Ligasa

En bioquímica , una ligasa es una enzima que cataliza la unión ( ligación ) de dos moléculas mediante la formación de un nuevo enlace químico . Esto suele ocurrir a través de la hidrólisis de un pequeño grupo químico colgante en una de las moléculas, lo que generalmente resulta en la formación de nuevos enlaces C-O, C-S o C-N. Por ejemplo, la ADN ligasa puede unir dos fragmentos complementarios de ácido nucleico mediante la formación de enlaces fosfodiéster y reparar las roturas de cadena simple que se producen en el ADN de doble cadena durante la replicación.

En general, una ligasa cataliza la siguiente reacción de deshidratación, uniendo así las moléculas A y B:

A-OH + BH → A–B + H ₂ O

La nomenclatura de las ligasas es inconsistente, por lo que estas enzimas se conocen comúnmente con varios nombres diferentes. Generalmente, los nombres comunes de las ligasas incluyen la palabra "ligasa", como en el caso de la ADN ligasa , una enzima que se usa comúnmente en laboratorios de biología molecular para unir fragmentos de ADN . Sin embargo, muchos nombres comunes utilizan el término "sintetasa" o "sintasa" en su lugar, porque se utilizan para sintetizar nuevas moléculas. ^{[ 1 ]} También hay algunas ligasas que usan el nombre "carboxilasa" para indicar que la enzima cataliza específicamente una reacción de carboxilación .

Nota: la nomenclatura bioquímica a veces ha distinguido entre sintetasas y sintasas , y otras veces ha tratado las palabras como sinónimos . ^{[ 2 ]} Comúnmente, los dos términos se usan indistintamente y ambos se utilizan para describir ligasas.

Las ligasas se clasifican como EC 6 en la clasificación EC de enzimas. Las ligasas se pueden clasificar además en seis subclases:

• La EC 6.1 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-oxígeno.
• La EC 6.2 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-azufre.
• La EC 6.3 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-nitrógeno (incluida la argininosuccinato sintetasa ).
• La EC 6.4 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-carbono, como la acetil-CoA carboxilasa.
• La EC 6.5 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces éster fosfóricos , como la ADN ligasa.
• La EC 6.6 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces nitrógeno-metal, como en las quelatasas.

Algunas ligasas se asocian con membranas biológicas como proteínas de membrana periféricas o ancladas a través de una sola hélice transmembrana , ^{[ 3 ]} por ejemplo ciertas proteínas relacionadas con la ubiquitina ligasa .

La palabra ligasa utiliza formas combinadas de lig- (del verbo latino ligāre , "unir" o "atar") + -asa (que denota una enzima), dando como resultado "enzima de unión".

• ADN ligasa
• Acetil-CoA carboxilasa
• Nucleasa
• Proteasa
• ligasa de ubiquitina

• EC 6 Introducción del Departamento de Química de Queen Mary, Universidad de Londres