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VPS29

VPS29 es un gen humano que codifica la proteína de clasificación de proteínas vacuolares Vps29, un componente del complejo retromérico . [ 5 ] homólogo de levadura La proteína h...

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VPS29 es un gen humano que codifica la proteína de clasificación de proteínas vacuolares Vps29, un componente del complejo retromérico . [ 5 ]

homólogo de levadura

La proteína homóloga (que realiza la misma función) en la levadura es el homólogo de clasificación de proteínas vacuolares 29 (S. cerevisiae) . [ 6 ]

Función

VPS29 pertenece a un grupo de genes que codifican proteínas de clasificación de proteínas vacuolares (VPS) que, cuando se ven afectadas funcionalmente, interrumpen la entrega eficiente de hidrolasas vacuolares . [ 7 ] La proteína codificada por este gen, Vps29, es un componente de un gran complejo multimérico, denominado complejo retromérico , que participa en el transporte retrógrado de proteínas desde los endosomas a la red trans-Golgi . Vps29 podría estar involucrada en la formación de la capa interna de la cubierta retromérica para las vesículas retrógradas que salen del compartimento prevacuolar. [ 8 ] Se han encontrado variantes de empalme alternativas que codifican diferentes isoformas y el uso de múltiples sitios de poliadenilación para este gen. [ 6 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000111237 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000029462 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Edgar AJ, Polak JM (noviembre de 2000). "Homólogos humanos de las proteínas de clasificación vacuolar 29 y 35 de levadura". Biochem. Biophys. Res. Commun . 277 (3): 622– 30. doi : 10.1006/bbrc.2000.3727 . PMID 11062004 . 
  6. 1 2 "Entrez Gene: homólogo de la proteína de clasificación vacuolar VPS29 29 (S. cerevisiae)" .
  7. ↑ Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, Lesniak MA, Barr VA, Taylor SI (diciembre de 2000). "Ortólogos humanos de las proteínas de clasificación de proteínas vacuolares de levadura Vps26, 29 y 35: ensamblaje en complejos multiméricos" . Mol. Biol. Cell . 11 (12): 4105–16 . doi : 10.1091/mbc.11.12.4105 . PMC 15060. PMID 11102511 .  
  8. ↑ Bonifacino JS, Hurley JH (agosto de 2008). " Retromer" . Curr. Opin. Cell Biol . 20 (4): 427–36 . doi : 10.1016/j.ceb.2008.03.009 . PMC 2833274. PMID 18472259 .  

Lecturas adicionales

  • Seaman MN, McCaffery JM, Emr SD (1998). "Un complejo de cubierta de membrana esencial para el transporte retrógrado del endosoma al Golgi en levaduras" . J. Cell Biol . 142 (3): 665–81 . doi : 10.1083/jcb.142.3.665 . PMC 2148169. PMID 9700157 .  
  • Edgar AJ, Polak JM (2000). "Homólogos humanos de las proteínas de clasificación vacuolar 29 y 35 de levadura". Biochem. Biophys. Res. Commun . 277 (3): 622– 30. doi : 10.1006/bbrc.2000.3727 . PMID 11062004 . 
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Haft CR, de la Luz Sierra M, Bafford R, et  al. (2001). "Ortólogos humanos de las proteínas de clasificación de proteínas vacuolares de levadura Vps26, 29 y 35: ensamblaje en complejos multiméricos" . Mol . Biol. Cell . 11 (12): 4105–16 . doi : 10.1091/mbc.11.12.4105 . PMC 15060. PMID 11102511 .  
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et  al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos cDNA humanos completos que codifican proteínas" . Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .  
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et  al. (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Rep . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
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  • Mingot JM, Bohnsack MT, Jäkle U, Görlich D (2005). "Exportina 7 define una nueva vía general de exportación nuclear" . EMBO J. 23 ( 16): 3227–36 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600338 . PMC 514512. PMID 15282546 .  
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et  al. (2004). " Del ORFeoma a la Biología: Una Ruta de Genómica Funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Wang D, Guo M, Liang Z, et  al. (2005). "La estructura cristalina de la proteína 29 de clasificación de proteínas vacuolares humanas revela un plegamiento similar a una fosfodiesterasa/nucleasa y dos sitios de interacción proteína-proteína" . J. Biol. Chem . 280 (24): 22962–7 . doi : 10.1074/jbc.M500464200 . PMID 15788412 . 
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et  al. (2006). " La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (Número especial sobre bases de datos): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .  
  • Damen E, Krieger E, Nielsen JE, et  al. (2006). "El componente retromérico Vps29 humano es una metalofosfoesterasa para un péptido sustrato del receptor de manosa 6-fosfato independiente de cationes" . Biochem . J. 398 ( 3): 399– 409. doi : 10.1042/BJ20060033 . PMC 1559457. PMID 16737443 .  
  • Rojas R, Kametaka S, Haft CR, Bonifacino JS (2007). "Funciones intercambiables pero esenciales de SNX1 y SNX2 en la asociación de Retromer con endosomas y el tráfico de receptores de manosa 6-fosfato" . Mol . Cell. Biol . 27 (3): 1112– 24. doi : 10.1128/MCB.00156-06 . PMC 1800681. PMID 17101778 .  
  • Hierro A, Rojas AL, Rojas R, et  al. (2007). "Arquitectura funcional del complejo de reconocimiento de carga del retromero" . Nature . 449 ( 7165): 1063– 7. Bibcode : 2007Natur.449.1063H . doi : 10.1038/nature06216 . PMC 2377034. PMID 17891154 .  

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