Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Prp24

Prp24 ( precursor RNA p ocessing, gen 24 ) es una proteína que forma parte del proceso de empalme del ARN mensajero precursor y ayuda a la unión del ARNsn U6 al ARNsn U4 durante...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

Prp24 ( precursor RNA p ocessing, gen 24 ) es una proteína que forma parte del proceso de empalme del ARN mensajero precursor y ayuda a la unión del ARNsn U6 al ARNsn U4 durante la formación de los espliceosomas . Presente en eucariotas desde levaduras hasta E. coli , hongos y humanos, Prp24 fue descubierto inicialmente como un elemento importante del empalme de ARN en 1989. [ 1 ] [ 2 ] Posteriormente, en 1991, se descubrió que las mutaciones en Prp24 suprimían las mutaciones en U4 que daban lugar a cepas de levadura sensibles al frío, lo que indica su participación en la reformación del dúplex U4/U6 después de los pasos catalíticos del empalme. [ 3 ]

Prp24 RRM 1 y 2

Función biológica

El proceso de formación del espliceosoma implica la asociación de las ribonucleoproteínas U4 y U6 (snRNP) para formar una di-snRNP en el núcleo celular . Esta di-snRNP recluta a otra ribonucleoproteína ( U5 ) para convertirse en una tri-snRNP. Posteriormente, U6 debe disociarse de U4 para unirse a U2 y activarse catalíticamente. Una vez completado el empalme, U6 debe disociarse del espliceosoma y unirse nuevamente a U4 para reiniciar el ciclo.

Se ha demostrado que Prp24 promueve la unión de los snRNP U4 y U6. La eliminación de Prp24 resulta en la acumulación de U4 y U6 libres, y la posterior adición de Prp24 regenera U4/U6 y reduce la cantidad de U4 y U6 libres. [ 4 ] El snRNA U6 desnudo es muy compacto y tiene poco espacio para formar pares de bases con otros ARN. Sin embargo, cuando el snRNP U6 se asocia con proteínas como Prp24, la estructura es mucho más abierta, lo que facilita la unión a U4. [ 5 ] Prp24 no está presente en el dúplex U6/U4 en sí, y se ha sugerido que Prp24 debe abandonar el complejo para que se formen los pares de bases adecuados. [ 6 ] [ 7 ] También se ha sugerido que Prp24 puede desempeñar un papel en la desestabilización de U4/U6 para que U6 empareje bases con U2. [ 8 ]

Estructura

Prp 24 RRM 3

Prp24 tiene un peso molecular de 50 kDa y se ha demostrado que contiene cuatro motivos de reconocimiento de ARN (RRM) y una secuencia conservada de 12 aminoácidos en el extremo C. [ 9 ] [ 10 ] Se ha demostrado que los RRM 1 y 2 son importantes para la unión de alta afinidad de U6, mientras que los RRM 3 y 4 se unen a sitios de menor afinidad en U6. [ 11 ] Los tres primeros RRM interactúan extensamente entre sí y contienen pliegues canónicos que contienen una lámina beta de cuatro hebras y dos hélices alfa . La superficie electropositiva de los RRM 1 y 2 es un dominio de hibridación de ARN , mientras que la hendidura entre los RRM 1 y 2, incluida la cara de la lámina beta del RRM2, es un sitio de unión de ARN específico de secuencia. [ 1 ] El motivo C-terminal es necesario para la asociación con las proteínas LSm y contribuye a la unión del sustrato (U6) y no a la velocidad catalítica del empalme . [ 10 ]

U6 snRNP con las proteínas Prp24 y LSm asociadas.

Interacciones

Prp24 interactúa con el ARNsn U6 a través de sus RRM. Se ha demostrado mediante pruebas de modificación química que los nucleótidos 39-57 de U6 (40-43 en particular) [ 5 ] participan en la unión a Prp24. [ 12 ]

Las proteínas LSm se encuentran en una configuración consistente en el ARN U6. [ 9 ] Se ha propuesto que las proteínas LSm y Prp24 interactúan tanto física como funcionalmente [ 6 ] y el motivo C-terminal de Prp24 es importante para esta interacción. [ 10 ] La unión de Prp24 a U6 se ve potenciada por la unión de las proteínas Lsm a U6, al igual que la unión de U4 y U6. [ 13 ] Mediante microscopía electrónica se reveló que Prp24 puede interactuar con el anillo de la proteína LSm en LSm2. [ 9 ]

Homólogos

Prp24 tiene un homólogo humano , SART3 . SART3 es un antígeno de rechazo tumoral (SART3 significa " antígeno de carcinoma de células escamosas reconocido por células T, gen 3 " ). Los RRM 1 y 2 en levadura son similares a los RRM en SART3 humano. [ 1 ] [ 11 ] El dominio C-terminal también está altamente conservado desde la levadura hasta los humanos. [ 14 ] Esta proteína, al igual que Prp24, interactúa con las proteínas LSm [ 9 ] [ 15 ] para el reciclaje de U6 en la snRNP U4/U6. Se ha propuesto que SART3 dirige U6 a un cuerpo de Cajal o una inclusión nuclear como el sitio de ensamblaje de la snRNP U4/U6 . [ 15 ] SART3 se encuentra en el cromosoma 12 , y una mutación es probablemente la causa de la porokeratosis actínica superficial diseminada . [ 16 ]

