Articulo de referencia

ANKS1A

La proteína 1A que contiene repeticiones de anquirina y dominio SAM (ANKS1A), también conocida como ODIN, es una proteína que en humanos está codificada por el gen ANKS1A en el ...

La proteína 1A que contiene repeticiones de anquirina y dominio SAM (ANKS1A), también conocida como ODIN, es una proteína que en humanos está codificada por el gen ANKS1A en el cromosoma 6. [ 5 ] [ 6 ]

Se expresa de forma ubicua en muchos tejidos y tipos celulares. [ 7 ] Se sabe que ODIN regula las vías de señalización del receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) y del receptor EphA . [ 8 ] Como diana de la quinasa de la familia Src , ODIN se ha relacionado con el desarrollo del cáncer . [ 9 ] El gen ANKS1A también contiene uno de los 27 SNP asociados con un mayor riesgo de enfermedad de las arterias coronarias . [ 10 ]

Estructura

Gene

El gen ANKS1A se encuentra en el cromosoma 6, en la banda 6p21.31, e incluye 29 exones . [ 6 ] Este gen produce 2 isoformas mediante empalme alternativo . [ 11 ]

Proteína

ODIN es un miembro de la familia ANKS (que contiene repeticiones de anquirina y dominios con motivo alfa estéril) y contiene 6 repeticiones de anquirina , 1 dominio de unión a fosfotirosina (PTD) y 2 dominios con motivo alfa estéril en tándem (SAM) . [ 11 ] [ 12 ] El primer dominio SAM se une al dominio SAM del receptor EphA2 adoptando una conformación de bucle medio/hélice terminal y puede regular la endocitosis de EphA2 . [ 12 ] [ 13 ]

Función

ODIN se expresa ampliamente en tejidos que incluyen corazón , cerebro , placenta , pulmón , hígado , músculo esquelético , riñón y páncreas . [ 14 ] ODIN ha sido identificado como una de las proteínas fosforiladas en tirosina inducidas por la activación del factor de crecimiento epidérmico o las tirosina quinasas del receptor del factor de crecimiento derivado de plaquetas . [ 14 ] ODIN está involucrado en la regulación negativa de la vía de señalización del EGFR . [ 8 ] Se informa que el nivel de ODIN está correlacionado con el grado de aumento del tráfico de EGFR inducido por EGF para reciclar endosomas y reciclar de vuelta a la superficie celular , lo que sugiere un papel en el reciclaje del EGFR. [ 15 ] Además, ODIN actúa como una proteína adaptadora clave que regula la vía de señalización del receptor EphA, que es crítica para regular la migración celular mediada por EphA8 y el crecimiento de neuritas . [ 16 ] [ 17 ] Se ha demostrado que la eliminación del dominio de unión a fosfotirosina en ODIN conduce a un órgano subcomisural (SCO) desarrollado de forma inmadura con un fenotipo hidrocefálico grave del mesencéfalo , lo que significa que ODIN también desempeña un papel en el desarrollo adecuado del SCO y en las células ependimarias del acueducto cerebral . [ 18 ]

Importancia clínica

Como un nuevo objetivo de las quinasas de la familia Src , que están implicadas en el desarrollo de algunos cánceres colorrectales, ODIN puede estar involucrado en los mecanismos de señalización de las células cancerosas. [ 19 ] En un estudio, se analizó la expresión de Lck en 64 líneas celulares de cáncer colorrectal . Los análisis de espectrometría de masas de las proteínas purificadas de Lck identificaron posteriormente varias proteínas conocidas como sustratos de la quinasa SFK, incluyendo cortactina, Tom1L1 (SRCASM), GIT1, vimentina y AFAP1L2 (XB130). También se detectaron proteínas adicionales previamente reportadas como sustratos de otras tirosina quinasas , incluyendo ODIN. ODIN fue analizado más a fondo y se encontró que contenía sustancialmente menos pY tras la inhibición de la actividad de SFK en células SW620, lo que indica que es un objetivo de SFK previamente desconocido en células de carcinoma colorrectal. [ 19 ] Además, se ha descubierto que ODIN regula el transporte anterógrado mediado por COPII de las tirosina quinasas receptoras, que es un mecanismo crítico en el proceso de tumorogénesis. [ 20 ]

