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Articulo de referencia

XPNPEP3

La aminopeptidasa Xaa-Pro 3 , también conocida como aminopeptidasa P3 , es una enzima codificada en humanos por el gen XPNPEP3 . [ 1 ] [ 2 ] XPNPEP3 se localiza en las mitocondr...

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La aminopeptidasa Xaa-Pro 3 , también conocida como aminopeptidasa P3 , es una enzima codificada en humanos por el gen XPNPEP3 . [ 1 ] [ 2 ] XPNPEP3 se localiza en las mitocondrias de las células renales y en los túbulos renales , siguiendo un patrón específico para cada tipo celular. Se han identificado mutaciones en el gen XPNPEP3 como causa de una enfermedad similar a la nefronoptisis . [ 2 ]

Estructura

Gene

El gen XPNPEP3 se localiza en el cromosoma 22q 13.2 y consta de 12 exones . Existen dos variantes de empalme de XPNPEP3, APP3m y APP3c, presentes en las mitocondrias y el citosol , respectivamente. [ 3 ] [ 4 ]

Proteína

APP3m posee un dominio de secuencia de direccionamiento mitocondrial (MTS) N-terminal que permite su importación a las mitocondrias, donde dicho dominio se elimina proteolíticamente y APP3m funciona como una proteína madura de 51 kDa. Por el contrario, APP3c carece del dominio MTS y se expresa en el citosol. [ 3 ] La arginina presente en el dominio MTS es esencial para el transporte mitocondrial. [ 5 ]

Función

XPNPEP3 pertenece a una familia de X-pro-aminopeptidasas (EC 3.4.11.9) que utilizan un cofactor metálico y eliminan el aminoácido N-terminal de péptidos con un residuo de prolina en la penúltima posición. [ 4 ] Se ha descubierto que, tras la estimulación con factor de necrosis tumoral, XPNPEP3 se libera de las mitocondrias. XPNPEP3 es un nuevo miembro del complejo de señalización TNF-TNFR2 y participa en el mecanismo de transducción de la señal TNFR2 , que activa las vías JNK1 y JNK2 . También se observa que la muerte celular aumenta tras la regulación negativa de XPNPEP3, lo que sugiere que XPNPEP3 ejerce una función antiapoptótica. [ 3 ] La deleción de icp55, el ortólogo de XPNPEP3 en S. cerevisiae, aumenta la tasa proteolítica de sus sustratos a través de una vía de degradación de proteínas caracterizada por la regla del extremo N. [ 6 ] [ 7 ]

Importancia clínica

Las mutaciones en el gen XPNPEP3 están asociadas con ciliopatía . [ 8 ] Las mutaciones recesivas en el gen XPNPEP3 se han identificado como causa de una enfermedad similar a la nefronoptisis, caracterizada por infiltración intersticial renal con fibrosis, atrofia tubular con alteración de la membrana basal y desarrollo de quistes en el borde corticomedular renal. [ 9 ] La variabilidad fenotípica podría atribuirse a diferentes grados de pérdida de función para los 2 alelos homocigotos XPNPEP3 diferentes . [ 2 ] Los fenotipos ciliares desenmascarados por la pérdida de XPNPEP3 podrían surgir de la pérdida del procesamiento de proteínas ciliares dependiente de XPNPEP3.

