La subunidad beta tipo 9 del proteasoma, también conocida como subunidad beta-1i del proteasoma 20S, es una proteína que en humanos está codificada por el gen PSMB9 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Esta proteína es una de las 17 subunidades esenciales (subunidades alfa 1-7, subunidades beta constitutivas 1-7 y subunidades inducibles, incluyendo beta1i , beta2i , beta5i ) que contribuyen al ensamblaje completo del complejo proteasoma 20S . En particular, la subunidad beta tipo 5 del proteasoma, junto con otras subunidades beta, se ensambla en dos anillos heptaméricos y posteriormente en una cámara proteolítica para la degradación del sustrato. Esta proteína contiene actividad "similar a la tripsina" y es capaz de escindir después de residuos básicos del péptido. [ 8 ] El proteasoma eucariota reconoce proteínas degradables, incluyendo proteínas dañadas para el control de calidad de proteínas o componentes proteicos reguladores clave para procesos biológicos dinámicos. Las subunidades constitutivas beta1, beta2 y beta 5 (nomenclatura sistemática) pueden ser reemplazadas por sus contrapartes inducibles beta1i, 2i y 5i cuando las células están bajo el tratamiento con interferón-γ. El complejo proteasómico resultante se convierte en el llamado inmunoproteasoma. Una función esencial del complejo proteasómico modificado, el inmunoproteasoma, es el procesamiento de numerosos epítopos de células T restringidos por MHC de clase I. [ 9 ]
Estructura
Gene
El gen PSMB9 codifica un miembro de la familia del proteasoma tipo B, también conocida como familia T1B, que es una subunidad beta central 20S. Este gen se encuentra en la región de clase II del MHC (complejo mayor de histocompatibilidad). La expresión de este gen es inducida por el interferón gamma y este producto génico reemplaza a la subunidad catalítica 1 (subunidad beta 6 del proteasoma) en el inmunoproteasoma. El procesamiento proteolítico es necesario para generar una subunidad madura. Se han identificado dos transcritos alternativos que codifican diferentes isoformas; ambas isoformas se procesan para producir la misma subunidad madura. [ 7 ] El gen humano PSMB9 tiene 6 exones y se localiza en la banda cromosómica 6p21.3.
Proteína
La subunidad beta tipo 9 del proteasoma humano tiene un tamaño de 21 kDa y está compuesta por 199 aminoácidos. El punto isoeléctrico teórico calculado para esta proteína es de 4,80.
Ensamblaje complejo
El proteasoma es un complejo proteasa multicatalítico con una estructura central 20S altamente ordenada. Esta estructura central en forma de barril está compuesta por 4 anillos apilados axialmente de 28 subunidades no idénticas: los dos anillos extremos están formados cada uno por 7 subunidades alfa, y los dos anillos centrales por 7 subunidades beta. Tres subunidades beta ( beta1 , beta2 , beta5 ) contienen cada una un sitio activo proteolítico y presentan preferencias de sustrato distintas. Los proteasomas se distribuyen por toda la célula eucariota en alta concentración y escinden péptidos en un proceso dependiente de ATP / ubiquitina en una vía no lisosomal . [ 10 ] [ 11 ]
Función
Las funciones de las proteínas están sustentadas por su estructura terciaria y su interacción con socios asociados. Como una de las 28 subunidades del proteasoma 20S, la subunidad beta tipo 2 del proteasoma contribuye a formar un entorno proteolítico para la degradación del sustrato. Las evidencias de las estructuras cristalinas del complejo proteasómico 20S aislado demuestran que los dos anillos de subunidades beta forman una cámara proteolítica y mantienen todos sus sitios activos de proteólisis dentro de la cámara. [ 11 ] Simultáneamente, los anillos de subunidades alfa forman la entrada para los sustratos que ingresan a la cámara proteolítica. En un complejo proteasómico 20S inactivado, la puerta de entrada a la cámara proteolítica interna está custodiada por las colas N-terminales de subunidades alfa específicas. Este diseño estructural único