Articulo de referencia

virofago Zamilon

Duponchel, S. and Fischer, M.G. (2019) \"Viva lavidaviruses! Five features of virophages that parasitize giant DNA viruses\". ''PLoS pathogens'', '''15'''(3). {{doi|10.1371/jour...

El virófago Zamilon , o Zamilon , es un virófago , un grupo de pequeños virus de ADN que infectan protistas y requieren un virus auxiliar para replicarse; son un tipo de virus satélite . [ 2 ] Descubierto en 2013 en Túnez, infectando amebas Acanthamoeba polyphaga , Zamilon se asemeja más a Sputnik , el primer virófago descubierto. Su nombre es árabe y significa "el vecino". [ 3 ] Su partícula esférica tiene un diámetro de 50 a 60 nm y contiene un genoma de ADN circular de doble cadena de alrededor de 17 kb, que se predice que codifica 20 polipéptidos . Se ha identificado una cepa relacionada, Zamilon 2 , en Norteamérica.  

Todos los virofagos conocidos están asociados con virus auxiliares de la familia de virus de ADN gigantes Mimiviridae . Zamilon tiene un rango restringido de virus auxiliares; puede ser apoyado por virus de los linajes B y C de Mimiviridae , similares a Mimivirus , pero no del linaje A. Esto parece ser consecuencia de un sistema inmunitario rudimentario del virus auxiliar, denominado MIMIVIRE (elemento de resistencia al virofago mimivirus), similar a la vía CRISPR-Cas . [ 4 ] A diferencia del virofago Sputnik, Zamilon no parece afectar la replicación de su virus auxiliar.

Zamilon fue descubierto en 2013, en amebas Acanthamoeba polyphaga coinfectadas con el virus gigante Mont1 , aislado de una muestra de suelo tunecino. [ 2 ] [ 3 ] [ 5 ] Hasta 2015, Zamilon es uno de los tres virófagos que se han aislado físicamente, siendo los otros Sputnik y Mavirus ; se han descubierto varios otros ADN de virófagos utilizando metagenómica pero no se han caracterizado físicamente. [ 2 ] [ 6 ] Una cepa relacionada, llamada Zamilon 2, fue descubierta mediante análisis metagenómico de un biorreactor de astillas de madera de álamo norteamericano en 2015. [ 7 ] Otro virófago, Rio Negro , también está estrechamente relacionado con Sputnik. [ 2 ]

Taxonomía

El virófago Zamilon ha sido clasificado por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus en la especie Sputnikvirus zamilonense dentro del género Sputnikvirus en la familia Sputniviroviridae . [ 8 ] [ 9 ]

Virología

Un virión de Zamilon es esférico con un diámetro de 50–60  nm, y es similar en apariencia a los de Sputnik y Mavirus. [ 3 ] Su genoma de ADN circular de doble cadena tiene una longitud de 17.276 pares de bases . [ 2 ] [ 3 ] Los virófagos suelen tener partículas cuyo diámetro está en el rango de 40–80 nm, con genomas en el rango de 17–30 kb. [ 2 ] El virófago más estrechamente relacionado con Zamilon es Sputnik, con el que comparte un 76% de identidad de secuencia, aunque parte de la secuencia de Zamilon está invertida en comparación con Sputnik. [ 2 ] [ 3 ] El ADN de Zamilon es rico en bases de adenina y timina ; la proporción de bases de guanina y citosina es del 29,7%. [ 3 ]   

Marcos de lectura abiertos

Se predice que el genoma de Zamilon contiene 20 marcos de lectura abiertos (ORF), de entre 222  y 2337  bases de longitud. De los 20 productos predichos, 15 son similares a los de Sputnik, y tres son similares a Mimiviridae : dos a Megavirus chilensis y otro al transpovirón de Moumouvirus monve . Un ORF de Zamilon muestra además cierta similitud con Mavirus , y otro con el virófago de Organic Lake y un virófago de Phaeocystis globosa , ambos asociados a algas en lugar de amebas. Los dos productos predichos restantes muestran una similitud limitada con otras proteínas conocidas. Las funciones putativas de los productos incluyen transposasa , helicasa , integrasa , proteasa de cisteína , primasa de ADN - polimerasa y enzimas ATPasa de empaquetamiento de ADN, proteínas de la cápside mayor y menor , una proteína estructural y una proteína similar al colágeno . [ 3 ] ORF6 es muy similar a la proteína principal de la cápside del Sputnik, que tiene un doble pliegue de " rollo de gelatina ". [ 3 ] [ 10 ]

