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Articulo de referencia

Riboswitch SAM-SAH

El riboswitch SAM-SAH es una estructura de ARN conservada en ciertas bacterias que se une a la S -adenosilmetionina (SAM) y a la S -adenosilhomocisteína (SAH) y, por lo tanto, s...

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El riboswitch SAM-SAH es una estructura de ARN conservada en ciertas bacterias que se une a la S -adenosilmetionina (SAM) y a la S -adenosilhomocisteína (SAH) y, por lo tanto, se presume que es un riboswitch . [ 1 ] Los riboswitches SAM-SAH no comparten ninguna semejanza estructural aparente con los riboswitches conocidos que se unen a SAM o SAH. Las afinidades de unión para ambos compuestos son similares, pero la unión para SAH es al menos algo más fuerte. Los riboswitches SAM-SAH se encuentran exclusivamente en Rhodobacterales , un orden de alfaproteobacterias . Siempre se encuentran en las regiones 5' no traducidas aparentes de los genes metK , que codifican la enzima ( metionina adenosiltransferasa ) que sintetiza SAM.

Dada esta asociación genética, se propuso que los ribointerruptores SAM-SAH probablemente funcionan como ARN sensores de SAM. Los ribointerruptores SAM-SAH son relativamente pequeños entre los ribointerruptores conocidos, lo que podría estar relacionado con su incapacidad para discriminar contra SAH. Sin embargo, la capacidad de rechazar SAH como ligando podría no ser importante en condiciones fisiológicas, ya que la concentración celular de SAM es mayor. [ 2 ]

Una región de la estructura conservada de los ribointerruptores SAM-SAH incluye una secuencia Shine-Dalgarno predicha ( sitio de unión al ribosoma ) de los genes metK posteriores . Estos nucleótidos son necesarios para una unión óptima al ligando y podrían formar un pseudonudo con el bucle terminal dentro de la estructura principal de tallo-bucle . La oclusión de la secuencia Shine-Dalgarno podría ser el mecanismo mediante el cual los ribointerruptores SAM-SAH regulan la expresión de los genes posteriores.

La estructura 3D de un riboswitch SAM-SAH ha sido determinada por dos grupos que trabajan de forma independiente. [ 3 ] [ 4 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et  al. (marzo de 2010). "La genómica comparativa revela 104 ARN estructurados candidatos de bacterias, arqueas y sus metagenomas" . Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186 / gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571. PMID 20230605 .  
  2. ↑ Ueland PM (septiembre de 1982). "Aspectos farmacológicos y bioquímicos de la S-adenosilhomocisteína y la S-adenosilhomocisteína hidrolasa". Pharmacol. Rev. 34 ( 3): 223– 253. PMID 6760211 . 
  3. ↑ Weickhmann AK, Keller H, Wurm JP, Strebitzer E, Juen MA, Kremser J, Weinberg Z, Kreutz C, Duchardt-Ferner E, Wöhnert J (marzo de 2019). "La estructura del riboswitch de unión a SAM/SAH" . Nucleic Acids Res . 47 (5): 2654–2665 . doi : 10.1093/nar/ gky1283 . PMC 6411933. PMID 30590743 .  
  4. ↑ Huang L, Liao TW, Wang J, Ha T, Lilley DM (julio de 2020). "Estructura cristalina y plegamiento inducido por ligando del riboswitch SAM/SAH" . Nucleic Acids Res . 48 (13): 7545–7556 . doi : 10.1093 / nar/gkaa493 . PMC 7367207. PMID 32520325 .  
  • Página del riboswitch SAM/SAH en Rfam