Peter Karl Sorger

Peter Karl Sorger (nacido el 13 de febrero de 1961 en Halifax, Nueva Escocia , Canadá) es un biólogo de sistemas y cáncer, y profesor Otto Krayer de farmacología de sistemas en el Departamento de Biología de Sistemas de la Facultad de Medicina de Harvard . ^{[ 1 ]} Sorger es el director fundador del Programa de Harvard en Ciencias Terapéuticas (HiTS), director de su Laboratorio de Farmacología de Sistemas (LSP) y codirector del Centro Harvard-MIT para la Ciencia Regulatoria. Anteriormente fue profesor de Biología e Ingeniería Biológica en el Instituto Tecnológico de Massachusetts, donde cofundó su programa de Biología Computacional y de Sistemas (CSBi). Sorger es conocido por su trabajo en el campo de la biología de sistemas y por haber ayudado a lanzar el campo de la farmacología computacional y de sistemas. Su investigación se centra en los orígenes moleculares del cáncer y en enfoques para acelerar el desarrollo de nuevos medicamentos. Sorger imparte la asignatura Principios y Práctica del Desarrollo de Fármacos en el Instituto Tecnológico de Massachusetts y en la Universidad de Harvard .

Sorger nació el 13 de febrero de 1961 en Halifax, Nueva Escocia, Canadá, de padres escoceses y austriacos. Su familia emigró a los Estados Unidos en 1963. Se graduó summa cum laude de Harvard College en 1983 (en Bioquímica) donde estudió el ensamblaje de virus icosaédricos bajo la supervisión de Stephen C. Harrison . Recibió su doctorado en Bioquímica como becario Marshall de Trinity College, Cambridge, por una investigación sobre la regulación transcripcional de genes de choque térmico ^{[ 2 ] [ 3 ]} bajo la supervisión de Hugh Pelham en el Laboratorio de Biología Molecular del Consejo de Investigación Médica en Cambridge, Inglaterra . Luego se formó como becario Richard Childs y becario Lucille P. Markey con Harold Varmus y Andrew Murray en la Universidad de California, San Francisco .

Sorger se incorporó al Departamento de Biología del MIT en 1994, tras un año como científico visitante con Anthony A. Hyman en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular de Heidelberg , Alemania. En 2004, Sorger se convirtió en catedrático de los Departamentos de Biología e Ingeniería Biológica del MIT.

La investigación postdoctoral y de los primeros años de la facultad de Sorger condujo a la primera reconstitución de una unión cromosoma- microtúbulo (un cinetocoro de levadura ) y la posterior identificación de múltiples proteínas del cinetocoro. ^{[ 4 ] [ 5 ]} Su grupo identificó homólogos de mamíferos de las proteínas del punto de control que regulan la entrada en la mitosis, y demostró que las mutaciones en estos genes pueden ser oncogénicas porque causan inestabilidad cromosómica . ^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]} Este trabajo contribuyó a la comprensión de la transmisión fiel de cromosomas de la madre a las células hijas. Los defectos en estos mecanismos causan aneuploidía que juega un papel importante en la transformación oncogénica .

Trabajando en estrecha colaboración con Doug Lauffenburger y financiado por la Agencia de Proyectos de Investigación Avanzada de Defensa y el programa de Centros Nacionales de Biología de Sistemas de los Institutos Nacionales de Salud , ^{[ 9 ]} el trabajo de Sorger en la década de 1990 se centró cada vez más en la oncogénesis misma y en la transducción de señales de mamíferos . ^{[ 10 ]} El enfoque de Sorger y Lauffenburger combinó genética molecular , microscopía de células vivas y modelado computacional mecanicista . ^{[ 11 ] [ 12 ]} Su enfoque en la bioquímica REF fue inusual en una era dominada por la genómica y finalmente llevó a Sorger a cofundar la empresa de software Glencoe Software y la empresa de biotecnología Merrimack Pharmaceuticals . ^{[ 13 ]} El trabajo posterior del grupo de Sorger condujo a una nueva comprensión de la fluctuación estocástica en las respuestas celulares a ligandos naturales y fármacos ^{[ 14 ] [ 15 ]} y al desarrollo de una gama de métodos computacionales innovadores, incluyendo el Python PySB específico para bioquímica ^{[ 16 ]} y el sistema de procesamiento del lenguaje natural y ensamblaje de conocimiento INDRA. ^{[ 17 ] [ 18 ]}