Referencias

  1. 1 2 3 Bae, E.; et  al. (2007). "Estructura e interacciones de los tres primeros motivos de reconocimiento de ARN del factor de empalme Prp24" . Journal of Molecular Biology . 367 (5): 1447– 1458. doi : 10.1016/j.jmb.2007.01.078 . PMC 1939982. PMID 17320109 .  
  2. ↑ Vijayraghavan, U.; Company, M.; Abelson, J. (1989). "Aislamiento y caracterización de mutantes de empalme de pre-ARNm de Saccharomyces cerevisiae " . Genes & Development . 3 (8): 1206– 1216. doi : 10.1101/gad.3.8.1206 . PMID 2676722 . 
  3. ↑ Shannon, KW; Guthrie, C. (1991). "Los supresores de la mutación del ARNsn U4 definen una nueva proteína snRNP U6 con motivos de unión al ARN" . Genes & Development . 5 (5): 773– 785. doi : 10.1101/gad.5.5.773 . PMID 1827420 . 
  4. ↑ Raghunathan, PL; Guthrie, CA (1998). "Factor de reciclaje del espliceosoma que vuelve a unir las partículas de ribonucleoproteína nuclear pequeña U4 y U6". Science . 279 (5352): 857– 860. Bibcode : 1998Sci...279..857R . doi : 10.1126/science.279.5352.857 . PMID 9452384 . 
  5. 1 2 Karaduman, R.; et al. (2006). "Estructura del ARN e interacciones ARN-proteína en snRNP U6 de levadura purificadas". Journal of Molecular Biology . 356 (5): 1248– 1262. doi : 10.1016/j.jmb.2005.12.013 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E5F7-6 . PMID 16410014 .  
  6. 1 2 Vidal, VP; et al. (1995). "Caracterización de las interacciones proteína-ARNsn U6" . RNA . 5 (11) S1355838299991355: 1470– 1481. doi : 10.1017/S1355838299991355 . PMC 1369868. PMID 10580475 .   
  7. ↑ Jandrositz, A.; Guthrie, A. (1995). "Evidencia de un sitio de unión de Prp24 en el ARNsn U6 y en un posible intermedio en el apareamiento de los ARNsn U6 y U4" . The EMBO Journal . 14 (4): 820– 832. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07060.x . PMC 398149. PMID 7882985 .  
  8. ↑ Vidaver, RM; Fortner, DM; Loos-Austin, LS; Brow, DA (1999). "Múltiples funciones de la proteína de empalme Prp24 de Saccharomyces cerevisiae en reordenamientos estructurales del ARN U6" . Genetics . 153 ( 3): 1205– 1218. doi : 10.1093/genetics/153.3.1205 . PMC 1460831. PMID 10545453 .  
  9. 1 2 3 4 Karaduman, R.; et al. (2008). "Estructura de las snRNP U6 de levadura: Disposición de Prp24p y el complejo LSm revelada por microscopía electrónica" . RNA . 14 ( 12): 1– 10. doi : 10.1261/rna.1369808 . PMC 2590955. PMID 18971323 .   
  10. 1 2 3 Rader, SD; Guthrie, C. (2002). "Un motivo de interacción Lsm conservado en Prp24 requerido para la formación eficiente de di-snRNP U4/U6" . RNA . 8 ( 11): 1378– 1392. doi : 10.1017/S1355838202020010 . PMC 1370345. PMID 12458792 .  
  11. 1 2 Kwan, SS; Brow, DA (2005). "Los motivos de reconocimiento de ARN N- y C-terminales del factor de empalme Prp24 tienen funciones distintas en la unión al ARN U6" . RNA . 11 ( 5): 808– 820. doi : 10.1261/rna.2010905 . PMC 1370765. PMID 15811912 .  
  12. ↑ Ghetti, A.; Company, M.; Abelson, J. (1995). "Especificidad de la unión de Prp24 al ARN: un papel para Prp24 en la interacción dinámica de los snRNA U4 y U6" . RNA . 1 ( 2): 132– 145. PMC 1369067. PMID 7585243 .  
  13. ↑ Ryan, DE; Stevens, SW; Abelson, J. (2002). "Los dominios 5' y 3' del ARNsn U6 de levadura: las proteínas Lsm facilitan la unión de la proteína Prp24 a la región del telestem U6" . RNA . 8 ( 8): 1011– 1033. doi : 10.1017/S1355838202026092 . PMC 1370313. PMID 12212846 .  
  14. ↑ Bell, M.; et al. (2002). "p110, una nueva proteína U6 snRNP humana y factor de reciclaje de U4/U6 snRNP" . The EMBO Journal . 21 (11): 2724– 2735. doi : 10.1093/emboj/21.11.2724 . PMC 126028. PMID 12032085 .   
  15. 1 2 Stanek, D.; et al. (2003). "Orientación del factor de ensamblaje de RNP nuclear pequeño U4/U6 SART3/p110 a los cuerpos de Cajal" . Journal of Cell Biology . 160 (4): 505– 516. doi : 10.1083/jcb.200210087 . PMC 2173746. PMID 12578909 .   
  16. ↑ "OMIM - POROKERATOSIS, DISSEMINATED SUPERFICIAL ACTINIC, 1; DSAP1" . Consultado el 5 de abril de 2009 .
  • Ciencias Biológicas en la Universidad de Lancaster Explicación del empalme del pre-ARNm