Hispanopedia WikiLa reparación de parches muy cortos (VSP, por sus siglas en inglés) es un sistema de reparación del ADN que elimina los desajustes GT creados por la desaminación de la 5-metilcitosina a timina . Este sistema existe porque las glicosilasas que normalmente actúan sobre las bases desaminadas no pueden actuar sobre la timina (una de las cuatro bases regulares del ADN).
Los componentes del sistema son MutS, que se une al desajuste GT, la endonucleasa VSR, que corta el ADN, y MutL, que recluta la helicasa UvrD .
Las endonucleasas VSR (reparación de parches muy cortos) se encuentran en diversas bacterias . Su función es cortar, o mejor dicho, crear una muesca en el ADN si el par de bases está mutado o dañado.
Función
Las mutaciones en los pares de bases del ADN pueden ser perjudiciales para el organismo. En particular, las mutaciones de C a T ocurren con bastante frecuencia debido a la metilación de la citosina. Por lo tanto, las endonucleasas VSR tienen la función de proteger a la célula del daño causado por el ADN mutado.
Mecanismo
VSR reconoce un par de bases TG mal emparejadas , generado tras la desaminación espontánea de citosinas metiladas , y crea una muesca en una sola hebra al escindir el esqueleto de fosfato en el extremo 5' de la timina. [ 1 ] Luego, la ADN polimerasa I elimina la T y algunos nucleótidos en la hebra 3' y luego resintetiza el parche. [ 2 ]
Además, los desajustes GT pueden provocar mutaciones de transición C-a-T si no se reparan . VSR repara los desajustes a favor de la hebra que contiene G. En Escherichia coli , esta endonucleasa corta el ADN de doble cadena dentro de la secuencia CT(AT)GN o NT(AT)GG junto al residuo de timidina , que está desajuste con 2'-desoxiguanosina. [ 3 ] La incisión depende del desajuste y es específica de la hebra.
Estructura
La estructura de VSR es similar a la estructura central de las endonucleasas de restricción, que tienen una topología alfa/beta/alfa de 3 capas. [ 4 ]
La proteína VSR posee tres residuos aromáticos ( Phe67 , Trp68 y Trp86) que se intercalan en el surco mayor , doblando el ADN y separando las dos hebras. El dominio N-terminal estabiliza la interacción entre la proteína y el producto de escisión, protegiendo así la muesca de la ADN ligasa hasta la llegada de la ADN polimerasa I.
Referencias
- ↑ Tsutakawa SE, Jingami H, Morikawa K (diciembre de 1999). "Reconocimiento de un desajuste TG: la estructura cristalina de la endonucleasa de reparación de parches muy cortos en complejo con un dúplex de ADN" . Cell . 99 ( 6): 615–23 . doi : 10.1016/s0092-8674(00)81550-0 . PMID 10612397. S2CID 17458432 .
- ↑ Polosina YY, Cupples CG (2009). "Los cambios en la conformación del dominio amino-terminal de la endonucleasa Vsr acompañan la escisión del ADN" . J Biochem . 146 (4): 523–6 . doi : 10.1093/jb/mvp095 . PMID 19556224 .
- ↑ Bhagwat AS, Lieb M (junio de 2002). "Cooperación y competencia en la reparación de errores de apareamiento: reparación de parches muy cortos y reparación de errores de apareamiento dirigida por metilo en Escherichia coli" . Mol . Microbiol . 44 (6): 1421–8 . doi : 10.1046/j.1365-2958.2002.02989.x . PMID 12067333. S2CID 44319240 .
- ↑ Bunting KA, Roe SM, Headley A, Brown T, Savva R, Pearl LH (marzo de 2003). "Estructura cristalina de la endonucleasa de reparación de ADN de parche muy corto dcm de Escherichia coli unida a su sitio de producto de reacción en una superhélice de ADN" . Nucleic Acids Res . 31 (6): 1633–9 . doi : 10.1093/nar/gkg273 . PMC 152875. PMID 12626704 .
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