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ShelXle

El programa ShelXle [ 2 ] es una interfaz gráfica de usuario para el programa de refinamiento de estructuras SHELXL. [ 3 ] ShelXle combina un editor con resaltado de sintaxis pa...

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El programa ShelXle [ 2 ] es una interfaz gráfica de usuario para el programa de refinamiento de estructuras SHELXL. [ 3 ] ShelXle combina un editor con resaltado de sintaxis para los archivos .ins (entrada) y .res (salida) asociados a SHELXL con una visualización gráfica interactiva para la visualización de una estructura tridimensional que incluye los mapas de densidad electrónica (Fo) y densidad diferencial (Fo-Fc).

Descripción general

ShelXle puede mostrar mapas de densidad electrónica como el programa macromolecular Coot, pero está más orientado a moléculas más pequeñas. Existen varias interfaces gráficas de usuario (GUI) excelentes para el refinamiento de la estructura cristalina de moléculas pequeñas con SHELX (por ejemplo, WINGX, [ 4 ] Olex2 , [ 5 ] XSEED, [ 6 ] PLATON y SYSTEM-S, [ 7 ] y los programas XP y XSHELL de Bruker ).

ShelXle es software libre , distribuido bajo la licencia GNU LGPL. Está disponible en el sitio web de ShelXle o en SourceForge . [ 8 ] [ 9 ] Los binarios están disponibles para Windows, macOS y las distribuciones de Linux SuSE , Debian y Ubuntu , así como Arch a través de AUR . El binario para Windows se distribuye con el instalador NSIS .

Características

  • Editor con resaltado de sintaxis y autocompletado de código para las instrucciones SHELX.
  • Al hacer clic en un átomo en la vista de estructura, el cursor de texto se sitúa en la línea que contiene dicho átomo.
  • Localización de átomos en la vista de estructura desde el editor.
  • Cambiar el nombre del modo con soporte para residuos y partes desordenadas y variables libres .

Arquitectura del programa

ShelXle utiliza el framework Qt . Está escrito completamente en C++ y no utiliza ningún lenguaje de scripting . Para el refinamiento, llama al binario externo de SHELXL, que también puede ser SHELXH, SHELXLMP de George M. Sheldrick o XL de Bruker.

SHELX

SHELX [ 3 ] es desarrollado por George M. Sheldrick desde finales de la década de 1960. Las versiones más importantes son SHELX76 y SHELX97. Su desarrollo continúa, pero las nuevas versiones suelen publicarse tras diez años de pruebas. Los usuarios académicos pueden descargar los programas SHELX gratuitamente tras registrarse. [ 10 ]

  • Sitio web de ShelXle
  • Foro de soporte de ShellXle en xrayforum.co.uk
  • ShellXle en Sourceforge

Referencias

  1. ↑ "Historial de revisiones de ShelXle" . Consultado el 4 de abril de 2026 .
  2. ↑ Hübschle, Christian B.; Sheldrick, George M.; Dittrich, Birger (12 de noviembre de 2011). "ShelXle: una interfaz gráfica de usuario Qt para SHELXL" . Journal of Applied Crystallography . 44 (6): 1281– 1284. Bibcode : 2011JApCr..44.1281H . doi : 10.1107/S0021889811043202 . PMC 3246833. PMID 22477785 .  
  3. 1 2 Sheldrick, George M. (21 de diciembre de 2007). "Una breve historia de SHELX" . Acta Crystallographica Sección A. 64 ( 1): 112– 122. Bibcode : 2008AcCrA..64..112S . doi : 10.1107/S0108767307043930 . PMID 18156677 . 
  4. ↑ Farrugia, Louis J. (1 de agosto de 1999). "Paquete WinGX para cristalografía de monocristales de moléculas pequeñas". Journal of Applied Crystallography . 32 (4): 837– 838. Bibcode : 1999JApCr..32..837F . doi : 10.1107/S0021889899006020 .
  5. ↑ Dolomanov, Oleg V.; Bourhis, Luc J.; Gildea, Richard J.; Howard, Judith AK; Puschmann, Horst (24 de enero de 2009). "OLEX2: un programa completo para la resolución, refinamiento y análisis de estructuras". Journal of Applied Crystallography . 42 (2): 339– 341. doi : 10.1107/S0021889808042726 .
  6. ↑ Barbour, Leonard J. (2001). "X-Seed — Una herramienta de software para cristalografía supramolecular". J. Supramol. Chem . 1 ( 4– 6): 189– 19. doi : 10.1016/S1472-7862(02)00030-8 .
  7. ↑ Spek, Anthony L. (20 de enero de 2009). "Validación de la estructura en cristalografía química" . Acta Crystallographica Sección D. 65 ( 2): 148– 155. Bibcode : 2009AcCrD..65..148S . doi : 10.1107/S090744490804362X . PMC 2631630. PMID 19171970 .  
  8. ↑ "Página de descarga de ShelXle" . www.shelxle.org . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  9. ↑ "ShelXle" . SourceForge . Consultado el 15 de septiembre de 2021 .
  10. ↑ "Página principal de SHELX" . shelx.uni-goettingen.de . Consultado el 6 de septiembre de 2016 .
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