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Articulo de referencia

Termoprotección

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Thermoproteati es un reino de arqueas . Su sinónimo , " TACK ", es un acrónimo de "Thaumarchaeota" (ahora Nitrososphaerota ), " Aigarchaeota ", "Crenarchaeota" (ahora Thermoproteota ) y " Korarchaeota ", los primeros grupos descubiertos. Se encuentran en diferentes ambientes que van desde termófilos acidófilos hasta mesófilos y psicrófilos y con diferentes tipos de metabolismo , predominantemente anaeróbico y quimiosintético. [ 6 ] Thermoproteati es un reino que es hermano de la rama " Asgard " que dio origen a los eucariotas . Se ha propuesto que el reino Thermoproteati se clasifique como " Crenarchaeota " y que los tradicionales "Crenarchaeota" (Thermoproteota) se clasifiquen como una clase llamada Sulfolobia, junto con los otros filos con rango u orden de clase. [ 7 ] Después de incluir la categoría de reino en ICNP , el único nombre válidamente publicado de este grupo es reino Thermoproteati (Guy y Ettema 2024) . 8 ]

Clasificación

  • " Augarchaeota ". Es un filo propuesto a partir del genoma de la especie candidata " Candidiatus Caldiarchaeum subterraneum" (ahora pertenece a Thermoproteota como " Candidiatus Caldarchaeum subterraneum ") [ 9 ] [ 10 ] encontrada en las profundidades de una mina de oro en Japón . También se han encontrado secuencias genómicas de este grupo en ambientes geotérmicos, tanto terrestres como marinos.

Filogenia

Las relaciones son, aproximadamente, las siguientes:

Hipótesis del eocitos [ 19 ]

hipótesis del eocitos

La hipótesis del eocitos propuesta en la década de 1980 por James Lake sugiere que los eucariotas surgieron dentro de los eocitos procariotas . [ 20 ]

Una prueba que respalda una estrecha relación entre Thermoproteati y eucariotas es la presencia de un homólogo de la subunidad Rbp-8 de la ARN polimerasa en Thermoproteota pero no en "Euryarchaea". [ 21 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ Thermoproteati en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ" . Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
  2. ↑ Parte, AC, Sardà Carbasse, J., Meier-Kolthoff, JP, Reimer, LC y Göker, M. (2020). La lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology , 70 , 5607-5612; DOI: 10.1099/ijsem.0.004332
  3. ↑ Lake, JA; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, MW) (1984). "Eocitos: Una nueva estructura ribosómica indica un reino con una estrecha relación con los eucariotas" . PNAS . 81 ( 12): 3786– 3790. Bibcode : 1984PNAS...81.3786L . doi : 10.1073/pnas.81.12.3786 . PMC 345305. PMID 6587394 .  {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  4. ↑ Lake, JA (2015). "Orígenes eucariotas" . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 370 ( 1678) 20140321. doi : 10.1098/rstb.2014.0321 . PMC 4571561. PMID 26323753 .  
  5. ↑ Petitjean, Céline; Deschamps, Philippe; López-García, Purificación; Moreira, David (2015-01-01). "El enraizamiento del dominio Archaea mediante análisis filogenómico respalda la fundación del nuevo reino Proteoarchaeota" . Genome Biology and Evolution . 7 (1): 191– 204. doi : 10.1093 / gbe/evu274 . ISSN 1759-6653 . PMC 4316627. PMID 25527841 .   
  6. ↑ Guy, Lionel; Ettema, Thijs JG (2011). "El superfilo arqueal 'TACK' y el origen de los eucariotas". Trends in Microbiology . 19 (12): 580– 587. doi : 10.1016/j.tim.2011.09.002 . PMID 22018741 . 
  7. ↑ Cavalier-Smith, Thomas ; Chao, Ema E-Yung (2020). "Árboles de proteínas ribosómicas multidominio y el origen planctobacteriano de neomura (Eucariotas, arqueobacterias)" . Protoplasma . 257 ( 3): 621–753 . doi : 10.1007/s00709-019-01442-7 . PMC 7203096. PMID 31900730 .  
  8. ↑ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 de enero de 2024). "Publicación válida de nombres de dos dominios y siete reinos de procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 74 (1). doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN 1466-5026 . PMID 38252124 .  
  9. ↑ "Especie: Caldiarchaeum subterraneum" . lpsn.dsmz.de. Consultado el 2 de abril de 2025 .
  10. ↑ "Especie: Caldarchaeum subterraneum" . lpsn.dsmz.de. Consultado el 2 de abril de 2025 .
  11. ↑ Wang, Yinzhao; Wegener, Gunter; Hou, Jialin; Wang, Fengping; Xiao, Xiang (2019-03-04). "Expansión del metabolismo anaeróbico de alcanos en el dominio de las arqueas" . Nature Microbiology . 4 (4): 595– 602. doi : 10.1038/s41564-019-0364-2 . ISSN 2058-5276 . 
  12. ↑ McKay, LJ, Dlakić, M., Fields, MW et al. Capacidad genómica coexistente para el metabolismo anaeróbico del metano y el metabolismo disimilatorio del azufre descubierta en Korarchaeota . Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
  13. ↑ "El LTP" . El Proyecto de Árboles Vivos de Todas las Especies . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  14. ↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . El Proyecto de Árboles Vivos de Todas las Especies . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  15. ↑ "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . El Proyecto de Árboles Vivos de Todas las Especies . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  16. ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  17. ↑ "ar53_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  18. ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  19. ↑ Cox, CJ; Foster, PG; Hirt, RP; Harris, SR; Embley, TM (2008). "El origen arqueobacteriano de los eucariotas" . Proc Natl Acad Sci USA . 105 (51): 20356– 61. Bibcode : 2008PNAS..10520356C . doi : 10.1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343. PMID 19073919 .  
  20. ↑ (UCLA) El origen del núcleo y el árbol de la vida. Enlace obsoleto archivado el 7 de febrero de 2003 en archive.today.
  21. ↑ Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). "Evolución temprana de las ARN polimerasas dependientes de ADN eucariotas". Trends Genet . 24 (5): 211– 5. doi : 10.1016/j.tig.2008.02.002 . PMID 18384908 .