Articulo de referencia

SMC5

La proteína 5 de mantenimiento estructural de los cromosomas es una proteína codificada por el gen SMC5 en humanos. [ 5 ] [ 6 ] El mantenimiento estructural de los cromosomas, m...

La proteína 5 de mantenimiento estructural de los cromosomas es una proteína codificada por el gen SMC5 en humanos. [ 5 ] [ 6 ]

El mantenimiento estructural de los cromosomas, mecanismos subyacentes complejos involucrados en la dinámica de la cromatina, es desconocido, y los descubrimientos están arrojando luz sobre las diversas funciones. [ 7 ] El complejo SMC media interacciones de largo alcance que permiten el plegamiento de orden superior de la cromatina en la interfase. El complejo SMC tiene una actividad ATPasa , una kleisina conservada y subunidades reguladoras. [ 7 ] Los complejos de proteínas SMC están involucrados en la reparación del ADN, vías transcripcionales, regulación de la segregación cromosómica e inmunidad en Arabidopsis . En eucariotas, el mantenimiento estructural de los cromosomas consiste en cohesina (SMC1 y SMC3), condensina (SMC2 y SMC4) y complejos SMC5/6.

Estructura

El complejo Smc5/6 fue descubierto en la levadura de fisión. RAD18 (SMC6), el gen de daño al ADN en la levadura de fisión, también codifica una proteína similar a SMC y forma un complejo heterodimérico con la proteína Spr18 (SMC5). [ 8 ] [ 9 ] En la levadura, el complejo SMC5/6 tiene subunidades que consisten en SMC5, SMC6 y seis proteínas de mantenimiento no estructural de cromosomas (NSE). Las subunidades Nse1-Nse3-Nse4 unen la cabeza Smc5 y Smc6 y permiten la unión al ADN. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ]

Está implicado en el mecanismo de alargamiento alternativo de los telómeros en el cáncer. [ 13 ] [ 14 ]

subunidades Nse

Esta imagen muestra la ubicación de las proteínas Nse a lo largo del complejo SMC5/6 en la levadura de gemación y de fisión. No incluye la proteína Nse2, ya que su posición en el complejo aún se desconoce.

Las subunidades Nse1-Nse3-Nse4 unen las cabezas de las proteínas Smc5 y Smc6 y permiten que el complejo se una al ADN. Nse5 y Nse6 forman un subcomplejo que se localiza en la cabeza del complejo SMC5/6 en la levadura Saccharomyces cerevisiae y en las bisagras del complejo SMC5/6 en la levadura de fisión Schizosaccharomyces pombe . El subcomplejo Nse5/6 es necesario para la replicación de S. cerevisiae , pero no se ha caracterizado como esencial en S. pombe . Existen proteínas ortólogas a Nse5-Nse6 en otros eucariotas, concretamente ASAP1-SNI1 en Arabidopsis thaliana y SLF1-SLF2 en humanos, que se cree que tienen una función similar a la de sus homólogos Nse. Se desconoce la localización de SLF1 y SLF2 en el complejo SMC5/6 humano. [ 15 ] [ 16 ]

Localización en diferentes organismos

El complejo Smc5/6 posee métodos de localización que no están altamente conservados. En humanos, el complejo se localiza en secuencias de ADN viral mediante los factores de localización SMC5/6 1 y 2 (SLF1 y SLF2), lo que contribuye a la resistencia viral. [ 17 ] En la planta A. thaliana , este heterodímero puede localizarse en roturas de doble cadena para la recombinación homóloga mediante el complejo SWI3B de la vía SWI/SNF . [ 18 ] Una vez localizado en el ADN, el complejo SCM5/6 se une de forma no específica a ~20 pares de bases de ADN. [ 19 ]

Función en la recombinación y la meiosis

Las proteínas Smc5 y Smc6 forman una estructura heterodimérica en forma de anillo y, junto con otros elementos no SMC, forman el complejo SMC-5/6. En el gusano Caenorhabditis elegans, este complejo interactúa con la helicasa HIM-6(BLM) para promover el procesamiento intermedio de la recombinación meiótica y la maduración cromosómica . [ 20 ] El complejo SMC-5/6 en los ovocitos de ratón es esencial para la formación de bivalentes competentes para la segregación durante la meiosis . [ 21 ] En humanos, un síndrome de rotura cromosómica caracterizado por una enfermedad pulmonar grave en la primera infancia está asociado con una mutación en un componente del complejo SMC-5/6. [ 22 ] Las células del paciente muestran reordenamientos cromosómicos , micronúcleos , sensibilidad al daño del ADN y recombinación homóloga defectuosa .

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000198887 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000024943 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, et al. (febrero de 1998). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. IX. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que pueden codificar proteínas grandes in vitro" . DNA Research . 5 (1): 31–39 . doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .  
  6. "Gen Entrez: mantenimiento estructural de los cromosomas 5 SMC5" .
  7. 1 2 Jeppsson K, Kanno T, Shirahige K, Sjögren C (septiembre de 2014). "El mantenimiento de la estructura cromosómica: posicionamiento y funcionamiento de los complejos SMC". Nature Reviews. Biología Celular Molecular . 15 (9): 601– 614. doi : 10.1038/nrm3857 . PMID 25145851. S2CID 23908801 .  
  8. Fousteri MI, Lehmann AR (abril de 2000). "Un nuevo complejo proteico SMC en Schizosaccharomyces pombe contiene la proteína de reparación del ADN Rad18" . The EMBO Journal . 19 (7): 1691– 1702. doi : 10.1093/emboj/19.7.1691 . PMC 310237. PMID 10747036 .  
  9. Lehmann AR, Walicka M, Griffiths DJ, Murray JM, Watts FZ, McCready S, et al. (diciembre de 1995). " El gen rad18 de Schizosaccharomyces pombe define un nuevo subgrupo de la superfamilia SMC involucrado en la reparación del ADN" . Biología Molecular y Celular . 15 (12): 7067–7080 . doi : 10.1128/mcb.15.12.7067 . PMC 230962. PMID 8524274 .   
  10. Palecek J, Vidot S, Feng M, Doherty AJ, Lehmann AR (diciembre de 2006). "El complejo de reparación del ADN Smc5-Smc6: puenteo de las cabezas Smc5-Smc6 por las subunidades KLEISIN, Nse4 y no-Kleisin" . The Journal of Biological Chemistry . 281 (48): 36952– 36959. doi : 10.1074/jbc.M608004200 . PMID 17005570 . 
  11. Zabrady K, Adamus M, Vondrova L, Liao C, Skoupilova H, Novakova M, et al. (febrero de 2016). " La asociación de la cromatina del complejo SMC5/6 depende de la unión de su subunidad NSE3 al ADN" . Nucleic Acids Research . 44 (3): 1064– 1079. doi : 10.1093/nar/gkv1021 . PMC 4756808. PMID 26446992 .   
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Lecturas adicionales

  • Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (junio de 2002). "Construcción de clones de ADNc listos para expresión para genes KIAA: curación manual de 330 clones de ADNc de KIAA". Investigación del ADN . 9 (3): 99– 106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .  
  • Taylor EM, Moghraby JS, Lees JH, Smit B, Moens PB, Lehmann AR (junio de 2001). "Caracterización de un nuevo heterodímero SMC humano homólogo al complejo Rad18/Spr18 de Schizosaccharomyces pombe" . Biología Molecular de la Célula . 12 (6): 1583–1594 . doi : 10.1091/mbc.12.6.1583 . PMC 37326. PMID 11408570 .  
  • Potts PR, Yu H (agosto de 2005). " La MMS21/NSE2 humana es una ligasa SUMO necesaria para la reparación del ADN" . Biología Molecular y Celular . 25 (16): 7021– 7032. doi : 10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005 . PMC 1190242. PMID 16055714 .  
  • Potts PR, Porteus MH, Yu H (julio de 2006). "El complejo SMC5/6 humano promueve la recombinación homóloga de cromátidas hermanas mediante el reclutamiento del complejo de cohesina SMC1/3 a las roturas de doble cadena" . The EMBO Journal . 25 (14): 3377–3388 . doi : 10.1038/sj.emboj.7601218 . PMC 1523187. PMID 16810316 .