Articulo de referencia

Tet metilcitosina dioxigenasa 1

La dioxigenasa de metilcitosina de translocación diez-once 1 ( TET1 ) pertenece a la familia de enzimas TET y, en humanos, está codificada por el gen TET1. Su función, regulació...

La dioxigenasa de metilcitosina de translocación diez-once 1 ( TET1 ) pertenece a la familia de enzimas TET y, en humanos, está codificada por el gen TET1. Su función, regulación y vías metabólicas siguen siendo objeto de investigación, aunque parece estar implicada en la desmetilación del ADN y, por lo tanto, en la regulación génica [ 5 , 6 ] , pero se expresa en diferentes isoformas que pueden tener funciones distintas [ 7 , 8 ] .

Descubrimiento

TET1 se descubrió por primera vez en un paciente de 61 años con una variante rara de leucemia mieloide aguda (LMA) t(10;11)(q22;q23) como una proteína de unión de dedos de zinc (específicamente en el dominio CXXC) que se fusiona con el gen MLL. [ 9 ] Otro estudio confirmó que esta proteína era un socio de translocación de MLL en un paciente de 8 años con LMA t(10;11)(q22;q23) y la denominó Translocación Diez-Once 1. [ 10 ]

Función

TET1 cataliza la conversión de la base de ADN modificada 5-metilcitosina (5-mC) a 5-hidroximetilcitosina (5-hmC). [ 11 ]

TET1 produce 5-hmC mediante la oxidación de 5-mC de manera dependiente del hierro y del alfa-cetoglutarato . [ 12 ] Se ha propuesto que la conversión de 5-mC a 5-hmC es el paso inicial de la desmetilación activa del ADN en mamíferos. [ 12 ] Además, la degradación de TET1 ha disminuido los niveles de 5-formilcitosina (5-fC) y 5-carboxilcitosina (5-caC) tanto en cultivos celulares como en ratones. [ 12 ]

Un sitio con una base 5-hmC ya presenta una mayor actividad transcripcional, un estado denominado "desmetilación funcional". Este estado es común en neuronas postmitóticas . [ 13 ] Sin embargo, también se ha observado que inhibe la transcripción de algunos genes y se asocia con diversos represores transcripcionales, especialmente el complejo PRC2, lo que sugiere diversos modos de acción. [ 14 ] [ 15 ] [ 7 ]

TET1 podría desempeñar un papel en la extinción de la memoria (1). Los ratones knockout de TET1 muestran una extinción de la memoria notablemente deteriorada, a pesar de mantener una adquisición de memoria normal. [ 16 ]

Aplicaciones

TET1 parece facilitar la reprogramación nuclear de células somáticas a células iPS . [ 17 ] [ 18 ]

La enzima también se utiliza en la secuenciación con bisulfito asistida por TET (TAB-seq) para cuantificar los niveles de hidroximetilación en el genoma y distinguir la 5-hidroximetilcitosina (5hmc) de la 5-metilcitosina (5mc) con resolución de una sola base. Esta técnica, desarrollada por Chuan He, corrige la incapacidad de la secuenciación con bisulfito tradicional para diferenciar entre las dos bases modificadas. En esta técnica, TET1 es responsable de la oxidación de la 5mc, lo que permite leerla como timina tras el tratamiento con bisulfito. Esto no ocurre con la 5hmc, ya que se glucosila en el paso inicial, lo que inhibe su oxidación por TET1.

Importancia clínica

Los pacientes con esquizofrenia o trastorno bipolar han mostrado niveles aumentados de ARNm y expresión de proteína TET1 en el lóbulo parietal inferior , lo que indica que estas enfermedades pueden ser causadas por errores en la regulación de la expresión génica. [ 19 ]

Los tumores de colon, mama, próstata e hígado presentan niveles significativamente reducidos de TET1 en comparación con las células sanas del colon, y las células epiteliales normales del colon con niveles reducidos de TET1 muestran mayores niveles de proliferación. [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] Además, el aumento de los niveles de expresión de TET1 en las células de cáncer de colon disminuyó la proliferación celular tanto en cultivos celulares como en ratones mediante la desmetilación de los promotores de la vía de señalización WNT . [ 21 ]

Las líneas celulares de cáncer de mama con expresión de TET1 silenciada tienen mayores tasas de invasión y los cánceres de mama que se diseminan a los ganglios linfáticos se caracterizan por niveles más bajos de TET1. [ 24 ] Los niveles de TET1 podrían usarse para detectar metástasis de cáncer de mama. [ 24 ] Un inhibidor de la histona deacetilasa, la tricostatina A, aumentó los niveles de TET1 en tejidos de cáncer de mama, pero fue un supresor tumoral menos efectivo en pacientes con baja expresión de TET1. [ 25 ] Las pacientes con cáncer de mama con altos niveles de TET1 tuvieron probabilidades de supervivencia significativamente mayores que las pacientes con bajos niveles de TET1. [ 23 ]