En 2011, Sorger participó activamente en el desarrollo de la disciplina de Farmacología de Sistemas Cuantitativos , incluyendo la supervisión de la preparación de un documento técnico ampliamente citado para los NIH titulado "Farmacología Cuantitativa y de Sistemas en la Era Postgenómica: Nuevos Enfoques para el Descubrimiento de Fármacos y la Comprensión de los Mecanismos Terapéuticos". ^{[ 19 ]} Este documento técnico vislumbró el surgimiento de un enfoque empíricamente basado pero computacionalmente sofisticado para la ciencia subyacente al desarrollo de nuevos medicamentos innovadores. Sorger se trasladó a la Facultad de Medicina de Harvard ^{[ 20 ]} para continuar con estos enfoques mediante el establecimiento del Laboratorio de Farmacología de Sistemas, que fusiona experimentos de laboratorio, informática y medicina para mejorar fundamentalmente el descubrimiento de fármacos. ^{[ 21 ]} La financiación del Massachusetts Life Sciences Center en 2014 ^{[ 22 ]} y 2017 ^{[ 23 ] [ 24 ]} hizo realidad el laboratorio y ahora cuenta con 150 profesores en formación y personal de instituciones del área de Boston, incluyendo la Universidad de Harvard , el MIT , la Universidad de Tufts , la Universidad Northeastern y hospitales afiliados a Harvard.

La investigación de Sorger involucra múltiples enfoques de farmacología de sistemas para el cáncer. El primero se centra en la farmacología preclínica , la etapa en la que se estudian los mecanismos moleculares de la enfermedad y se buscan nuevos fármacos. Una investigación sobre las causas de la irreproducibilidad de las mediciones de respuesta a fármacos ^{[ 25 ]} condujo a una serie de mejoras conceptuales, ^{[ 26 ]} computacionales, ^{[ 27 ]} y experimentales ^{[ 28 ]} en la puntuación de la acción de los fármacos que ahora se utilizan ampliamente en el ámbito académico y la industria y han permitido el descubrimiento de nuevos mecanismos de acción para fármacos existentes. ^{[ 29 ]} El trabajo reciente se ha centrado en el aprendizaje profundo como medio para comprender mejor las redes de proteínas complejas y los mecanismos de los fármacos. ^{[ 30 ] [ 31 ]} El segundo proyecto implica el desarrollo de métodos para estudiar el mecanismo de los fármacos a gran escala en pacientes a través de imágenes de tejido altamente multiplexadas ^{[ 32 ] [ 33 ]} de las biopsias adquiridas rutinariamente de pacientes (particularmente pacientes con cáncer). ^{[ 34 ]} Esto ha dado lugar a un programa de imágenes de tejidos e histología digital de rápido crecimiento ^{[ 35 ]} que forma parte del Moonshot del Instituto Nacional del Cáncer de EE. UU. y promete avanzar sustancialmente en la atención oncológica de precisión . ^{[ 36 ]} El tercer proyecto consiste en estudiar el registro de ensayos clínicos para comprender cómo difieren los ensayos exitosos y los fallidos. Un éxito inicial fue el descubrimiento de que la gran mayoría de las terapias combinadas contra el cáncer aprobadas exhiben una acción independiente, no sinergia. ^{[ 37 ] [ 38 ]} Como los investigadores de Merck & Co. se dieron cuenta posteriormente, esto cambia fundamentalmente la forma en que deben desarrollarse las combinaciones de inmunoterapia. ^{[ 39 ]} El grupo ahora está involucrado en un esfuerzo a gran escala ^{[ 40 ]} para digitalizar y poner a disposición libremente todos los datos de supervivencia de los ensayos clínicos de fase 3. ^{[ 41 ]}

Durante los inicios de la pandemia de COVID-19 , Sorger, la médica Nicole LeBoeuf y la estudiante de MD-PhD Deborah Plana establecieron el equipo de Fabricación para la Pandemia del Área de Boston (PanFab) en respuesta a la escasez de mascarillas , respiradores y otros equipos de protección personal para los trabajadores de la salud. ^{[ 42 ] [ 43 ]} El equipo estaba compuesto por estudiantes y exalumnos del MIT y la Universidad de Harvard y trabajó con socios de la industria local en proyectos de impresión 3D y fabricación rápida. Estos proyectos incluyeron el desarrollo de protectores faciales, ^{[ 44 ]} marcos para mascarillas, ^{[ 45 ]} respiradores purificadores de aire motorizados, ^{[ 46 ]} y métodos para esterilizar y reutilizar respiradores N95 . ^{[ 47 ]} El grupo PanFab produjo múltiples publicaciones de acceso abierto y publicó archivos de diseño que documentaban este trabajo, incluyendo un resumen de los resultados y las lecciones aprendidas. ^{[ 48 ]}