Marcador clínico

Un estudio de puntuación de riesgo genético multilocus basado en una combinación de 27 loci , incluido el gen ANKS1A, identificó individuos con mayor riesgo de eventos de enfermedad coronaria incidentes y recurrentes , así como un mayor beneficio clínico de la terapia con estatinas . El estudio se basó en un estudio de cohorte comunitario (el estudio Malmö Diet and Cancer) y cuatro ensayos controlados aleatorizados adicionales de cohortes de prevención primaria (JUPITER y ASCOT) y cohortes de prevención secundaria (CARE y PROVE IT-TIMI 22). [ 10 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000064999 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000024219 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ^ Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Ohira M, Kawarabayasi Y, Ohara O, Tanaka A, Kotani H, Miyajima N, Nomura N (octubre de 1996). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. VI. Las secuencias codificantes de 80 nuevos genes (KIAA0201-KIAA0280) deducidas mediante análisis de clones de ADNc de la línea celular KG-1 y de cerebro" . Investigación del ADN . 3 (5): 321– 9, 341– 54. doi : 10.1093/dnares/3.5.321 . PMID 9039502 . 
  6. 1 2 "Gen Entrez: ANKS1A que contiene un dominio con repetición de anquirina y motivo alfa estéril 1A" .
  7. "BioGPS - tu sistema de portal genético" . biogps.org . Consultado el 10 de octubre de 2016 .
  8. 1 2 Kristiansen TZ, Nielsen MM, Blagoev B, Pandey A, Mann M (agosto de 2004). "Los fibroblastos embrionarios de ratón derivados de ratones deficientes en Odin muestran un fenotipo hiperproliferativo". DNA Research . 11 (4): 285– 92. PMID 15500253 . 
  9. Emaduddin M, Edelmann MJ, Kessler BM, Feller SM (2008-01-01). "Odin (ANKS1A) es un objetivo de la quinasa de la familia Src en células de cáncer colorrectal" . Cell Communication and Signaling . 6 : 7. doi : 10.1186/1478-811X-6-7 . PMC 2584000. PMID 18844995 .  
  10. 1 2 Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ, Nordio F, Hyde CL, Cannon CP, Sacks FM, Poulter NR, Sever PS, Ridker PM, Braunwald E, Melander O, Kathiresan S, Sabatine MS (junio de 2015). "Riesgo genético, eventos de enfermedad coronaria y el beneficio clínico de la terapia con estatinas: un análisis de ensayos de prevención primaria y secundaria" . Lancet . 385 (9984): 2264–71 . doi : 10.1016/S0140-6736(14 ) 61730-X . PMC 4608367. PMID 25748612 .  
  11. 1 2 "ANKS1A - Proteína 1A que contiene repeticiones de anquirina y dominio SAM - Homo sapiens (Humano) - Gen y proteína ANKS1A" . www.uniprot.org . Consultado el 10 de octubre de 2016 .
  12. 1 2 Mercurio FA, Marasco D, Pirone L, Pedone EM, Pellecchia M, Leone M (marzo de 2012). " Estructura en solución del primer dominio Sam de Odin y estudios de unión con el receptor EphA2" . Biochemistry . 51 (10): 2136– 45. doi : 10.1021/bi300141h . PMC 3319784. PMID 22332920 .  
  13. ^ Mercurio FA, Di Natale C, Pirone L, Scognamiglio PL, Marasco D, Pedone EM, Saviano M, Leone M (julio de 2015). "Fragmentos peptídicos de Odin-Sam1: análisis conformacional y estudios de interacción con EphA2-Sam". ChemBioChem . 16 (11): 1629– 36. doi : 10.1002/cbic.201500197 . PMID 26120079 . S2CID 24673174 .  
  14. 1 2 Pandey A, Blagoev B, Kratchmarova I, Fernandez M, Nielsen M, Kristiansen TZ, Ohara O, Podtelejnikov AV, Roche S, Lodish HF, Mann M (noviembre de 2002). "Clonación de una nueva molécula que contiene un dominio de unión a fosfotirosina, Odin, involucrada en la señalización por receptores tirosina quinasas" . Oncogene . 21 (52): 8029– 36. doi : 10.1038/sj.onc.1205988 . PMID 12439753 . 
  15. Tong J, Sydorskyy Y, St-Germain JR, Taylor P, Tsao MS, Moran MF (2013-01-01). "Odin (ANKS1A) modula el reciclaje y la estabilidad del receptor EGF" . PLOS ONE . 8 (6) e64817. Bibcode : 2013PLoSO...864817T . doi : 10.1371/ journal.pone.0064817 . PMC 3692516. PMID 23825523 .  
  16. Kim J, Lee H, Kim Y, Yoo S, Park E, Park S (abril de 2010). "Los dominios SAM de las proteínas de la familia Anks participan de manera crítica en la modulación de la degradación de los receptores EphA" . Biología Molecular y Celular . 30 (7): 1582–92 . doi : 10.1128/MCB.01605-09 . PMC 2838079. PMID 20100865 .  
  17. Shin J, Gu C, Park E, Park S (diciembre de 2007). "Identificación de proteínas que contienen dominios de unión a fosfotirosina como nuevos objetivos posteriores de la función de señalización de EphA8" . Biología Molecular y Celular . 27 (23): 8113–26 . doi : 10.1128/MCB.00794-07 . PMC 2169194. PMID 17875921 .  
  18. Park S, Lee H, Park S (mayo de 2015). "La expresión in vivo del mutante Odin con deleción de PTB produce hidrocefalia" . Molecules and Cells . 38 (5): 426–31 . doi : 10.14348/molcells.2015.2288 . PMC 4443284. PMID 26018557 .  
  19. 1 2 Emaduddin M, Edelmann MJ, Kessler BM, Feller SM (octubre de 2008). "Odin (ANKS1A) es un objetivo de la quinasa de la familia Src en células de cáncer colorrectal" . Cell Communication and Signaling . 6 : 7. doi : 10.1186/1478-811X-6-7 . PMC 2584000. PMID 18844995 .  
  20. Lee H, Noh H, Mun J, Gu C, Sever S, Park S (septiembre de 2016). "Anks1a regula el transporte anterógrado mediado por COPII de las tirosina quinasas receptoras críticas para la tumorigénesis" . Nature Communications . 7 12799. Bibcode : 2016NatCo...712799L . doi : 10.1038/ncomms12799 . PMC 5027278. PMID 27619642 .  
  • Localización del gen ANKS1A humano en el genoma y página de detalles del gen ANKS1A en el navegador genómico de UCSC .
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q92625 (proteína 1A que contiene repeticiones de anquirina y dominios SAM humanos) en el PDBe-KB .
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : P59672 (proteína 1A que contiene repeticiones de anquirina y dominios SAM de ratón) en el PDBe-KB .

