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Articulo de referencia

RFX1

El factor regulador de clase II del MHC, RFX1, es una proteína que, en humanos, está codificada por el gen RFX1 ubicado en el brazo corto del cromosoma 19. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Est...

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El factor regulador de clase II del MHC, RFX1, es una proteína que, en humanos, está codificada por el gen RFX1 ubicado en el brazo corto del cromosoma 19. [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Estructura

El gen RFX1 pertenece a la familia de genes del factor regulador X (RFX), que codifica factores de transcripción que contienen cinco dominios conservados, incluyendo un dominio de unión al ADN de hélice alada , altamente conservado y ubicado centralmente, así como un dominio de dimerización ubicado en la región C-terminal de la secuencia. [ 8 ] Aparte de los cinco dominios conservados, las proteínas RFX divergen significativamente. Los dominios de unión al ADN y de dimerización de las proteínas de la familia RFX no muestran similitudes con otros dominios con las mismas funciones en otras proteínas. [ 6 ]

Distribución de las especies

La familia de proteínas RFX se conserva en S. pombe , S. cerevisiae , C. elegans , ratones y humanos. [ 9 ] Se conocen ocho proteínas RFX en humanos, dos en moscas de la fruta, una en C. elegans , nueve en peces, [ 10 ] y una en cada una de las dos especies de levadura. [ 9 ] [ 11 ]

Función

La proteína codificada por este gen está estructuralmente relacionada con los factores reguladores X2 , X3 , X4 y X5 . Es un activador transcripcional que puede unirse al ADN como monómero o como heterodímero con los miembros de la familia RFX X2, X3 y X5, pero no con X4. Esta proteína se une a las Xboxes de los genes MHC de clase II y es esencial para su expresión. Además, puede unirse a una repetición invertida que es necesaria para la expresión de los genes del virus de la hepatitis B. [ 7 ] Las proteínas RFX fueron clonadas y caracterizadas originalmente debido a su alta afinidad por una secuencia promotora cis-activa, llamada Xbox, que se encuentra en todos los genes MHC de clase II. [ 6 ]

Se ha observado que los niveles de ARNm que codifican esta proteína, así como RFX2 y RFX3, están constantemente elevados en los testículos y son variables en otros tejidos del cuerpo. [ 6 ]

RFX1 contiene una secuencia C-terminal sin homología aparente con otras proteínas RFX. Esta cola C-terminal contiene una región ácida que se cree que facilita el paso a través de la membrana nuclear. Se postulan dos funciones principales para este dominio: una contribución a la señal de localización nuclear (SLN) y la regulación negativa, contradictoria, de la unión al ADN y la asociación nuclear. Estas dos funciones se identificaron originalmente mediante mutaciones de secuencia y fusiones traslacionales con gfp ( proteína fluorescente verde ) y aún deben confirmarse. [ 12 ]

Interacciones

Se ha demostrado que RFX1 interactúa con el gen Abl . [ 9 ]

Referencias

  1. 1 2 3 ENSG00000288283 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000132005, ENSG00000288283 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031706 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Pugliatti L, Derre J, Berger R, Ucla C, Reith W, Mach B (septiembre de 1992). "Los genes de los factores reguladores RFX1 y RFX2 de la clase II del MHC se localizan en el brazo corto del cromosoma 19" . Genomics . 13 (4): 1307–10 . doi : 10.1016/0888-7543(92)90052-T . PMID 1505960 . 
  6. 1 2 3 4 Reith W, Ucla C, Barras E, Gaud A, Durand B, Herrero-Sanchez C, Kobr M, Mach B (febrero de 1994). "RFX1, un transactivador del potenciador I del virus de la hepatitis B, pertenece a una nueva familia de proteínas de unión al ADN homodiméricas y heterodiméricas" . Mol Cell Biol . 14 (2): 1230– 44. doi : 10.1128/mcb.14.2.1230 . PMC 358479. PMID 8289803 .  
  7. 1 2 "Gen Entrez: factor regulador RFX1 X, 1 (influye en la expresión de HLA clase II)" .
  8. ↑ Emery P, Durand B, Mach B, Reith W (marzo de 1996). "Proteínas RFX, una nueva familia de proteínas de unión al ADN conservadas en el reino eucariota" . Nucleic Acids Res . 24 (5): 803–7 . doi : 10.1093 / nar/24.5.803 . PMC 145730. PMID 8600444 .  
  9. 1 2 3 Agami R, Shaul Y (abril de 1998). "La actividad quinasa de c-Abl, pero no la de v-Abl, se potencia mediante la interacción directa con RFXI, una proteína que se une a los potenciadores de varios virus y genes regulados por el ciclo celular" . Oncogene . 16 (14): 1779–88 . doi : 10.1038/sj.onc.1201708 . PMID 9583676 . 
  10. ↑ Sugiaman-Trapman D, Vitezic M, Jouhilahti EM, Mathelier A, Lauter G, Misra S, Daub CO, Kere J, Swoboda P (2018-03-06). " Caracterización de la familia de factores de transcripción RFX humanos mediante análisis de genes reguladores y diana" . BMC Genomics . 19 (1) 181. doi : 10.1186/s12864-018-4564-6 . PMC 5838959. PMID 29510665 .  
  11. ↑ Aftab S, Semenec L, Chu JS, Chen N (2008). "Identificación y caracterización de nuevos factores de transcripción RFX específicos de tejido humano" . BMC Evol. Biol . 8 (1) 226. Bibcode : 2008BMCEE...8..226A . doi : 10.1186/1471-2148-8-226 . PMC 2533330. PMID 18673564 .  
  12. ↑ Katan-Khaykovich Y, Shaul Y (mayo de 2001). "Importación nuclear y actividad de unión al ADN de RFX1. Evidencia de un mecanismo autoinhibitorio" . Eur. J. Biochem . 268 (10): 3108–16 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02211.x . PMID 11358531 . 

Lecturas adicionales

  • Herrero Sanchez C, Reith W, Silacci P, Mach B (1992). "El defecto de unión al ADN observado en mutantes reguladores de clase II del complejo mayor de histocompatibilidad afecta solo a un miembro de una familia de complejos que se unen a las cajas X de los promotores de clase II" . Mol . Cell. Biol . 12 (9): 4076–83 . doi : 10.1128/mcb.12.9.4076 . PMC 360302. PMID 1508204 .  
  • Reith W, Herrero-Sanchez C, Kobr M, et  al. (1991). "El factor regulador RFX de la clase II del MHC tiene un dominio de unión al ADN novedoso y un dominio de dimerización funcionalmente independiente" . Genes Dev . 4 (9): 1528– 40. doi : 10.1101/gad.4.9.1528 . PMID 2253877 . 
  • Sáfrány G, Perry RP (1993). "El factor de transcripción RFX1 ayuda a controlar el promotor del gen rpL30 que codifica la proteína ribosómica del ratón mediante la unión a su elemento alfa". Gene . 132 (2): 279–83 . doi : 10.1016/0378-1119(93)90208-K . PMID 8224874 . 
  • Siegrist CA, Durand B, Emery P, et  al. (1993). "RFX1 es idéntico al factor potenciador C y funciona como un transactivador del potenciador del virus de la hepatitis B" . Mol . Cell. Biol . 13 (10): 6375–84 . doi : 10.1128/mcb.13.10.6375 . PMC 364696. PMID 8413236 .  
  • Emery P, Durand B, Mach B, Reith W (1996). "Proteínas RFX, una nueva familia de proteínas de unión al ADN conservadas en el reino eucariota" . Nucleic Acids Res . 24 (5): 803–7 . doi : 10.1093/nar/24.5.803 . PMC 145730. PMID 8600444 .  
  • Doyle J, Hoffman S, Ucla C, et  al. (1996). "Ubicaciones de genes humanos y de ratón que codifican las proteínas de los factores de transcripción RFX1 y RFX2" . Genomics . 35 (1): 227–30 . doi : 10.1006/geno.1996.0343 . PMID 8661125 . 
  • Katan-Khaykovich Y, Shaul Y (1998). "RFX1, una proteína de unión al ADN con un dominio de dimerización dividido, genera complejos alternativos" . J. Biol. Chem . 273 (38): 24504–12 . doi : 10.1074/jbc.273.38.24504 . PMID 9733744 . 
  • Iwama A, Pan J, Zhang P, et  al. (1999). "Las proteínas RFX diméricas contribuyen a la actividad y especificidad de linaje del promotor alfa del receptor de interleucina-5 a través de dominios de activación y represión" . Mol . Cell. Biol . 19 (6): 3940– 50. doi : 10.1128/mcb.19.6.3940 . PMC 104353. PMID 10330134 .  
  • Zajac-Kaye M, Ben-Baruch N, Kastanos E, et  al. (2000). "Inducción de los polipéptidos MIBP1 y RFX1 que se unen al intrón de Myc durante la diferenciación de células hematopoyéticas mediada por ácido retinoico" . Biochem . J. 345. 345 (3): 535– 41. doi : 10.1042/0264-6021:3450535 . PMC 1220788. PMID 10642512 .  
  • Morotomi-Yano K, Yano K, Saito H, et  al. (2002). "El factor regulador humano X 4 (RFX4) es una proteína dimérica de unión al ADN específica de los testículos que coopera con otros miembros humanos de RFX" . J. Biol. Chem . 277 (1): 836–42 . doi : 10.1074/jbc.M108638200 . PMID 11682486 . 
  • Sengupta PK, Fargo J, Smith BD (2002). "La familia RFX interactúa en el sitio de inicio del colágeno (COL1A2) y reprime la transcripción" . J. Biol. Chem . 277 (28): 24926–37 . doi : 10.1074/jbc.M111712200 . PMID 11986307 . 
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  • Maijgren S, Sur I, Nilsson M, Toftgård R (2004). "Participación de las proteínas RFX en la activación transcripcional desde un elemento potenciador sensible a Ras". Arch . Dermatol. Res . 295 (11): 482–9 . doi : 10.1007/s00403-004-0456-5 . PMID 15024578. S2CID 2408607 .  
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et  al. (2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .  

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .