La familia de peptidasas sedolisina ( MEROPS S53) es una familia de serina proteasas estructuralmente relacionada con la familia subtilisina (S8). Entre los miembros más conocidos de esta familia se encuentran la sedolisina ("pseudomonalisina"), presente en bacterias del género Pseudomonas , la xantomonalisina ("sedolisina-B"), la fisarolisina y la tripeptidil peptidasa I animal . También se la conoce como sedolisina o serina-carboxil peptidasa . Este grupo de enzimas presenta una variación en la tríada catalítica : a diferencia de la S8, que utiliza Ser-His-Asp, este grupo funciona con Ser-Glu-Asp, con un residuo ácido adicional de Asp en el sitio del oxianión . [ 1 ]
Su pH óptimo es de alrededor de 3. La mayoría de los miembros de la familia se producen como una proteína precursora con péptidos N-terminales ( InterPro : IPR015366 ) y, a veces, C-terminales que deben ser escindidos. [ 2 ]
miembros de la familia
Sedolisina
La sedolisina ( P42790 , pseudomonapepsina , sedolisina ) es una serina proteasa. Es secretada por Pseudomonas sp. 101. Realiza la hidrólisis de la cadena B de la insulina en -Glu 13 -Ala-, -Leu 15 -Tyr- y -Phe 25 -Tyr-, y de la angiotensina I en -Tyr 4 -Ile-. Un buen sustrato sintético es Lys-Pro-Ile-Glu-Phe-Phe(NO 2 )-Arg-Leu. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Xantomonalisina
La xantomonalisina ( Q60106 ) se encuentra en la bacteria Xanthomonas . Escinde la caseína y coagula la leche. [ 7 ] [ 8 ]
Fisarolisina
La fisarolisina ( Q8MZS4 , fisaropepsina ) es una enzima coagulante de la leche. Muestra una escisión preferencial de Gly 8 -Ser en la cadena B de la insulina con mayor rapidez, seguida de Leu 11 !Val, Cys(SO 3 H) 19 -Gly y Phe 24 -Phe. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]
Es especial porque está adaptada al frío. Fue descubierta en el moho mucilaginoso Physarum flavicomum . Proteínas similares ( InterPro : IPR017001 ) también se encuentran en arqueas. [ 14 ]
Referencias
- ↑ "Familia S53: Resumen" . MEROPS - la base de datos de peptidasas .
- ↑ Oda K (enero de 2012). "Nuevas familias de peptidasas carboxílicas: peptidasas serina-carboxílicas y peptidasas glutámicas" . Journal of Biochemistry . 151 (1): 13– 25. doi : 10.1093/jb/mvr129 . PMID 22016395 .
- ↑ Oda K, Sugitani M, Fukuhara K, Murao S (marzo de 1987). "Purificación y propiedades de una carboxiproteinasa insensible a la pepstatina de una bacteria gramnegativa". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects . 923 (3): 463– 469. doi : 10.1016/0304-4165(87)90055-9 . PMID 3548827 .
- ↑ Oda K, Nakatani H, Dunn BM (abril de 1992). "Especificidad del sustrato y propiedades cinéticas de la carboxiproteinasa insensible a la pepstatina de Pseudomonas sp. No. 101". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura de proteínas y enzimología molecular . 1120 (2): 208– 214. doi : 10.1016/0167-4838(92)90272-f . PMID 1562589 .
- ↑ Wlodawer A, Li M, Dauter Z, Gustchina A, Uchida K, Oyama H, et al. (mayo de 2001). "La carboxil proteinasa de Pseudomonas define una nueva familia de enzimas similares a la subtilisina". Nature Structural Biology . 8 (5): 442– 446. doi : 10.1038/87610 . PMID 11323721. S2CID 16793101 .
- ↑ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "Propiedades estructurales y enzimáticas de la familia de peptidasas de serina-carboxilo sedolisina" . Acta Biochimica Polonica . 50 (1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ↑ Oda K, Nakazima T, Terashita T, Suzuki KI, Murao S (1987). "Purificación y propiedades de una carboxiproteinasa insensible a S -PI(pepstatina Ac) de una bacteria Xanthomonas sp." . Agric. Biol. Chem . 51 (11): 3073– 3080. doi : 10.1271/bbb1961.51.3073 .
- ↑ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "Propiedades estructurales y enzimáticas de la familia de peptidasas de serina-carboxilo sedolisina" . Acta Biochimica Polonica . 50 (1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ↑ Henney HR, Tavana G (1982). "Purificación y algunas propiedades de una proteinasa ácida (carboxílica) intracelular de células haploides diferenciadas de Physarum flavicomum ". Exp. Mycol . 6 (2): 161– 170. doi : 10.1016/0147-5975(82)90090-1 .
- ↑ Murakami-Murofushi K, Hiratsuka A, Ohta J (1984). "Una nueva proteasa ácida de amebas haploides de Physarum polycephalum y sus cambios durante el apareamiento y la posterior diferenciación en plasmodios diploides" . Cell Struct. Funct . 9 (3): 311– 315. doi : 10.1247/csf.9.311 .
- ↑ North MJ, Whyte A (1984). "Purificación y caracterización de dos proteinasas ácidas de Dictyostelium discoideum " . J. Gen. Microbiol . 130 : 123–134 . doi : 10.1099/00221287-130-1-123 .
- ↑ Wlodawer A, Li M, Gustchina A, Oyama H, Dunn BM, Oda K (2003). "Propiedades estructurales y enzimáticas de la familia de peptidasas de serina-carboxilo sedolisina" . Acta Biochimica Polonica . 50 (1): 81– 102. doi : 10.18388/abp.2003_3716 . PMID 12673349 .
- ^ Nishii W, Ueki T, Miyashita R, Kojima M, Kim YT, Sasaki N, et al. (febrero de 2003). "La caracterización estructural y enzimática de la fisarolisina (antes fisaropepsina) demuestra que es una serina-carboxilproteasa única". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 301 (4): 1023– 1029. Código bibliográfico : 2003BBRC..301.1023N . doi : 10.1016/s0006-291x(03)00083-4 . PMID 12589815 .
- ↑ Nishii W, Kuriyama H, Takahashi K (julio de 2003). "El gen php de Physarum polycephalum codifica una peptidasa de serina-carboxilo única adaptada al frío, la fisarolisina II". FEBS Letters . 546 ( 2–3 ): 340–344 . Bibcode : 2003FEBSL.546..340N . doi : 10.1016/S0014-5793(03)00621-5 . PMID 12832065. S2CID 19197020 .
Enlaces externos
- Sedolisina en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- Fisarolisina en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- Xantomonalisina en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- CE 3.4.21