evita el encuentro aleatorio entre los sitios activos proteolíticos y el sustrato proteico, lo que hace que la degradación de proteínas sea un proceso bien regulado. [ 12 ] [ 13 ] El complejo proteasómico 20S, por sí mismo, suele ser funcionalmente inactivo. La capacidad proteolítica de la partícula central (PC) del proteasoma 20S se activa cuando la PC se asocia con una o dos partículas reguladoras (PR) a uno o ambos lados de los anillos alfa. Estas partículas reguladoras incluyen complejos del proteasoma 19S, complejo del proteasoma 11S, etc. Tras la asociación PC-PR, la conformación de ciertas subunidades alfa cambia y, en consecuencia, se abre la puerta de entrada del sustrato. Además de las PR, los proteasomas 20S también pueden activarse eficazmente mediante otros tratamientos químicos suaves, como la exposición a bajas concentraciones de dodecilsulfato de sodio (SDS) o NP-14. [ 13 ] [ 14 ]
La subunidad beta-5i del proteasoma 20S (nomenclatura sistemática) se expresa originalmente como un precursor de 276 aminoácidos. El fragmento de 72 aminoácidos en el extremo N-terminal del péptido es esencial para el correcto plegamiento de la proteína y el posterior ensamblaje del complejo. En la etapa final del ensamblaje del complejo, el fragmento N-terminal de la subunidad beta5 se escinde, formando la subunidad beta5i madura del complejo 20S. [ 15 ] Durante el ensamblaje basal, se requiere un procesamiento proteolítico para generar una subunidad madura. La subunidad beta5i solo está presente en el inmunoproteasoma y es reemplazada por la subunidad beta5 (subunidad beta 5 del proteasoma) en el complejo proteasómico 20S constitutivo.
Importancia clínica
El proteasoma y sus subunidades tienen relevancia clínica por al menos dos razones: (1) un ensamblaje complejo alterado o un proteasoma disfuncional pueden estar asociados con la fisiopatología subyacente de enfermedades específicas, y (2) pueden utilizarse como dianas farmacológicas para intervenciones terapéuticas. Más recientemente, se ha intensificado el estudio del proteasoma para el desarrollo de nuevos marcadores y estrategias de diagnóstico. Una comprensión más profunda y completa de la fisiopatología del proteasoma debería conducir a aplicaciones clínicas en el futuro.
Los proteasomas forman un componente fundamental del sistema ubiquitina-proteasoma (UPS) [ 16 ] y del correspondiente control de calidad de proteínas (PQC) celular. La ubiquitinación de proteínas y la posterior proteólisis y degradación por el proteasoma son mecanismos importantes en la regulación del ciclo celular , el crecimiento y la diferenciación celular , la transcripción génica, la transducción de señales y la apoptosis . [ 17 ] Posteriormente, un ensamblaje y una función comprometidos del complejo proteasoma conducen a una reducción de las actividades proteolíticas y a la acumulación de especies de proteínas dañadas o mal plegadas. Dicha acumulación de proteínas puede contribuir a la patogénesis y las características fenotípicas en enfermedades neurodegenerativas, [ 18 ] [ 19 ] enfermedades cardiovasculares, [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] respuestas inflamatorias y enfermedades autoinmunes, [ 23 ] y respuestas sistémicas al daño del ADN que conducen a neoplasias malignas . [ 24 ]
Varios estudios experimentales y clínicos han indicado que las aberraciones y desregulaciones del UPS contribuyen a la patogénesis de varios trastornos neurodegenerativos y miodegenerativos, incluyendo la enfermedad de Alzheimer , [ 25 ] la enfermedad de Parkinson [ 26 ] y la enfermedad de Pick , [ 27 ] la esclerosis lateral amiotrófica (ELA), [ 27 ] la enfermedad de Huntington , [ 26 ] la enfermedad de Creutzfeldt-Jakob , [ 28 ] y enfermedades de las neuronas motoras, enfermedades de poliglutamina (PolyQ), distrofias musculares [ 29 ] y varias formas raras de enfermedades neurodegenerativas asociadas con demencia . [ 30 ] Como parte del Sistema Ubiquitina-Proteasoma (UPS) , el proteasoma