incluidos aquellos que se han centrado en enraizar el árbol, ^{[ 11 ]} han encontrado que estos dos grupos son monofiléticos.

En conjunto, Pseudomonadati y Bacillati forman un gran clado que contiene el 97% de los procariotas y el 99% de todas las especies de Bacteria conocidas hasta 2009, y que Battistuzzi y Hedges ubicaron en el taxón propuesto Selabacteria , en alusión a sus capacidades fototróficas (del griego σέλας = luz). ^{[ 15 ]} Actualmente, los filos bacterianos que están fuera de Pseudomonadati + Bacillati, y que por lo tanto justifican el taxón Selabacteria, son objeto de debate y pueden o no incluir Fusobacteria . ^{[ 11 ] [ 12 ]}

La definición de dos divisiones principales dentro del dominio Bacteria , Pseudomonadati y Bacillati, proviene en gran medida de análisis filogenéticos enraizados de genomas. ^{[ 7 ] [ 5 ] [ 11 ] [ 12 ]} Los análisis no enraizados no han respaldado completamente esta división, ^{[ 14 ] [ 13 ]} lo que resalta la importancia de los árboles de la vida enraizados.

Los dos análisis recientes de filogenia bacteriana respaldaron la división de Pseudomonadati y Bacillati. ^{[ 11 ] [ 12 ]} Sin embargo, interpretaron la evolución de la pared celular de manera diferente: uno concluyó que el último ancestro común de las bacterias era un monodermo ( bacteria grampositiva ^{[ 11 ]} ) y el otro que era un didermo ( bacteria gramnegativa ^{[ 12 ]} ). El siguiente árbol se redibujó a partir de uno de esos dos estudios recientes, ^{[ 11 ]} mostrando la filogenia de los filos y superfilos bacterianos, con la posición de Fusobacteria sin resolver y DST como el pariente más cercano de Bacillati:

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) ^{[ 16 ]} y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). ^{[ 17 ]}

Filos no asignados:

• " Canglongiota " Zhang et al. 2022
• Fidelibacterota Katayama et al. 2024 [incl. "Neomarinimicrobiota" Rinke et al. 2013 ]
• " Heilongiota " Zhang et al. 2022
• " Nitrosediminicolota " Zhao, Jorgensen y Babbin 2024
• " Saltatorellota " Wiegand et al. 2019
• " Tianyaibacteriota " corrig. Cui et al. 2021

• Lista de órdenes bacterianas
• Lista de géneros de bacterias