La degradación de TET1 en células de cáncer de pulmón EMT inducidas por hipoxia condujo a tasas de metástasis reducidas y células. [ 26 ] Las células sanas que se transforman en células cancerosas tienen niveles reducidos de TET1, pero la disminución de la expresión de TET1 no conduce a la malignidad . [ 27 ] Las células cancerosas que utilizan la vía KRAS tuvieron un potencial invasivo reducido después de reintroducir TET1, de manera similar, la degradación de KRAS aumentó los niveles de TET1. [ 28 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000138336 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000047146 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Entrez Gene: Tet methylcytosine dioxygenase 1" . Consultado el 26 de julio de 2012 .
  6. Coulter JB, O'Driscoll CM, Bressler JP (octubre de 2013). "La hidroquinona aumenta la formación de 5-hidroximetilcitosina a través de la 5-metilcitosina dioxigenasa ten eleven translocation 1 (TET1)" . The Journal of Biological Chemistry . 288 (40): 28792– 28800. doi : 10.1074/jbc.M113.491365 . PMC 3789975. PMID 23940045 .  
  7. 1 2 Yosefzon Y, David C, Tsukerman A, Pnueli L, Qiao S, Boehm U, et al. (septiembre de 2017). "Un interruptor epigenético que reprime Tet1 en las células gonadotropas activa el eje reproductivo" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 114 (38): 10131– 10136. Bibcode : 2017PNAS..11410131Y . doi : 10.1073/pnas.1704393114 . PMC 5617270. PMID 28855337 .   
  8. Good CR, Madzo J, Patel B, Maegawa S, Engel N, Jelinek J, et al. (agosto de 2017). " Una nueva isoforma de TET1 que carece de un dominio CXXC se sobreexpresa en el cáncer" . Nucleic Acids Research . 45 (14): 8269– 8281. doi : 10.1093/nar/gkx435 . PMC 5737541. PMID 28531272 .   
  9. Ono R, Taki T, Taketani T, Taniwaki M, Kobayashi H, Hayashi Y (julio de 2002). "LCX, proteína asociada a la leucemia con un dominio CXXC, se fusiona con MLL en la leucemia mieloide aguda con displasia trilinaje que presenta t(10;11)(q22;q23)". Cancer Research . 62 (14): 4075– 4080. PMID 12124344 . 
  10. Lorsbach RB, Moore J, Mathew S, Raimondi SC, Mukatira ST, Downing JR (marzo de 2003). "TET1, un miembro de una nueva familia de proteínas, se fusiona con MLL en la leucemia mieloide aguda que contiene la t(10;11)(q22;q23)". Leukemia . 17 ( 3): 637– 641. doi : 10.1038/sj.leu.2402834 . PMID 12646957. S2CID 1202064 .  
  11. Tahiliani M, Koh KP, Shen Y, Pastor WA, Bandukwala H, Brudno Y, et al. (mayo de 2009). "Conversión de 5-metilcitosina a 5-hidroximetilcitosina en el ADN de mamíferos por el socio de MLL TET1" . Science . 324 (5929): 930– 935. Bibcode : 2009Sci...324..930T . doi : 10.1126/science.1170116 . PMC 2715015. PMID 19372391 .   
  12. 1 2 3 Ito S, Shen L, Dai Q, Wu SC, Collins LB, Swenberg JA, et al. (septiembre de 2011). "Las proteínas Tet pueden convertir la 5-metilcitosina en 5-formilcitosina y 5-carboxilcitosina" . Science . 333 (6047): 1300– 1303. Bibcode : 2011Sci...333.1300I . doi : 10.1126/science.1210597 . PMC 3495246. PMID 21778364 .   
  13. Mellén M, Ayata P, Heintz N (septiembre de 2017). "La acumulación de 5-hidroximetilcitosina en neuronas posmitóticas produce desmetilación funcional de genes expresados" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 114 (37): E7812– E7821. Bibcode : 2017PNAS..114E7812M . doi : 10.1073/pnas.1708044114 . PMC 5604027. PMID 28847947 .  
  14. Williams K, Christensen J, Pedersen MT, Johansen JV, Cloos PA, Rappsilber J, et al. (mayo de 2011). " TET1 e hidroximetilcitosina en la transcripción y fidelidad de la metilación del ADN" . Nature . 473 (7347): 343–348 . Bibcode : 2011Natur.473..343W . doi : 10.1038/nature10066 . PMC 3408592. PMID 21490601 .   
  15. Wu H, D'Alessio AC, Ito S, Xia K, Wang Z, Cui K, et al. (mayo de 2011). " Funciones duales de Tet1 en la regulación transcripcional en células madre embrionarias de ratón" . Nature . 473 (7347): 389– 393. Bibcode : 2011Natur.473..389W . doi : 10.1038/nature09934 . PMC 3539771. PMID 21451524 .   
