ARN Rsa

Los ARN Rsa son ARN no codificantes que se encuentran en la bacteria Staphylococcus aureus . El nombre común proviene de su descubrimiento y no implica homología . Los análisis bioinformáticos identificaron las 16 familias de ARN Rsa denominadas RsaA-K y RsaOA-OG. ^{[ 1 ] [ 2 ]} Otros, RsaOH-OX, se encontraron gracias a un enfoque RNómico. ^{[ 3 ]} Aunque los ARN mostraron patrones de expresión variables, se demostró que muchos de los ARN recién descubiertos eran independientes de Hfq y la mayoría portaba un motivo rico en C (UCCC). ^{[ 1 ]}

Reprime la traducción del regulador transcripcional MgrA al unirse a su ARNm, mejora la formación de biopelículas y disminuye la virulencia bacteriana. ^{[ 4 ]} Otros ARNm, incluidas las enzimas similares a SsaA involucradas en el metabolismo del peptidoglicano y la proteína antiinflamatoria secretada FLIPr, fueron validados como objetivos directos de RsaA. ^{[ 5 ]}

RsaE se encuentra en otros miembros del género Staphylococcus, como Staphylococcus epidermidis y Staphylococcus saprophyticus , y es el único ARN Rsa que se encuentra fuera de este género, en Macrococcus caseolyticus y Bacillus . En Bacillus subtilis , RsaE se había identificado previamente como ncr22. ^{[ 8 ] [ 9 ]} RsaE también se encuentra consistentemente corriente abajo de PepF , que codifica la oligoendopeptidasa F. La función de RsaE se descubrió mediante análisis de eliminación génica y sobreexpresión génica; se encontró que regula la expresión de varias enzimas involucradas en el metabolismo a través de la unión antisentido de su ARNm . ^{[ 1 ] [ 3 ] [ 10 ]}

Se demostró que RsaE está regulado por la presencia de óxido nítrico (NO). En Bacillus subtilis, controla la expresión de genes con funciones relacionadas con el estrés oxidativo y las reacciones de oxidación-reducción, y fue renombrado como RoxS (por sus siglas en inglés, relacionado con el estrés oxidativo). ^{[ 11 ]}

En la especie S. aureus, RsaF se encuentra en la misma región intergénica que RsaE y se solapa con el extremo 3′ de RsaE en aproximadamente 20 pb. A diferencia de RsaE, RsaF y su gen corriente arriba solo se han identificado en la especie S. aureus . ^{[ 1 ]}

RsaK se encuentra en la secuencia líder del ARNm de glcA , que codifica una enzima involucrada en el sistema de fosfotransferasa específica de glucosa . RsaK también contiene un sistema antiterminador ribonucleico conservado , reconocido por la proteína GclT. ^{[ 12 ]}

Se cree que RsaOG ^{[ 2 ],} también renombrado RsaI ^{[ 1 ]} , ajusta con precisión la regulación de los mecanismos de toxinas o invasión en S. aureus mediante mecanismos de acción trans . Su estructura secundaria contiene un pseudonudo formado entre dos secuencias no apareadas altamente conservadas. ^{[ 6 ]}

Se encontró que RsaD, EH e I se expresaban en altos niveles en S. aureus . Los niveles de expresión de otros ARN Rsa variaron bajo diversas condiciones ambientales; por ejemplo, RsaC se indujo por choque térmico y RsaA se induce en respuesta al estrés osmótico . ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]}

Los genes RsaE y RsaF se superponen en especies de S. aureus , pero parecen tener patrones de expresión opuestos. ^{[ 1 ]} Se propone que la interferencia transcripcional debida a una superposición entre un motivo de reconocimiento de σ ^A y un posible sitio de unión de σ ^B es un mecanismo que causa la expresión diferencial de los dos transcritos. ^{[ 1 ] [ 13 ]}

• RsaOG