Interacciones

Referencias

  1. ↑ "Entrez Gene: X-prolil aminopeptidasa (aminopeptidasa P) 3" .
  2. 1 2 3 O'Toole JF, Liu Y, Davis EE, et al. (marzo de 2010). "Individuos con mutaciones en XPNPEP3, que codifica una proteína mitocondrial, desarrollan una nefropatía similar a la nefronoptisis" . J. Clin. Invest . 120 (3): 791– 802. doi : 10.1172/JCI40076 . PMC 2827951. PMID 20179356 .   
  3. 1 2 3 4 Inoue, Masaki; Kamada, Haruhiko; Abe, Yasuhiro; Higashisaka, Kazuma; Nagano, Kazuya; Mukai, Yohei; Yoshioka, Yasuo; Tsutsumi, Yasuo; Tsunoda, Shin-Ichi (15 de febrero de 2015). "La aminopeptidasa P3, un nuevo miembro del complejo de señalización TNF-TNFR2, induce la fosforilación de JNK1 y JNK2" . Revista de ciencia celular . 128 (4): 656– 669. doi : 10.1242/jcs.149385 . ISSN 1477-9137 . PMID 25609706 .  
  4. 1 2 Erşahin, C; Szpaderska, AM; Orawski, AT; Simmons, WH (15 de marzo de 2005). "Expresión de la isoenzima aminopeptidasa P en tejidos humanos y fracciones de células mononucleares de sangre periférica". Archives of Biochemistry and Biophysics . 435 (2): 303– 10. doi : 10.1016/j.abb.2004.12.023 . PMID 15708373 . 
  5. ↑ Whatcott, Clifford J.; Meyer-Ficca, Mirella L.; Meyer, Ralph G.; Jacobson, Myron K. (10 de diciembre de 2009). "Una isoforma específica de la poli(ADP-ribosa) glicohidrolasa se dirige a la matriz mitocondrial mediante una secuencia de direccionamiento mitocondrial N-terminal" . Experimental Cell Research . 315 (20): 3477– 3485. doi : 10.1016/j.yexcr.2009.04.005 . ISSN 1090-2422 . PMC 2787692. PMID 19389396 .   
  6. ↑ Weller, Michael (1 de octubre de 2010). "Quimioterapia para gliomas de bajo grado: ¿Cuándo? ¿Cómo? ¿Cuánto tiempo?" . Neuro-Oncología . 12 (10): 1013. doi : 10.1093 / neuonc/noq137 . ISSN 1522-8517 . PMC 3018930. PMID 20861092 .   
  7. ↑ Varshavsky, Alexander (1 de agosto de 2011). "La vía de la regla del extremo N y su regulación por proteólisis" . Protein Science . 20 (8): 1298– 1345. doi : 10.1002/pro.666 . ISSN 1469-896X . PMC 3189519. PMID 21633985 .   
  8. ↑ Hurd TW, Hildebrandt F (2011). " Mecanismos de la nefronoptisis y ciliopatías relacionadas" . Nephron Exp. Nephrol . 118 (1): e9– e14. doi : 10.1159/000320888 . PMC 2992643. PMID 21071979 .  
  9. ↑ Hildebrandt, F; Zhou, W (junio de 2007). "Ciliopatías asociadas a nefronoptisis" . Journal of the American Society of Nephrology . 18 (6): 1855– 71. doi : 10.1681/asn.2006121344 . PMID 17513324 . 
  10. ^ Khanna, Hemant; Davis, Erica E.; Murga-Zamalloa, Carlos A.; Estrada-Cuzcano, Alejandro; López, Irma; den Hollander, Anneke I.; Zonneveld, Marijke N.; Othman, Mohammad I.; Waseem, Naushin (1 de junio de 2009). "Un alelo común en RPGRIP1L es un modificador de la degeneración de la retina en las ciliopatías" . Genética de la Naturaleza . 41 (6): 739– 745. doi : 10.1038/ng.366 . ISSN 1546-1718 . PMC 2783476 . PMID 19430481 .   
  11. ↑ Baala, Lekbir; Audollent, Sophie; Martinovic, Jéléna; Ozilou, Catherine; Babron, Marie-Claude; Sivanandamoorthy, Sivanthiny; Saunier, Sophie; Salomon, Rémi; Gonzales, Marie (2007-07-01). "Los efectos pleiotrópicos de las mutaciones CEP290 (NPHP6) se extienden al síndrome de Meckel" . American Journal of Human Genetics . 81 (1): 170– 179. doi : 10.1086/519494 . ISSN 0002-9297 . PMC 1950929. PMID 17564974 .   

Lecturas adicionales

  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et  al. (2004). "Un enfoque basado en la anotación del genoma para clonar el ORFeoma humano" . Genome Biol . 5 (10) R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604. PMID 15461802 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et  al. (1999). "La secuencia de ADN del cromosoma 22 humano" . Nature . 402 (6761): 489– 95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 . 
  • Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et  al. (2004). "Un mapa físico y funcional de la vía de transducción de señales TNF-alfa/NF-kappa B humana". Nat . Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216. S2CID 11683986 .  
  • Barbe L, Lundberg E, Oksvold P, et  al. (2008). "Hacia un atlas subcelular confocal del proteoma humano" . Mol. Cell. Proteomics . 7 (3): 499– 508. doi : 10.1074/mcp.M700325-MCP200 . PMID 18029348 .