  16. Rudenko A, Dawlaty MM, Seo J, Cheng AW, Meng J, Le T, et al. (septiembre de 2013). " Tet1 es fundamental para la expresión génica regulada por la actividad neuronal y la extinción de la memoria" . Neuron . 79 (6): 1109– 1122. doi : 10.1016/j.neuron.2013.08.003 . PMC 4543319. PMID 24050401 .   
  17. Pera MF (diciembre de 2013). "Epigenética, suplementos vitamínicos y reprogramación celular". Nature Genetics . 45 (12): 1412– 1413. doi : 10.1038/ng.2834 . PMID 24270443. S2CID 11597504 .  
  18. Chen J, Gao Y, Huang H, Xu K, Chen X, Jiang Y, et al. (marzo de 2015). "La combinación de Tet1 con Oct4 genera células madre pluripotentes inducidas de ratón de alta calidad" . Stem Cells . 33 (3): 686– 698. doi : 10.1002/stem.1879 . PMID 25331067. S2CID 42714024 .   
  19. Dong E, Gavin DP, Chen Y, Davis J (septiembre de 2012). "Regulación positiva de TET1 y regulación negativa de APOBEC3A y APOBEC3C en la corteza parietal de pacientes psicóticos" . Translational Psychiatry . 2 (9): e159. doi : 10.1038/tp.2012.86 . PMC 3565208. PMID 22948384 .  
  20. Yang H, Liu Y, Bai F, Zhang JY, Ma SH, Liu J, et al. (enero de 2013). " El desarrollo tumoral se asocia con la disminución de la expresión del gen TET y la hidroxilación de 5-metilcitosina" . Oncogene . 32 (5): 663– 669. doi : 10.1038/onc.2012.67 . PMC 3897214. PMID 22391558 .   
  21. 1 2 Neri F, Dettori D, Incarnato D, Krepelova A, Rapelli S, Maldotti M, et al. (agosto de 2015). " TET1 es un supresor tumoral que inhibe el crecimiento del cáncer de colon mediante la desrepresión de los inhibidores de la vía WNT" . Oncogene . 34 (32): 4168– 4176. doi : 10.1038/onc.2014.356 . hdl : 2318/150019 . PMID 25362856. S2CID 22017396 .   
  22. Liu C, Liu L, Chen X, Shen J, Shan J, Xu Y, et al. (2013-05-09). " La disminución de 5-hidroximetilcitosina se asocia con la progresión del carcinoma hepatocelular a través de la regulación negativa de TET1" . PLOS ONE . 8 (5) e62828. Bibcode : 2013PLoSO...862828L . doi : 10.1371/journal.pone.0062828 . PMC 3650038. PMID 23671639 .   
  23. 1 2 Hsu CH, Peng KL, Kang ML, Chen YR, Yang YC, Tsai CH, et al. (septiembre de 2012). "TET1 suprime la invasión del cáncer activando los inhibidores tisulares de las metaloproteinasas" . Cell Reports . 2 (3): 568– 579. doi : 10.1016/j.celrep.2012.08.030 . PMID 22999938 .  
  24. 1 2 Sang Y, Cheng C, Tang XF, Zhang MF, Lv XB (2015-01-01). "La hipermetilación del promotor TET1 es un nuevo marcador diagnóstico para la metástasis del cáncer de mama" . Asian Pacific Journal of Cancer Prevention . 16 (3): 1197– 1200. doi : 10.7314/apjcp.2015.16.3.1197 . PMID 25735355 . 
  25. Lu HG, Zhan W, Yan L, Qin RY, Yan YP, Yang ZJ, et al. (noviembre de 2014). "TET1 media parcialmente la supresión de la invasión del cáncer de mama inducida por inhibidores de HDAC" . Molecular Medicine Reports . 10 (5): 2595– 2600. doi : 10.3892/mmr.2014.2517 . PMID 25175940 .  
  26. Tsai YP, Chen HF, Chen SY, Cheng WC, Wang HW, Shen ZJ, et al. (diciembre de 2014). "TET1 regula la transición epitelio-mesenquimal inducida por hipoxia actuando como coactivador" . Genome Biology . 15 (12) 513. doi : 10.1186/s13059-014-0513-0 . PMC 4253621. PMID 25517638 .   
  27. Kudo Y, Tateishi K, Yamamoto K, Yamamoto S, Asaoka Y, Ijichi H, et al. (abril de 2012). "La pérdida de 5-hidroximetilcitosina se acompaña de transformación celular maligna" . Cancer Science . 103 (4): 670– 676. doi : 10.1111 / j.1349-7006.2012.02213.x . PMC 7659252. PMID 22320381. S2CID 5823834 .    
  28. Wu BK, Brenner C (diciembre de 2014). " La supresión de la desmetilación del ADN dependiente de TET1 es esencial para la transformación mediada por KRAS" . Cell Reports . 9 (5): 1827– 1840. doi : 10.1016/j.celrep.2014.10.063 . PMC 4268240. PMID 25466250 .  

