Hispanopedia WikiLa proteína de dedo de zinc 184 , también conocida como ZNF184 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen ZNF184 [ 5 ] en el cromosoma 6. Fue identificada por primera vez por Goldwurm et al. en 1996. [ 6 ]
La entrada de la base de datos de genes del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [ 5 ] para ZNF184 identifica dominios conservados KRAB_A ( caja asociada a Krüppel ) cerca del extremo N y Zn-finger ( dedo de zinc ) en el extremo C de la proteína traducida. El primero está asociado con la represión de la transcripción [ 7 ] y el segundo con la unión al ADN (véase Dedo de zinc ).
Dominios y estructura
La figura siguiente es una representación de traducción conceptual reformateada y anotada del CDS de consenso de ZNF184 . [ 8 ] El CCDS muestra los exones en fuente alternada en negro y azul, con el rojo indicando un residuo codificado a través de un límite de empalme.
ZNF184 posee 19 motivos de dedos de zinc al final de su último y más largo exón. La figura muestra regularidad entre los dedos de esta proteína, incluyendo las dos columnas de residuos de cisteína resaltados en verde y las dos columnas de residuos de histidina resaltados en azul, que son la razón por la cual este tipo de dedo de zinc se denomina C2H2 . Las columnas resaltadas en gris claro (una con todos los residuos de F; otra con principalmente L y sustituciones de F) son residuos hidrofóbicos altamente conservados dentro del motivo del dedo de zinc. La otra columna resaltada en gris claro (principalmente K, con una sustitución de R similar) es un ejemplo de conservación bastante fuerte en las secciones de hélice que conectan los dedos adyacentes.
Cerca del extremo N-terminal se encuentra un dominio KRAB_A seguido de un dominio KRAB_B. KRAB_A presenta una hélice α más corta seguida de una más larga. Se sabe que el motivo KRAB_A en una proteína de dedo de zinc se une a una proteína KAP-1 ( también conocida como TRIM28 ) para ejercer una función represora de la transcripción; sin embargo, aún no se ha identificado un gen regulado por ZNF184. Se indican las hélices de 11 residuos de cada dedo, así como la sección superpuesta de 7 residuos en cada uno, que se une al ADN diana (si el dedo es funcional).
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000096654 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000006720 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 "Entrez Gene: proteína de dedo de zinc 184" .
- ↑ Goldwurm S, Menzies ML, Banyer JL, Powell LW, Jazwinska EC (1997-03-15). "Identificación de un nuevo gen de dedo de zinc relacionado con Krueppel (ZNF184) que se localiza en 6p21.3". Genomics . 40 (3): 486– 9. doi : 10.1006/geno.1996.4583 . PMID 9073517 .
- ↑ Peng H, Begg GE, Harper SL, Friedman JR, Speicher DW, Rauscher III FJ (2000-03-30). "Análisis bioquímico del dominio de represión transcripcional de la caja asociada a Kruppel (KRAB)" . Journal of Biological Chemistry . 275 (24): 18000– 10. doi : 10.1074/jbc.M001499200 . PMID 10748030 .
- ↑ "CDS de consenso: proteína de dedo de zinc 184" .
Lecturas adicionales
- Iuchi, Shiro; Kuldell, Natalie, eds. (2005). Proteínas de dedos de zinc: del contacto atómico a la función celular . Molecular Biology Intelligence Unit. Landes Bioscience/Eurekah.com y Kluwer Academic/Plenum Publishers. ISBN 978-0-306-48229-8.
- Shi J, Levinson DF, Duan J, et al. (2009). "Variantes comunes en el cromosoma 6p22.1 están asociadas con la esquizofrenia" . Nature . 460 ( 7256): 753–7 . Bibcode : 2009Natur.460..753S . doi : 10.1038/nature08192 . PMC 2775422. PMID 19571809 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos" . Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
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- Barbe L, Lundberg E, Oksvold P, et al. (2008). "Hacia un atlas subcelular confocal del proteoma humano" . Mol. Cell. Proteomics . 7 (3): 499– 508. doi : 10.1074/mcp.M700325-MCP200 . PMID 18029348 .
- Genes en el cromosoma 6 humano