EMBnet

La red europea de biología molecular ( EMBnet ) es una red científica internacional y un grupo de interés que busca mejorar los servicios de bioinformática reuniendo conocimientos y capacidades en este campo. ^{[ 1 ]} En 2011, EMBnet contaba con 37 nodos distribuidos en 32 países. Estos nodos incluyen departamentos universitarios relacionados con la bioinformática , institutos de investigación y proveedores de servicios nacionales.

La tarea principal de la mayoría de los nodos de EMBnet es proporcionar a su comunidad científica nacional acceso a bancos de datos bioinformáticos , software especializado y recursos informáticos y experiencia suficientes. EMBnet también trabaja en los campos de la formación en bioinformática y el desarrollo de software . Ejemplos de software creado por miembros de EMBnet son: EMBOSS , wEMBOSS, ^{[ 2 ]} UTOPIA .

EMBnet representa a un amplio grupo de usuarios y colabora estrechamente con los productores de bases de datos, como el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) del EMBL, el Instituto Suizo de Bioinformática ( Swiss-Prot ) y el Centro de Información de Secuencias de Proteínas de Múnich (MIPS), con el fin de ofrecer una cobertura uniforme de servicios en toda Europa . EMBnet está registrada en los Países Bajos como fundación pública ( Stichting ).

Desde su creación en 1988, EMBnet ha evolucionado de una red informal de personas encargadas del mantenimiento de bases de datos biológicas a la única organización mundial que reúne a profesionales de la bioinformática para trabajar juntos al servicio de los campos en expansión de la genética y la biología molecular . Si bien está compuesta principalmente por nodos académicos, EMBnet adquiere una importante dimensión adicional gracias a sus miembros industriales. El éxito de EMBnet está atrayendo a un número creciente de organizaciones fuera de Europa .

EMBnet cuenta con una infraestructura probada para organizar cursos de formación, brindar asistencia técnica y ayudar a sus miembros a interactuar eficazmente y responder a las necesidades en constante cambio de la investigación biológica, algo que ningún instituto por sí solo puede hacer.

En 2005, la organización creó tipos adicionales de nodos para permitir más de un miembro por país. La nueva categoría se denomina "nodo asociado".

EMBnet se rige por las Asambleas Generales Anuales (AGA) y está coordinada por una junta ejecutiva (BE) que supervisa las actividades de tres comités de proyecto:

• Comité de Educación y Formación (E&F). El apoyo educativo incluye una serie de cursos organizados en los países y lenguas de los miembros. El comité también trabaja en el desarrollo continuo de materiales educativos accesibles en línea.
• Comité de Publicidad y Relaciones Públicas (P&RP). Este comité es responsable de promover cualquier tipo de actividad de EMBnet, de publicitar los productos y servicios que ofrece la comunidad EMBnet, así como de proponer y desarrollar nuevas estrategias para aumentar la visibilidad de EMBnet y de mantener las relaciones públicas con las comunidades de EMBnet y las redes/sociedades relacionadas.
• Comité de Gestión Técnica (GT). El GT proporciona asistencia y ayuda práctica a los nodos participantes y a sus usuarios.

EMBnet contó con los primeros servidores Gopher y World Wide Web en biología (CSC BioBox).

EMBnet fue la primera en proponer soluciones para la actualización diaria de bases de datos utilizando Internet (NDT), computación distribuida (HASSLE) y navegación y vinculación eficientes de bases de datos (Sistema de Recuperación de Secuencias, SRS).

El proyecto Ping se creó como un medio para obtener información continua sobre la eficiencia de la red en toda Europa .

EMBnet se compromete a brindar al usuario los algoritmos de software más recientes de forma gratuita ( GCG extendido o EGCG ^{[ 3 ]} ) y continúa desarrollando software público de vanguardia ( EMBOSS ).

EMBER : un recurso educativo multimedia europeo de bioinformática. EMBER fue un proyecto financiado por la Unión Europea (UE) que tenía como objetivo desarrollar un conjunto de herramientas educativas multimedia de bioinformática ^{[ 4 ]} . EMBER comprende un tutorial web interactivo e independiente sobre bioinformática y el curso equivalente independiente en CD-ROM .

La comunidad de EMBnet participó en la creación de la revista revisada por pares Briefings in Bioinformatics (BiB). BiB también recibió el apoyo de una beca educativa de EMBnet.

La Organización Global para el Aprendizaje, la Educación y la Capacitación en Bioinformática (GOBLET) se constituyó como una fundación sin fines de lucro en la reunión anual de EMBnet de 2012. ^{[ 5 ] [ 6 ]}

Desde 1994 hasta 2009, EMBnet publicó EMBnet.news . ^{[ 7 ]} Su objetivo principal era brindar información e informes sobre las últimas noticias y desarrollos de la red a la comunidad de usuarios.

Establecida en 2010 como sucesora de EMBnet.news (con numeración de volumen ininterrumpida), EMBnet.journal es una revista científica de acceso abierto con revisión por pares que publica artículos técnicos y de investigación originales en bioinformática . ^{[ 8 ] [ 9 ]} La revista contiene dos secciones principales: una para artículos de investigación, revisiones y notas técnicas, y otra para comentarios, reportajes, guías de usuario, información de capacitación y noticias sin revisión por pares. EMBnet.journal también publica actas de congresos y resúmenes de reuniones como suplementos.

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