Hispanopedia WikiLos factores asociados a TBP ( TAF ) son proteínas que se asocian con la proteína de unión a TATA durante la iniciación de la transcripción. Forman parte del complejo proteico multimérico TFIID , factor de iniciación de la transcripción . También integran muchos otros factores, incluido SL1 . Estos factores median la formación del complejo de preiniciación de la transcripción , un paso previo a la transcripción del ADN a ARN por la ARN polimerasa II .
Los TAF tienen un dominio de plegamiento tipo histona (HFD) N-terminal característico. [ 1 ] Este dominio está implicado en la interacción por pares entre TAF específicos. [ 2 ]
Función
TFIID
TFIID desempeña un papel central en la mediación de las respuestas del promotor a diversos activadores y represores . Se une firmemente a TAFII-250 e interactúa directamente con TAFII-40. TFIID está compuesto por la proteína de unión a TATA (TBP) y varios factores asociados a TBP (TAFS). [ 3 ]
TAF forma parte del complejo TFIID e interactúa con lo siguiente:
- Activadores transcripcionales específicos
- Factores de transcripción basales
- Otros TAFII
- Secuencias de ADN específicas, por ejemplo, el elemento promotor corriente abajo o la secuencia promotora central específica del gen.
Debido a estas interacciones, contribuyen a la activación de la transcripción y a la selectividad del promotor. [ 3 ]
Algunos pares de TAF interactúan entre sí para formar "lóbulos" en TFIID. Los pares conocidos o sugeridos que existen en TFIID incluyen TAF6-TAF9, TAF4-TAF12, TAF11-13, TAF8-TAF10 y TAF3-TAF10. [ 2 ]
SL1
El factor selectivo 1 está compuesto por la proteína de unión a TATA y tres subunidades TAF (factor asociado a la proteína de unión a la caja TATA) ( TAF1A , TAF1B y TAF1C ). Estas TAF no poseen un dominio de plegamiento similar al de las histonas. [ 4 ]
Otros complejos
TAF es parte de SAGA (acetilasa SPT-ADA-GCN5) y complejos de coactivación relacionados. [ 2 ] Dichos complejos acetilan las colas de las histonas para activar genes. [ 5 ] El ser humano tiene tres complejos similares a SAGA: PCAF , TFTC (complejo que contiene TAF sin TBP) y STAGA ( acetilasa SPT3 - TAF9 - GCN5L ). PCAF (GCN5) y KAT2A (GCN5L) son dos homólogos humanos de la Gcn5 de levadura. [ 6 ]
TAF8, TAF10 y SPT7L forman un pequeño complejo TAF llamado SMAT. [ 2 ]
Estructura
El dominio N-terminal de TAF tiene un plegamiento proteico similar al de las histonas. Contiene dos hélices alfa cortas y una hélice alfa central larga. [ 1 ]
genes humanos
Firmas variadas
Los dominios TAF están distribuidos en numerosas firmas digitales:
Referencias
- 1 2 Xie X, Kokubo T, Cohen SL, Mirza UA, Hoffmann A, Chait BT, Roeder RG, Nakatani Y, Burley SK (marzo de 1996). "Similitud estructural entre TAF y el núcleo heterotetramérico del octámero de histonas". Nature . 380 (6572): 316– 22. Bibcode : 1996Natur.380..316X . doi : 10.1038/380316a0 . PMID 8598927 . S2CID 4329570 .
- 1 2 3 4 Demény MA, Soutoglou E, Nagy Z, Scheer E, Jànoshàzi A, Richardot M, Argentini M, Kessler P, Tora L (marzo de 2007). "Identificación de un pequeño complejo TAF y su papel en el ensamblaje de complejos que contienen TAF" . PLOS ONE . 2 (3): e316. Bibcode : 2007PLoSO...2..316D . doi : 10.1371/journal.pone.0000316 . PMC 1820849. PMID 17375202 .
- 1 2 Furukawa T, Tanese N (septiembre de 2000). "El ensamblaje de complejos parciales de TFIID en células de mamíferos revela actividades distintas asociadas con factores individuales asociados a la proteína de unión a la caja TATA" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (38): 29847– 56. doi : 10.1074/jbc.M002989200 . PMID 10896937 .
- ↑ Friedrich JK, Panov KI, Cabart P, Russell J, Zomerdijk JC (agosto de 2005). "El complejo TBP-TAF SL1 dirige la formación del complejo de preiniciación de la ARN polimerasa I y estabiliza el factor de unión corriente arriba en el promotor del ADNr" . The Journal of Biological Chemistry . 280 (33): 29551–8 . doi : 10.1074/jbc.M501595200 . PMC 3858828. PMID 15970593 .
- ↑ Bonnet J, Wang CY, Baptista T, Vincent SD, Hsiao WC, Stierle M, Kao CF, Tora L, Devys D (septiembre de 2014). "El complejo coactivador SAGA actúa sobre todo el genoma transcrito y es necesario para la transcripción de la ARN polimerasa II" . Genes & Development . 28 (18): 1999– 2012. doi : 10.1101/gad.250225.114 . PMC 4173158. PMID 25228644 .
- ↑ Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (octubre de 2001). "El complejo STAGA humano es un coactivador de transcripción acetilante de cromatina que interactúa con el empalme del pre-ARNm y los factores de unión al daño del ADN in vivo" . Biología Molecular y Celular . 21 (20): 6782– 95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856. PMID 11564863 .
- dominios de proteínas
