Proteína transmembrana 151B

La proteína transmembrana 151B es una proteína que en los humanos está codificada por el gen TMEM151B . ^{[ 5 ]}

El gen de la proteína transmembrana 151B también se conoce como TMEM151B, C6orf137 y bA444E17.5. ^{[ 6 ]}

El gen se encuentra en la cadena positiva del cromosoma 6, en la posición 6p21.1, desde la posición cromosómica 44270450 hasta la 44279444, con una longitud total de 8995 pares de bases. ^{[ 7 ]} Es un locus complejo que contiene tanto TMEM151B como SPATS1 . ^{[ 8 ]} TMEM151B tiene un parálogo : TMEM151A . ^{[ 9 ]}

El ARNm contiene 3 exones, con una longitud de ARNm transcrito de 4911 pb, y la región codificante contiene 1701 pb. ^{[ 7 ]}

La proteína tiene una longitud de 566 aminoácidos y contiene dos dominios transmembrana . ^{[ 6 ]} Según Compute pI/Mw, el peso molecular es de aproximadamente 61 kDa, que coincide con el peso listado en NCBI , y un punto isoeléctrico teórico de 6,72. ^{[ 11 ] [ 6 ]} La composición de la proteína humana TMEM151B es pobre en lisina y arginina , la lisina comprende el 1,4 % de los aminoácidos y la arginina constituye el 0,8 % de la proteína total. El ortólogo de ratón también es pobre en arginina. ^{[ 12 ]}

Expresión

El perfil de expresión génica mediante RNA-seq muestra una alta expresión en el cerebro y una expresión notable en los testículos . ^{[ 14 ]} Los perfiles geográficos del NCBI muestran de manera similar una localización en los tejidos cerebrales. ^{[ 15 ]} Dentro del cerebro del ratón, TMEM151B tiene una alta expresión particularmente en el cerebelo , la médula oblongada y el bulbo olfatorio según el Atlas Cerebral de Allen. ^{[ 13 ]}

El gen TMEM151B se conserva en la mayoría de los vertebrados y parece conservarse también en algunos invertebrados. Su parálogo, TMEM151A , tiene una identidad de secuencia del 47,7 % con TMEM151B. ^{[ 9 ] [ 18 ]} La tasa de evolución es relativamente lenta: entre la tasa de cambio del fibrinógeno alfa y el citocromo c . ^{[ 9 ] [ 19 ]}

El empalme alternativo de TMEM151B junto con otros 4 genes se vincularon con el cáncer colorrectal. ^{[ 20 ]} También se encontró que estaba sobreexpresado en el cáncer de mama posmenopáusico. ^{[ 21 ] [ 22 ]} Un SNP encontrado dentro de TMEM151B está asociado con el desarrollo de músculo magro. ^{[ 23 ]}