Articulo de referencia

Thorarchaeia

{{Cite journal |last=Zhang |first=Jiawei |last2=Feng |first2=Xiaoyuan |last3=Li |first3=Meng |last4=Liu |first4=Yang |last5=Liu |first5=Min |last6=Hou |first6=Li-Jun |last7=Dong...

"Thorarchaeia" es una clase dentro del reino Promethearchaeati . El reino Promethearchaeati representa los parientes procariotas más cercanos de los eucariotas . Dado que existe una relación tan estrecha entre los dos dominios diferentes , proporciona más evidencia para la teoría del árbol de la vida de dos dominios que afirma que los eucariotas se ramificaron del dominio arqueal . El reino Promethearchaeati son microbios marinos unicelulares que contienen apéndices ramificados y tienen genes similares a los de Eukarya. [ 2 ] [ 3 ] El reino Promethearchaeati está compuesto por "Thorarchaeia", Promethearchaeia , " Odinarchaeia " y " Heimdallarchaeia ". [ 4 ] [ 3 ] "Thorarchaeia" se identificó por primera vez en la zona de transición sulfato-metano en sedimentos de agua de marea. "Thorarchaeia" está ampliamente distribuida en sedimentos marinos y de agua dulce.

Descubrimiento

Las "Thorarchaeia" fueron descubiertas mediante el análisis de sedimentos estuarinos obtenidos del río White Oak en Carolina del Norte . Los estuarios son cuerpos de agua salobre donde se mezclan el agua dulce y el agua salada, proporcionando un área rica y única de nutrientes. [ 5 ] Un estudiante de doctorado de la Universidad de Texas descubrió nuevas características de las "Thorarchaeia" que viven bajo el sedimento y con propiedades anóxicas . Los estudiantes de posgrado demostraron además que las arqueas ayudaban en la degradación de la materia orgánica, la fijación de carbono y la reducción de azufre. [ 6 ] Los genomas de las "Thorarchaeia" obtenidos del medio marino parecían tener diversidad en las vías metabólicas con el potencial de degradar y absorber proteínas y carbohidratos. [ 7 ]

Descripción

Las "Thorarchaeia" no se han cultivado en un laboratorio. Lo que se sabe sobre las "Thorarchaeia" proviene del análisis de genomas parciales y casi completos. Se han secuenciado 3029 proteínas de los genomas parciales. [ 8 ] Estos genomas contienen genes que sugieren que las "Thorarchaeia" pueden tener la capacidad de degradar materia orgánica, lo que sugiere un papel en el ciclo del carbono y un papel intermedio en el ciclo del azufre . Se han encontrado genes para una vía de Wood-Ljungdahl casi completa , pero faltaban los genes para la formiato deshidrogenasa . Esto podría deberse a que tienen genomas incompletos. Las "Thorarchaeia" pueden usar la vía de Wood-Ljungdahl de tetrahidrometanopterina para reducir el dióxido de carbono. [ 9 ] Las "Thorarchaeia" tienen genes para la degradación y asimilación de proteínas que incluyen los genes clostripaina y gingipaína . También tienen genes para peptidasas extracelulares . Estos genes pueden sugerir que la principal fuente de carbono para "Thorarchaeia" son las proteínas y los péptidos. [ 7 ] Los genomas parciales secuenciados de "Thorarchaeia" también tienen los genes para la glucólisis presentes. Carecen de los genes para las hexoquinasas ; sin embargo, tienen los genes para las piruvato quinasas y la fosfoenolpiruvato sintasa . La presencia de los genes para estas enzimas puede desempeñar un papel en la capacidad de adaptación a diferentes condiciones ambientales. Se han encontrado genes para la fijación de nitrógeno en la mayoría de las muestras que contienen los genomas parciales; sin embargo, no se han encontrado genes para las enzimas que catalizan la reducción de nitrito . [ 9 ] Algunos de los genomas parciales secuenciados tienen vías de Calvin-Benson-Bassham casi completas y se ha descubierto que utilizan RuBisCO de tipo IV . Mientras que otras clases dentro del reino Promethearchaeati utilizan RuBisCO de tipo III y tipo IV, ninguna tiene la vía de Calvin-Benson-Bassham. [ 9 ] [ 3 ]

