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Paucimonas

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Paucimonas lemoignei , anteriormente conocida como Pseudomonas lemoignei , es una bacteria del suelo Gram negativa . Es aerobia , móvil y tiene forma de bacilo . Es la única especie del género Paucimonas . [ 1 ]

Información básica

Fuentes: [ 2 ] [ 3 ]

  • Varillas rectas o ligeramente curvadas. Se mueven mediante un único flagelo polar. No se han encontrado endosporas.
  • Su único hábitat conocido es el suelo, en particular la rizosfera , pero no está asociado a plantas.
  • Aeróbico obligado . Quimioorganotrófico . Caracterizado por un metabolismo restringido.
  • La mayoría de las cepas son capaces de fijar nitrógeno.
  • Crece entre pH 5,5 y 9,0. La temperatura óptima ronda los 30  °C, pero no se observa crecimiento por encima de los 41  °C.
  • Las colonias son circulares, pequeñas, de color blanco a beige y se adhieren al agar.

Taxonomía

Fuentes: [ 2 ] [ 3 ]

Paucimonas lemoignei fue descrita por Delafield et al. en 1965 y transferida por Jendrossek en 2001 tras reevaluar su secuencia de ADNr 16S . Esto representa un cambio significativo de una clase a otra. Hasta el momento, P. lemoignei es la única especie del género Paucimonas.

« Paucus » significa poco o pocos. « Paucimonas » se refiere a una bacteria con capacidades catabólicas restringidas. P. lemoignei recibe su nombre del microbiólogo francés Maurice Lemoigne, quien describió por primera vez el poli-3-hidroxibutirato (PHB) como un componente de las células bacterianas.

Propiedades metabólicas

Fuentes: [ 2 ] [ 3 ]

Paucimonas lemoignei se aisló originalmente de suelos ricos en poli-3-hidroxibutirato (PHB). Solo se conocen 10 sustratos, en su mayoría ácidos orgánicos, que P. lemoignei puede utilizar como única fuente de carbono. Los azúcares, los ácidos de azúcar, los alcoholes, los polialcoholes, los aminoácidos, los polipéptidos y los polioles no favorecen su crecimiento. Las fuentes de carbono preferidas incluyen: acetato, piruvato, succinato, butirato , 3-hidroxibutirato , valerato y 3-hidroxivalerato.

Solicitud

Los polihidroxialcanoatos (PHA) son poliésteres que se utilizan para fabricar termoplásticos biodegradables y biocompatibles, lo que ha despertado interés comercial debido a la creciente concienciación sobre la sostenibilidad. Las bacterias que degradan los PHA son principalmente proteobacterias. (Nota: PHB y PHV, mencionados anteriormente, son dos tipos pertenecientes a la familia de los PHA).

P. lemoignei puede codificar cinco tipos de PHA despolimerasa extracelular, todas las cuales hidrolizan PHB con alta actividad específica. [ 4 ] Hidroliza el dímero de 3-hidroxibutirato con la mayor actividad específica de todas las enzimas reportadas hasta ahora. [ 5 ] Además, las enzimas purificadas son notablemente estables y activas a alta temperatura (60  °C), pH alto (hasta 12,0), baja fuerza iónica (agua destilada) y en disolventes ( por ejemplo, alcohol n -propílico). [ 6 ]

Las despolimerasas de PHA de P. lemoignei demuestran una expresión y secreción estables en Escherichia coli recombinante . [ 7 ] Los sitios de procesamiento de los precursores en E. coli fueron los mismos que en P. lemoignei , y se determinaron especificidades de sustrato similares para las proteínas de tipo silvestre y recombinantes. [ 4 ] Esto sienta las bases para la producción optimizada de despolimerasas de PHA extracelulares.

Referencias

  1. ↑ entrada de género/paucimonas en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ" . Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  2. 1 2 3 Delafield, FP; Doudoroff, M.; Palleroni, NJ; Lusty, CJ; Contopoulos, R. (noviembre de 1965). " Descomposición del poli-β-hidroxibutirato por pseudomonas" . Journal of Bacteriology . 90 (5): 1455– 1466. doi : 10.1128/jb.90.5.1455-1466.1965 . ISSN 0021-9193 . PMC 315835. PMID 5848334 .   
  3. 1 2 3 Jendrossek, D (2001-05-01). "Transferencia de [ Pseudomonas ] lemoignei, un bacilo gramnegativo con capacidad catabólica restringida, a Paucimonas gen. nov. con una especie, Paucimonas lemoignei comb. nov." . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 51 (3): 905– 908. doi : 10.1099/00207713-51-3-905 . ISSN 1466-5026 . PMID 11411713 .  
  4. 1 2 Jendrossek, D; Frisse, A; Behrends, A; Andermann, M; Kratzin, HD; Stanislawski, T; Schlegel, HG (febrero de 1995). " Caracterización bioquímica y molecular del sistema de polihidroxialcanoato despolimerasa de Pseudomonas lemoignei" . Journal of Bacteriology . 177 (3): 596– 607. doi : 10.1128/jb.177.3.596-607.1995 . ISSN 0021-9193 . PMC 176633. PMID 7836292 .   
  5. ↑ Uchino, Keiichi; Katsumata, Yoko; Takeda, Tomoko; Arai, Hiroki; Shiraki, Mari; Saito, Terumi (septiembre de 2007). "Purificación y clonación molecular de una 3-hidroxibutirato-oligómero hidrolasa intracelular de Paucimonas lemoignei". Revista de Biociencia y Bioingeniería . 104 (3): 224– 226. doi : 10.1263/jbb.104.224 . PMID 17964488 . 
  6. ↑ Handrick, René; Reinhardt, Simone; Focarete, Maria Letizia; Scandola, Mariastella; Adamus, Grazyna; Kowalczuk, Marek; Jendrossek, Dieter (septiembre de 2001). "Un nuevo tipo de hidrolasa termoalcalófila de Paucimonas lemoignei con alta especificidad para poliésteres amorfos de ácidos hidroxialcanoicos de cadena corta" . Journal of Biological Chemistry . 276 (39): 36215– 36224. doi : 10.1074/jbc.M101106200 . PMID 11457823 . 
  7. ↑ Park, Se Whan; Chung, Moon Gyu; Lee, Hwa Young; Kim, Jeong Yoon; Rhee, Young Ha (diciembre de 2008). "Expresión estable y secreción de la polihidroxibutirato despolimerasa de Paucimonas lemoignei en Escherichia coli". The Journal of Microbiology . 46 (6): 662– 669. doi : 10.1007/s12275-008-0283-z . ISSN 1225-8873 . PMID 19107395 .  
  • JP Euzéby: Lista de nombres procariotas con Stand . ng en Nomenclatura
  • Cepa tipo de Paucimonas lemoignei en Bac Dive - la base de datos de metadatos de diversidad bacteriana