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ALYREF

El factor de exportación Aly/REF , también conocido como subunidad 4 del complejo THO, es una proteína que en humanos está codificada por el gen ALYREF . [ 5 ] [ 6 ] El gen ALYR...

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El factor de exportación Aly/REF , también conocido como subunidad 4 del complejo THO, es una proteína que en humanos está codificada por el gen ALYREF . [ 5 ] [ 6 ]

El gen ALYREF codifica el factor de exportación Aly/REF (ALY; subunidad 4 del complejo THO, Tho4; proteína 1 de unión al factor de exportación de ARN, Refbp1), una proteína nuclear de expresión ubicua que funciona como chaperona molecular y adaptador de exportación involucrado en la exportación nuclear de ARNm empalmado y no empalmado . El complejo TREX (transcripción-exportación) , un actor clave en la exportación de ARNm, incluye el subcomplejo THO, la helicasa de ARN UAP56 y la proteína de unión a ARN ALY. En levaduras, TREX se recluta cotranscripcionalmente; en células humanas se recluta durante una etapa tardía del empalme. El complejo TREX humano se recluta a una región cercana al extremo 5' del ARNm por la interacción de ALY y THO con el complejo de unión a la caperuza nuclear. Como chaperona, ALY promueve la dimerización de factores de transcripción que contienen dominios de cremallera de leucina básica ( bZIP ), [ 7 ] promoviendo así la activación transcripcional. ALY tiene funciones clave en el procesamiento del extremo 3' de los ARNm poliadenilados y en la exportación nuclear de ARNm poliadenilados y no poliadenilados. [ 8 ] [ 9 ] Después de que el ARNm se une a ALY, aparentemente se transfiere al heterodímero NXF1-NXT1 para su exportación (vía TAP/NFX1). La proteína ALY de longitud completa (Refbp1-I, 255 aminoácidos codificados por seis exones [ 10 ] ) tiene un motivo de reconocimiento de ARN conservado (RRM; aminoácidos 105-182) flanqueado por secuencias ricas en alanina/arginina/glicina; Una región N-terminal (aminoácidos 16-37) es suficiente para la unión al ARN y la interacción con el heterodímero NXF1-NXT1. [ 11 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000183684 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000025134 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ^ Muravenko OV, Gizatullin RZ, Al-Amin AN, Protopopov AI, Kashuba VI, Zelenin AV, Zabarovsky ER (enero de 2001). "Posición del mapa del gen ALY / BEF humano 17q25.3". Resolución cromosómica . 8 (6): 562. doi : 10.1023/A:1009236126053 . PMID 11032328 . S2CID 6859937 .  
  6. ↑ "Gen Entrez: ALYREF Factor de exportación Aly/REF" .
  7. ↑ "Gen Entrez: complejo THOC4 THO 4" .
  8. ↑ Shi M, Zhang H, Wu X, He Z, Wang L, Yin S, Tian B, Li G, Cheng H (septiembre de 2017). "ALYREF se une principalmente a las regiones 5' y 3' del ARNm in vivo" . Nucleic Acids Res . 45 (16): 9640–9653 . doi : 10.1093/nar/gkx597 . PMC 5766156. PMID 28934468 .  
  9. ↑ Shi M, Zhang H, Wu X, He Z, Wang L, Yin S, Tian B, Li G, Cheng H (marzo de 2019). "ALYREF vincula el procesamiento del extremo 3' con la exportación nuclear de ARNm no poliadenilados" . EMBO J. 38 ( 9) e99910. doi : 10.15252/embj.201899910 . PMC 6484419. PMID 30858280 .  
  10. ↑ "Ensembl: Gen ALYREF ENSG00000183684 (humano)" . Archivado del original el 14 de mayo de 2019. Consultado el 14 de mayo de 2019 .
  11. ↑ "UniProtKB Q86V81 (THOC4_HUMAN)" .

Lecturas adicionales

  • Bruhn L, Munnerlyn A, Grosschedl R (1997). "ALY, un coactivador dependiente del contexto de LEF-1 y AML-1, es necesario para la función del potenciador TCRalpha" . Genes Dev . 11 (5): 640– 53. doi : 10.1101/gad.11.5.640 . PMID 9119228 . 
  • Neubauer G, King A, Rappsilber J, et  al. (1998). "La espectrometría de masas y la búsqueda en bases de datos EST permiten la caracterización del complejo espliceosoma multiproteico". Nat . Genet . 20 (1): 46– 50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529. S2CID 585778 .  
  • Wichmann I, Garcia-Lozano JR, Respaldiza N, et  al. (1999). "Autoanticuerpos contra las proteínas de regulación transcripcional DEK y ALY en un paciente con lupus eritematoso sistémico". Hum. Immunol . 60 (1): 57– 62. doi : 10.1016/S0198-8859(98)00085-8 . PMID 9952027 . 
  • Virbasius CM, Wagner S, Green MR (1999). "Una chaperona humana localizada en el núcleo que regula la dimerización, la unión al ADN y la actividad transcripcional de las proteínas bZIP" . Mol. Cell . 4 (2): 219–28 . doi : 10.1016/S1097-2765(00)80369-X . PMID 10488337 . 
  • Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2001). "El espliceosoma deposita múltiples proteínas 20-24 nucleótidos río arriba de las uniones exón-exón del ARNm" . EMBO J. 19 ( 24): 6860–9 . doi : 10.1093/emboj/19.24.6860 . PMC 305905. PMID 11118221 .  
  • Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (2001). "Función del factor de degradación mediado por codones de terminación hUpf3 en el complejo de unión exón-exón dependiente del empalme". Science . 293 (5536): 1832– 6. Bibcode : 2001Sci...293.1832K . doi : 10.1126/science.1062829 . PMID 11546873 . S2CID 12018200 .  
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