Véase también

Referencias

  1. Zhang, Jiawei; Feng, Xiaoyuan; Li, Meng; Liu, Yang; Liu, Min; Hou, Li-Jun; Dong, Hong-Po (7 de mayo de 2025). " Origen profundo de los eucariotas fuera de Heimdallarchaeia dentro de Asgardarchaeota" . Nature . 642 (8069): 990–998 . doi : 10.1038/s41586-025-08955-7 . ISSN 1476-4687 . PMC 12222021. PMID 40335687 .   
  2. "Las esquivas arqueas de Asgard finalmente se cultivan en laboratorio" . The Scientist Magazine® . Archivado del original el 1 de noviembre de 2019. Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
  3. 1 2 3 Imachi, Hiroyuki; Nobu, Masaru K.; Kato, Shingo; Takaki, Yoshihiro; Miyazaki, Masayuki; Miyata, Makoto; Ogawara, Miyuki; Saito, Yumi; Sakai, Sanae; Tahara, Yuhei O.; Takano, Yoshinori; Tasumi, Eiji; Uematsu, Katsuyuki; Yoshimura, Toshihiro; Itoh, Takashi (2024). "Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., un arqueón anaeróbico, obligatoriamente sintrófico, el primer aislado del linaje 'Asgard' archaea, y propuesta del nuevo filo arqueal Promethearchaeota phyl. nov. y reino Promethearchaeati regn. nov" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 74 (7): 006435. doi : 10.1099/ijsem.0.006435 . ISSN 1466-5034 . PMC 11316595 . PMID 38967634 .   
  4. Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Cáceres, Eva F.; Vio, Jimmy H.; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W.; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr; Kjeldsen, Kasper U.; Stott, Matthew B. (enero de 2017). "Asgard archaea iluminan el origen de la complejidad celular eucariota" . Naturaleza . 541 (7637): 353– 358. Bibcode : 2017Natur.541..353Z . doi : 10.1038/naturaleza21031 . ISSN 1476-4687 . OSTI 1580084 . PMID 28077874. S2CID 4458094. Archivado del original el 5 de diciembre de 2019. Recuperado el 11 de septiembre de 2020 .    
  5. ^ Adán, Panagiotis S; Borrel, Guillaume; Brochier-Armanet, Céline; Gribaldo, Simonetta (noviembre de 2017). "El árbol en crecimiento de Archaea: nuevas perspectivas sobre su diversidad, evolución y ecología" . La Revista ISME . 11 (11): 2407– 2425. Bibcode : 2017ISMEJ..11.2407A . doi : 10.1038/ismej.2017.122 . ISSN 1751-7362 . PMC 5649171 . PMID 28777382 .   
  6. "Se identifican nuevos filos de microbios" . utmsi.utexas.edu . Archivado del original el 16 de noviembre de 2019. Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
  7. 1 2 Seitz, Kiley W; Lazar, Cassandre S; Hinrichs, Kai-Uwe; Teske, Andreas P; Baker, Brett J (julio de 2016). "Reconstrucción genómica de un nuevo filo de arqueas sedimentarias profundamente ramificado con vías para la acetogénesis y la reducción de azufre" . The ISME Journal . 10 (7): 1696– 1705. Bibcode : 2016ISMEJ..10.1696S . doi : 10.1038 / ismej.2015.233 . ISSN 1751-7362 . PMC 4918440. PMID 26824177 .   
  8. «Candidatus Thorarchaeota archaeon SMTZ1-83» . www.uniprot.org . Archivado desde el original el 2 de mayo de 2021 . Consultado el 16 de noviembre de 2019 .
  9. 1 2 3 Liu, Yang; Zhou, Zhichao; Pan, Jie; Baker, Brett J.; Gu, Ji-Dong; Li, Meng (abril de 2018). "La inferencia genómica comparativa sugiere un estilo de vida mixotrófico para Thorarchaeota" . The ISME Journal . 12 (4): 1021– 1031. Bibcode : 2018ISMEJ..12.1021L . doi : 10.1038/s41396-018-0060- x . ISSN 1751-7370 . PMC 5864231. PMID 29445130 .