endonucleasa UvrABC

La endonucleasa UvrABC es un complejo multienzimático bacteriano implicado en la reparación del ADN mediante reparación por escisión de nucleótidos , por lo que a veces se la denomina excinucleasa . Este proceso de reparación UvrABC, también conocido como proceso de parche corto, implica la eliminación de doce nucleótidos en la zona dañada del ADN, seguida de la acción de una ADN polimerasa que reemplaza estos nucleótidos aberrantes por los correctos, completando así la reparación . Las subunidades de esta enzima están codificadas en los genes uvrA , uvrB y uvrC . Este complejo enzimático es capaz de reparar diversos tipos de daño, incluyendo la formación de dímeros de ciclobutilo . ^{[ 1 ]}

Mecanismo

Dos proteínas UvrA forman un homodímero (UvrA ₂ ) y ambas tienen actividad ATPasa/GTPasa.
Dos proteínas UvrB forman un homodímero (UvrB ₂ ).
El homodímero UvrA se une a un homodímero UvrB (UvrA ₂ B ₂ ) ^{[ 2 ]} y forma un complejo que puede detectar daños en el ADN . El dímero UvrA funciona como la unidad responsable de la detección de daños en el ADN, probablemente a través de un mecanismo de detección de distorsiones en la doble hélice del ADN .
Tras la unión del complejo UvrA ₂ B ₂ a un supuesto sitio dañado, el ADN se enrolla alrededor de UvrB ^{[ 3 ].}
El dímero UvrA se disocia y una proteína UvrC entra en acción y se une a UvrB, formando así un nuevo complejo UvrBC.
UvrC es responsable de escindir los nucleótidos a ambos lados del daño en el ADN. ^{[ 4 ]} Escinde un enlace fosfodiéster cuatro nucleótidos corriente abajo del daño en el ADN, y escinde un enlace fosfodiéster ocho nucleótidos corriente arriba del daño en el ADN y crea un segmento escindido de doce nucleótidos.
La helicasa de ADN II (a veces llamada UvrD) interviene y elimina el segmento escindido mediante la ruptura del apareamiento de bases. La UvrB permanece en su lugar aunque la UvrC se haya disociado en esta etapa, ya que la UvrB podría estar implicada para evitar la reasociación del ADN escindido.
La ADN polimerasa I interviene y completa la secuencia correcta de nucleótidos, activando la UvrB en el proceso, y la ADN ligasa completa el último enlace fosfodiéster.

Aunque la mayoría de los estudios sobre la endonucleasa UvrABC se realizaron con la bacteria gramnegativa Escherichia coli , también se han publicado estudios similares para la arqueobacteria Halobacterium sp. NRC-1. ^{[ 5 ]} La investigación de la reparación del ADN en esta arqueobacteria es importante para comprender la diversidad y la evolución de los sistemas de reparación del ADN en general. En Halobacterium sp. NRC-1, se requieren homólogos de los genes de reparación por escisión de nucleótidos bacterianos de E. coli uvrA , uvrB y uvrC para la eliminación de los daños causados por la radiación UV (en ausencia de luz fotorreactivadora). ^{[ 5 ]}

Véase también

Referencias

↑ Grossman L, Yeung AT (1990). "El sistema de endonucleasa UvrABC de Escherichia coli: una perspectiva desde Baltimore". Mutation Research . 236 ( 2–3 ): 213–221 . doi : 10.1016/0921-8777(90)90006-q . PMID 2144612 .
↑ Verhoeven EE, Wyman C, Moolenaar GF, Goosen N (agosto de 2002). "La presencia de dos subunidades UvrB en el complejo UvrAB garantiza la detección de daños en ambas hebras de ADN" . The EMBO Journal . 21 (15): 4196– 4205. doi : 10.1093/emboj/cdf396 . PMC 126143. PMID 12145219 .
↑ "uvrB – Proteína B del sistema UvrABC – Escherichia coli (cepa K12) – Gen y proteína uvrB" . www.uniprot.org . Consultado el 28 de febrero de 2016 .
^ Verhoeven EE, van Kesteren M, Moolenaar GF, Visse R, Goosen N (febrero de 2000). "Los sitios catalíticos para la incisión 3 'y 5' de la reparación por escisión de nucleótidos de Escherichia coli están ubicados en UvrC" . La Revista de Química Biológica . 275 (7): 5120– 5123. doi : 10.1074/jbc.275.7.5120 . hdl : 1887/49954 . PMID 10671556 .
1 2 Crowley DJ, Boubriak I, Berquist BR, Clark M, Richard E, Sullivan L, et al. (septiembre de 2006). " Los genes uvrA, uvrB y uvrC son necesarios para la reparación de los fotoproductos de ADN inducidos por la luz ultravioleta en Halobacterium sp. NRC-1" . Saline Syst . 2 : 11. doi : 10.1186/1746-1448-2-11 . PMC 1590041. PMID 16970815 .

Enlaces externos

uvrABC+endonucleasa en los Encabezamientos de Materia Médica (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.

[1] Grossman L, Yeung AT (1990). "El sistema de endonucleasa UvrABC de Escherichia coli: una perspectiva desde Baltimore". Mutation Research . 236 ( 2–3 ): 213–221 . doi : 10.1016/0921-8777(90)90006-q . PMID 2144612 .

[2] Verhoeven EE, Wyman C, Moolenaar GF, Goosen N (agosto de 2002). "La presencia de dos subunidades UvrB en el complejo UvrAB garantiza la detección de daños en ambas hebras de ADN" . The EMBO Journal . 21 (15): 4196– 4205. doi : 10.1093/emboj/cdf396 . PMC 126143. PMID 12145219 .

[3] "uvrB – Proteína B del sistema UvrABC – Escherichia coli (cepa K12) – Gen y proteína uvrB" . www.uniprot.org . Consultado el 28 de febrero de 2016 .

[4] Verhoeven EE, van Kesteren M, Moolenaar GF, Visse R, Goosen N (febrero de 2000). "Los sitios catalíticos para la incisión 3 'y 5' de la reparación por escisión de nucleótidos de Escherichia coli están ubicados en UvrC" . La Revista de Química Biológica . 275 (7): 5120– 5123. doi : 10.1074/jbc.275.7.5120 . hdl : 1887/49954 . PMID 10671556 .

[Crowley2006-5] 1 2 Crowley DJ, Boubriak I, Berquist BR, Clark M, Richard E, Sullivan L, et al. (septiembre de 2006). " Los genes uvrA, uvrB y uvrC son necesarios para la reparación de los fotoproductos de ADN inducidos por la luz ultravioleta en Halobacterium sp. NRC-1" . Saline Syst . 2 : 11. doi : 10.1186/1746-1448-2-11 . PMC 1590041. PMID 16970815 .

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