Lecturas adicionales

  • Abdel-Wahab O, Mullally A, Hedvat C, Garcia-Manero G, Patel J, Wadleigh M, et  al. (julio de 2009). " Caracterización genética de las alteraciones de TET1, TET2 y TET3 en neoplasias mieloides" . Blood . 114 (1): 144– 147. doi : 10.1182/blood-2009-03-210039 . PMC 2710942. PMID 19420352 .  
  • Lorsbach RB, Moore J, Mathew S, Raimondi SC, Mukatira ST, Downing JR (marzo de 2003). "TET1, un miembro de una nueva familia de proteínas, se fusiona con MLL en la leucemia mieloide aguda que contiene la translocación t(10;11)(q22;q23)". Leukemia . 17 ( 3): 637– 641. doi : 10.1038/sj.leu.2402834 . PMID 12646957. S2CID 1202064 .  
  • Morgan AR, Hamilton G, Turic D, Jehu L, Harold D, Abraham R, et  al. (septiembre de 2008). "Análisis de asociación de 528 SNP intragénicos en una región del cromosoma 10 vinculado a la enfermedad de Alzheimer de inicio tardío". American Journal of Medical Genetics. Parte B, Neuropsychiatric Genetics . 147B (6): 727– 731. doi : 10.1002/ajmg.b.30670 . PMID 18163421. S2CID 13916214 .  
  • Ono R, Taki T, Taketani T, Taniwaki M, Kobayashi H, Hayashi Y (julio de 2002). "LCX, proteína asociada a la leucemia con un dominio CXXC, se fusiona con MLL en la leucemia mieloide aguda con displasia trilinaje que presenta t(10;11)(q22;q23)". Cancer Research . 62 (14): 4075– 4080. PMID 12124344 . 
  • Xu W, Yang H, Liu Y, Yang Y, Wang P, Kim SH, et  al. (Enero de 2011). "El oncometabolito 2-hidroxiglutarato es un inhibidor competitivo de las dioxigenasas dependientes de α-cetoglutarato" . Célula cancerosa . 19 (1): 17– 30. doi : 10.1016/j.ccr.2010.12.014 . PMC 3229304 . PMID 21251613 .  
  • Guo JU, Su Y, Zhong C, Ming GL, Song H (abril de 2011). "La hidroxilación de la 5-metilcitosina por TET1 promueve la desmetilación activa del ADN en el cerebro adulto" . Cell . 145 ( 3): 423– 434. doi : 10.1016/j.cell.2011.03.022 . PMC 3088758. PMID 21496894 .  
  • Frauer C, Rottach A, Meilinger D, Bultmann S, Fellinger K, Hasenöder S, et  al. (febrero de 2011). "Diferentes propiedades de unión y función de los dominios de dedos de zinc CXXC en Dnmt1 y Tet1" . PLOS ONE . 6 (2) e16627. Bibcode : 2011PLoSO...616627F . doi : 10.1371/journal.pone.0016627 . PMC 3032784. PMID 21311766 .  
  • Langemeijer SM, Aslanyan MG, Jansen JH (diciembre de 2009). "Proteínas TET en la hematopoyesis maligna". Cell Cycle . 8 (24): 4044– 4048. doi : 10.4161/cc.8.24.10239 . PMID 19923888. S2CID 27430810 .  
  • Mohr F, Döhner K, Buske C, Rawat VP (marzo de 2011). "Genes TET: nuevos actores en la desmetilación del ADN y determinantes importantes para la pluripotencia" . Hematología Experimental . 39 (3): 272– 281. doi : 10.1016/j.exphem.2010.12.004 . PMID 21168469 . 
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