Ciclo de vida y virus auxiliar

Como todos los demás virófagos, Zamilon se replica en el citoplasma , dentro de la fábrica de virus de su ayudante, que actúa como su huésped. [ 3 ] Zamilon fue aislado por primera vez en asociación con Mont1 , un Mimiviridae similar a Mimivirus clasificado en el linaje C por su secuencia del gen de la polimerasa B. Posteriormente se ha demostrado que el virófago es capaz de replicarse en asociación con Moumouvirus y Monve , dos Mimiviridae del linaje B, así como con Terra1 y Courdo11 del linaje C; sin embargo, no puede replicarse en asociación con Mimivirus ni con Mamavirus , clasificados como linaje A. [ 3 ] [ 11 ] Esto es diferente de Sputnik, que puede replicarse en asociación con cualquier miembro de Mimiviridae similar a Mimivirus . [ 3 ]

Zamilon no parece inhibir significativamente la capacidad de su virus auxiliar para replicarse, ni para lisar las células de las amebas hospedadoras. Aunque el virus auxiliar formó una alta proporción de viriones anormales en presencia de Zamilon, estos también se observaron en un nivel comparable en ausencia del virófago. [ 3 ] Esto es diferente de Sputnik, que reduce la infectividad de su virus auxiliar, inhibe su lisis de la ameba y se asocia con la generación de una mayor proporción de viriones anormales de Mimiviridae . [ 2 ] [ 3 ] Bernard La Scola y sus colegas, quienes aislaron tanto Sputnik como Zamilon, afirman que, de confirmarse, esto "cuestionaría el concepto de virófago", que se ha considerado diferente de la mayoría de los demás virus satélite por tener un efecto deletéreo sobre su virus auxiliar. [ 3 ]

Referencias

  1. Todos los datos de Gaia et al . [ 3 ]
  1. Duponchel, S. y Fischer, MG (2019) «¡Viva lavidavirus! Cinco características de los virófagos que parasitan virus de ADN gigantes». PLoS pathogens , 15 (3). doi : 10.1371/journal.ppat.1007592 .El material se copió de esta fuente, que está disponible bajo una licencia Creative Commons Attribution 4.0 International .
  2. 1 2 3 4 5 6 7 8 Krupovic M, Kuhn JH, Fischer MG (2016), "Un sistema de clasificación para virófagos y virus satélite", Archives of Virology , 161 (1): 233–47 , doi : 10.1007/s00705-015-2622-9 , hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F , PMID 26446887 
  3. ^ " Zamilon , un nuevo virófago con especificidad de huésped Mimiviridae " , PLOS One , 9 ( 4 ) e94923 , Código Bib : 2014PLoSO...994923G , doi : 10.1371/journal.pone.0094923 , PMC 3991649 , PMID 24747414  
  4. ^ Levasseur A, Bekliz M, Chabrière E, Pontarotti P, La Scola B, Raoult D (2016), "MIMIVIRE es un sistema de defensa en mimivirus que confiere resistencia a los virófagos", Nature , 531 (7593): 249– 252, Bibcode : 2016Natur.531..249L , doi : 10.1038/naturaleza17146 , PMID 26934229 , S2CID 4382855  
  5. Boughalmi M, Saadi H, Pagnier I, Colson P, Fournous G, Raoult D, La Scola B (2013), "Aislamiento de alto rendimiento de virus gigantes de las familias Mimiviridae y Marseilleviridae en el entorno tunecino", Environmental Microbiology , 15 (7): 2000– 7, doi : 10.1111/1462-2920.12068 , PMID 23298151 
  6. Yutin N, Kapitonov VV, Koonin EV (2015), "Una nueva familia de virófagos híbridos del metagenoma intestinal de un animal", Biology Direct , 10 : 19, doi : 10.1186/s13062-015-0054-9 , PMC 4409740 , PMID 25909276  
  7. Bekliz M, Verneau J, Benamar S, Raoult D, La Scola B, Colson P (2015), "Un nuevo genoma parcial de virófago similar a Zamilon ensamblado a partir de un metagenoma de biorreactor", Frontiers in Microbiology , 6 : 1308, doi : 10.3389/fmicb.2015.01308 , PMC 4661282 , PMID 26640459  
  8. "Taxonomía de virus: publicación de 2024" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 16 de marzo de 2025 .
  9. "Historia del taxón: Especie: Sputnikvirus zamilonense (Versión 2024, MSL #40)" . Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Consultado el 16 de marzo de 2025 .
  10. Zhang X, Sun S, Xiang Y, Wong J, Klose T, Raoult D, Rossmann MG (2012), "Estructura de Sputnik, un virófago, a una resolución de 3,5 Å", Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América , 109 (45): 18431–36 , Bibcode : 2012PNAS..10918431Z , doi : 10.1073/pnas.1211702109 , PMC 3494952 , PMID 23091035  
  11. ^ Aherfia S, La Scola B, Pagniera I, Raoult D, Colson P (2014), "La familia en expansión Marseilleviridae ", Virología , 466– 467: 27– 37, doi : 10.1016/j.virol.2014.07.014 , PMID 25104553 
  • Número de acceso de GenBank NC_022990.1
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