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Odinarchaeia

Candidatus Odinarchaeia (informally Odinarchaeia ) is a class of uncultured archaea within the phylum Candidatus Odinarchaeota , itself within the kingdom Promethearchaeati or A...

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Candidatus Odinarchaeia (informally Odinarchaeia) is a class of uncultured archaea within the phylum CandidatusOdinarchaeota, itself within the kingdom Promethearchaeati or Asgard Archea.[1][2]All known members still remain known exclusively from metagenome-assembled genomes.[3]

Taxonomy

Odinarchaeia was described in 2017 Uppsala University researchers as a founding lineage of the Asgard superphylum, alongside Candidatus Lokiarchaeia, Candidatus Thorarchaeia, and Candidatus Heimdallarchaeia, discoverd in genomes assembled from samples from Loki's Castle. The class is named after Odin, as with the rest of the Norse-themed nomenclature across Asgard lineages.[2]Phylogenomic analyses using the Genome Taxonomy Database supported the assignment of Odinarchaeia to the rank of class. As of 2026 Odinarchaeia is listed as a class.[4][5] The Asgard superphylum has since been reclassified as the kingdom Promethearchaeati.[1]

Ecology

Odinarchaeia are thermophiles. In the study that established the class, metagenomic contigs assigned to Odinarchaeota were recovered exclusively from hot spring environments, Yellowstone National Park and the Radiata Pool in New Zealand.[2] This distinguishes Odinarchaeia from other Asgard classes.[2] Subsequent broader surveys have additionally reported Odinarchaeia-affiliated sequences from subsurface coastal and marine habitats.[6]

Analysis

The type is Candidatus Odinarchaeum yellowstonii, named after its sampling site in Yellowstone.[3] Its genome was originally assembled from a MAG as a single circular chromosome of 1.46 Mbp in 9 contigs.[3]

Al igual que otras arqueas Asgard, el genoma Ca. Odinarchaeum LCB_4 codifica proteínas características de eucariotas , lo que concuerda con la estrecha relación evolutiva propuesta entre las arqueas Asgard y los eucariotas . [ 2 ] El genoma LCB_4 codifica simultáneamente un gen similar a la tubulina y dos homólogos de FtsZ , una combinación no identificada en otras arqueotas Asgard. [ 2 ] [ 3 ]

virus

El análisis de los espaciadores CRISPR en el genoma cerrado de yellowstonii identificó objetivos en supuestos contigs virales recuperados del mismo ensamblaje metagenómico, lo que permitió la caracterización de los primeros virus arqueales Asgard. [ 3 ] Se han identificado virus adicionales que se infiere que infectan a Odinarchaeia a través de una coincidencia más amplia de espaciadores CRISPR metagenómicos, incluidos miembros distantemente relacionados con Caudoviricetes y con virus de cápside sin cola del reino Varidnaviria . [ 7 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 "Candidatus Odinarchaeia – Taxonomía" . Centro Nacional de Información Biotecnológica .
  2. 1 2 3 4 5 6 Zaremba-Niedzwiedzka, Katarzyna; Cáceres, Eva F.; Vio, Jimmy H.; Bäckström, Disa; Juzokaite, Lina; Vancaester, Emmelien; Seitz, Kiley W.; Anantharaman, Karthik; Starnawski, Piotr; Kjeldsen, Kasper U.; Stott, Mateo B.; Nunoura, Takuro; Banfield, Jillian F.; Schramm, Andreas; Panadero, Brett J.; Spang, Anja; Ettema, Thijs JG (2017). "Asgard archaea ilumina el origen de la complejidad celular eucariota". Naturaleza . 541 (7637): 353– 358. doi : 10.1038/naturaleza21031 . PMID 28077874 . 
  3. 1 2 3 4 5 Tamarit, Daniel; Cáceres, Eva F.; Krupovic, Mart; et al. (2022). "Un cromosoma cerrado de Candidatus Odinarchaeum expone los virus arqueales de Asgard" . Microbiología de la naturaleza . 7 : 948– 952. doi : 10.1038/s41564-022-01122-y . PMC 9246712 . PMID 35760836 .   
  4. ↑ "Entrada de la base de datos de taxonomía genómica para GCA_029856525.1" . GTDB: Base de datos de taxonomía genómica . Consultado el 6 de mayo de 2026 .
  5. ↑ Seitz, Kiley W.; et al. (2021). "La recodificación de los codones de parada amplía el potencial metabólico de dos nuevos linajes de Asgardarchaeota" . ISME Communications . 1 (1): 30. doi : 10.1038/s43705-021-00032-0 . PMC 9723677 .  
  6. ↑ Smith y G. Lloyd, Lovell y Karen; et al. (2025). "Factores ecológicos de la especialización de Promethearchaeati para entornos subterráneos profundos" . Communications Biology . doi : 10.1038/s42003-026-09786-6 . 
  7. ↑ Medvedeva, Sofia; et al. (2022). "Tres familias de virus arqueales Asgard identificadas en genomas ensamblados a partir de metagenomas" . Nature Microbiology . 7 : 962–973 . doi : 10.1038/s41564-022-01144-6 . PMC 11165672. PMID 35668157 .