mantiene la homeostasis de las proteínas cardíacas y, por lo tanto, juega un papel significativo en la lesión isquémica cardíaca , [ 31 ] la hipertrofia ventricular [ 32 ] y la insuficiencia cardíaca . [ 33 ] Además, se acumula evidencia de que el UPS juega un papel esencial en la transformación maligna. La proteólisis del UPS juega un papel importante en las respuestas de las células cancerosas a señales estimuladoras que son críticas para el desarrollo del cáncer. En consecuencia, la expresión génica por degradación de factores de transcripción , tales como p53 , c-jun , c-Fos , NF-κB , c-Myc , HIF-1α, MATα2, STAT3 , proteínas de unión al elemento regulado por esteroles y receptores de andrógenos están todos controlados por el UPS y por lo tanto involucrados en el desarrollo de varias neoplasias malignas. [ 34 ] Además, el UPS regula la degradación de productos de genes supresores de tumores tales como poliposis adenomatosa del colon ( APC ) en cáncer colorrectal, retinoblastoma (Rb). y el supresor tumoral de von Hippel-Lindau (VHL), así como una serie de protooncogenes ( Raf , Myc , Myb , Rel , Src , Mos , AblEl UPS también participa en la regulación de las respuestas inflamatorias. Esta actividad se atribuye generalmente al papel de los proteasomas en la activación de NF-κB, que a su vez regula la expresión de citocinas proinflamatorias como TNF-α , IL-β, IL-8 , moléculas de adhesión ( ICAM-1 , VCAM-1 , P-selectina ) y prostaglandinas y óxido nítrico (NO). [ 23 ] Además, el UPS también desempeña un papel en las respuestas inflamatorias como regulador de la proliferación de leucocitos, principalmente a través de la proteólisis de ciclinas y la degradación de inhibidores de CDK . [ 35 ] Por último, los pacientes con enfermedades autoinmunes como LES , síndrome de Sjögren y artritis reumatoide (AR) presentan predominantemente proteasomas circulantes que pueden utilizarse como biomarcadores clínicos. [ 36 ]
Durante el procesamiento de antígenos para el complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) de clase I, el proteasoma es la principal maquinaria de degradación que degrada el antígeno y presenta los péptidos resultantes a los linfocitos T citotóxicos. [ 37 ] [ 38 ] Se ha considerado que el inmunoproteasoma desempeña un papel fundamental en la mejora de la calidad y cantidad de los ligandos de clase I generados.
La relevancia clínica de la proteína PSMB9 se encuentra principalmente en las áreas de enfermedades infecciosas , autoinmunes y oncología . Por ejemplo, se ha verificado que el ARNm que codifica para PSMB9 (junto con CFD , MAGED1 , PRDX4 y FCGR3B ) se expresa de forma diferencial entre pacientes que desarrollaron síntomas clínicos asociados con la forma leve del dengue y pacientes que presentaron síntomas clínicos asociados con el dengue grave. El estudio sugiere que este panel de expresión génica podría servir como biomarcador del pronóstico clínico en la fiebre hemorrágica del dengue. [ 39 ] Otros estudios también indican un papel para PMSB9, en un panel con otros 9 genes (Zbp1, Mx2, Irf7, Lfi47, Tapbp, Timp1, Trafd1, Tap2) en el desarrollo de vacunas contra la influenza , [ 40 ] y en el diagnóstico de la enfermedad autoinmune síndrome de Sjögren junto con otros 18 genes ( EPSTI1 , IFI44, IFI44L, IFIT1 , IFIT2 , IFIT3 , MX1 , OAS1 , SAMD9L, STAT1 , HERC5 , EV12B, CD53 , SELL , HLA-DQA1 , PTPRC , B2M , y TAP2 ). [ 41 ] En lo que respecta a la oncología, PSMB9 junto con otros genes que participan en los procesos de respuesta inmune ( TAP1 , PSMB8 , PSMB9, HLA-DQB1 , HLA-DQB2 , HLA-DMA y HLA-DOA ) pueden formar una evaluación integral del resultado clínico en las evaluaciones de metilación tumoral del carcinoma epitelial de ovario. El estudio sugiere que una respuesta inmune mediada epigenéticamente es un predictor de recurrencia y, posiblemente, de respuesta al tratamiento para los carcinomas epiteliales serosos de ovario de alto grado . [ 42 ]
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