Lecturas adicionales

  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Pandey A, Blagoev B, Kratchmarova I, Fernandez M, Nielsen M, Kristiansen TZ, Ohara O, Podtelejnikov AV, Roche S, Lodish HF, Mann M (noviembre de 2002). "Clonación de una nueva molécula que contiene un dominio de unión a fosfotirosina, Odin, involucrada en la señalización por receptores tirosina quinasas" . Oncogene . 21 (52): 8029–36 . doi : 10.1038/sj.onc.1205988 . PMID 12439753 . 
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .  
  • Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (agosto de 2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión a 14-3-3 in vivo involucradas en la regulación del citoesqueleto y la organización celular" . Current Biology . 14 (16): 1436– 50. Bibcode : 2004CBio...14.1436J . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325 .  
  • Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (noviembre de 2004). "Análisis fosfoproteómico del cerebro de ratón en desarrollo" . Molecular & Cellular Proteomics . 3 (11): 1093–101 . doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 . 
  • Kristiansen TZ, Nielsen MM, Blagoev B, Pandey A, Mann M (agosto de 2004). "Los fibroblastos embrionarios de ratón derivados de ratones deficientes en Odin muestran un fenotipo hiperproliferativo". DNA Research . 11 (4): 285– 92. PMID 15500253 . 
  • Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (junio de 2005). "Análisis proteómico dirigido de 14-3-3 sigma, un efector de p53 comúnmente silenciado en el cáncer" . Molecular & Cellular Proteomics . 4 (6): 785–95 . doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465 .