Hispanopedia WikiEn biología molecular , el dominio proteico motivo alfa estéril (o SAM ) es un módulo de interacción proteica putativo presente en una amplia variedad de proteínas [ 1 ] involucradas en muchos procesos biológicos. El dominio SAM, que se extiende a lo largo de unos 70 residuos, se encuentra en diversos organismos eucariotas [ 2 ] . Se ha demostrado que los dominios SAM se homo- y hetero-oligomerizan, formando múltiples arquitecturas de autoasociación y también se unen a diversas proteínas que no contienen dominios SAM [ 3 ] , aunque con una constante de afinidad baja [ 4 ] .
Los dominios SAM también parecen poseer la capacidad de unirse al ARN . [ 5 ] Smaug , una proteína que ayuda a establecer un gradiente de morfógeno en embriones de Drosophila al reprimir la traducción del ARNm de nanos (nos) , se une a la región 3' no traducida (UTR) del ARNm de nos a través de dos estructuras de horquilla similares. La estructura cristalina 3D de la región de unión al ARN de Smaug muestra un grupo de residuos cargados positivamente en el dominio Smaug-SAM, que podría ser la superficie de unión al ARN. Este potencial electropositivo es único entre todas las estructuras de dominio SAM determinadas previamente y se conserva entre los homólogos de Smaug-SAM. Estos resultados sugieren que el dominio SAM podría tener un papel principal en la unión al ARN.
Los análisis estructurales muestran que el dominio SAM está organizado en un pequeño haz de cinco hélices con dos grandes interfaces. [ 3 ] En el caso del dominio SAM de EPHB2 , cada una de estas interfaces puede formar dímeros. La presencia de estas dos superficies de unión de intermonómeros distintas sugiere que SAM podría formar estructuras poliméricas extendidas. [ 4 ]
SAM fúngico
En biología molecular , el dominio proteico Ste50p se encuentra principalmente en hongos y otros tipos de eucariotas . Desempeña un papel en las cascadas de la proteína quinasa activada por mitógenos , un tipo de señalización celular que ayuda a la célula a responder a estímulos externos, más específicamente al apareamiento, el crecimiento celular y la osmotolerancia [ 6 ] en hongos.
Función
El dominio proteico Ste50p participa en la detección de feromonas para el apareamiento . Se cree que se encuentra unido a Ste11p para prolongar la respuesta de señalización inducida por feromonas. Además, también participa en la respuesta celular a la privación de nitrógeno . [ 7 ]
Estructura
El SAM Ste50p fúngico consta de seis hélices que forman un plegamiento globular compacto . