Articulo de referencia

motivo RG/RGG

El motivo arginina-glicina o arginina-glicina-glicina ( RG/RGG ) es una secuencia repetitiva de aminoácidos que se encuentra comúnmente en las proteínas de unión a ARN (RBP). La...

El motivo arginina-glicina o arginina-glicina-glicina ( RG/RGG ) es una secuencia repetitiva de aminoácidos que se encuentra comúnmente en las proteínas de unión a ARN (RBP). Las regiones RGG en las proteínas se definen como dos o más secuencias RG/RGG dentro de un segmento de 30 aminoácidos. [ 1 ] Inicialmente denominada caja RGG , confiere a una proteína la capacidad de unirse a moléculas de ARNm de doble cadena . [ 2 ] El motivo RGG se ha observado en proteínas de al menos 12 especies animales, incluidos los humanos. [ 3 ]

Función bioquímica

Los motivos RGG participan principalmente en la mediación de las interacciones proteína-ARN . Las cargas positivas de los residuos de arginina promueven interacciones electrostáticas con las moléculas de ARNm. La composición y estructura de la cadena lateral de la arginina también pueden permitir interacciones específicas con otras moléculas, a diferencia de otros aminoácidos con carga positiva como la lisina y la histidina. [ 4 ] Los residuos de glicina añaden flexibilidad a la estructura peptídica y promueven su tendencia a formar regiones intrínsecamente desordenadas . El motivo RGG también puede impulsar la separación de fases líquido-lípido de las proteínas tanto dentro de las células como in vitro. [ 5 ] [ 6 ]

Usos sintéticos

Los investigadores han buscado crear condensados ​​con funciones novedosas para su uso en ingeniería celular y metabólica . Se han utilizado proteínas diseñadas sintéticamente que contienen motivos RGG repetitivos para formar gotas con propiedades ajustables en células e in vitro. [ 7 ] [ 8 ]

Proteínas notables que contienen RGG

Las proteínas que contienen el motivo RGG son el segundo grupo más abundante de RBP en el genoma humano. [ 9 ] [ 10 ] Están involucradas en varias funciones de metabolismo, exportación y traducción del ARN.

Referencias

  1. Chowdhury (2023). "Las proteínas con el motivo RGG: interacciones, funciones y regulaciones" . WIREs RNA . 14 (1) e1748. doi : 10.1002/wrna.1748 . PMC 9718894. PMID 35661420 .  
  2. Kiledjian (1992). " Estructura primaria y actividad de unión de la proteína hnRNP U: unión al ARN a través de la caja RGG" . EMBO J. 11 ( 7): 2655–2664 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05331.x . PMC 556741. PMID 1628625 .  
  3. Qian (2022). "Condensados ​​de proteínas sintéticas para ingeniería celular y metabólica". Nat. Chem. Biol . 18 (12): 1330– 1340. doi : 10.1038/s41589-022-01203-3 . PMID 36400990 . 
  4. Takahama (2011). "Identificación de la proteína del sarcoma de Ewing como una proteína de unión a ADN y ARN con estructura G-cuádruplex". FEBS J. 278 ( 6): 988–998 . doi : 10.1111/j.1742-4658.2011.08020.x . PMID 21244633 . 
  5. Qian (2022). "Condensados ​​de proteínas sintéticas para ingeniería celular y metabólica". Nat. Chem. Biol . 18 (12): 1330– 1340. doi : 10.1038/s41589-022-01203-3 . PMID 36400990 . 
  6. Robinson (2023). "Orgánulos sin membrana expresados ​​sin células secuestran ARN en células sintéticas". bioRxiv 10.1101/2023.04.03.535479 . 
  7. Schuster (2018). "Separación de fases proteicas controlable y reclutamiento modular para formar orgánulos sin membrana con capacidad de respuesta" . Nat Commun . 9 (1) 2985. Bibcode : 2018NatCo...9.2985S . doi : 10.1038/s41467-018-05403-1 . PMC 6065366. PMID 30061688 .  
  8. Dai (2023). "Ingeniería de condensados ​​biomoleculares sintéticos" . Nat Rev Bioeng . 1 (7): 466– 480. doi : 10.1038/s44222-023-00052-6 . PMC 10107566. PMID 37359769 .  
  9. Ozdilek (2017). "Los dominios RGG/RG intrínsecamente desordenados median la especificidad degenerada en la unión al ARN" . Nucleic Acids Res . 45 (13): 7984–7996 . doi : 10.1093/nar/gkx460 . PMC 5570134. PMID 28575444 .  
  10. Hentze (2018). "Un nuevo y valiente mundo de proteínas de unión al ARN" (PDF) . Nat. Rev. Mol. Cell Biol . 19 (5): 327– 341. Bibcode : 2018NRMCB..19..327H . doi : 10.1038/nrm.2017.130 . PMID 29339797 . 
  11. Jong (1987). "Proteína SSB1 de Saccharomyces cerevisiae y su relación con la proteína de unión al ARN nucleolar". Mol. Cell. Biol . 19 : 2947–2955 .
  12. Bossie (1992). " Una proteína nuclear mutante con similitud a las proteínas de unión al ARN interfiere con la importación nuclear en levaduras" . Mol. Biol. Cell . 3 (8): 875– 893. doi : 10.1091/mbc.3.8.875 . PMC 275646. PMID 1392078 .  
  13. Flach (1994). " Una proteína de unión a ARN de levadura se desplaza entre el núcleo y el citoplasma" . Mol. Cell. Biol . 14 (12): 8399– 8407. doi : 10.1128/mcb.14.12.8399-8407.1994 . PMC 359379. PMID 7969175 .  
  14. Iost (1999). "Ded1p, una proteína DEAD-box necesaria para la iniciación de la traducción en Saccharomyces cerevisiae, es una helicasa de ARN" . J. Biol. Chem . 274 (25): 17677– 17683. doi : 10.1074/jbc.274.25.17677 . PMID 10364207 . 
  15. Ashley (1993). "Proteína FMR1: dominios conservados de la familia RNP y unión selectiva al ARN". Science . 263 (5133): 563– 566. Bibcode : 1993Sci...262..563A . doi : 10.1126/science.7692601 . PMID 7692601 . 
  16. Crozat (1993). "Fusión de CHOP a una nueva proteína de unión a ARN en el liposarcoma mixoide humano". Nature . 363 (6430): 640– 644. Bibcode : 1993Natur.363..640C . doi : 10.1038/363640a0 . PMID 8510758 . 
  17. Baechtold (1999). "La proteína humana de apareamiento de ADN de 75 kDa es idéntica a la prooncoproteína TLS/FUS y es capaz de promover la formación de bucles D" . J. Biol. Chem . 274 (48): 34337– 34342. doi : 10.1074/jbc.274.48.34337 . PMID 10567410 . 
  18. Elbaum-Garfinkle (2015). "La proteína LAF-1 del gránulo P desordenado impulsa la separación de fases en gotas con viscosidad y dinámica ajustables" . Proc . Natl. Acad. Sci . 112 (23): 7189– 7194. Bibcode : 2015PNAS..112.7189E . doi : 10.1073/pnas.1504822112 . PMC 4466716. PMID 26015579 .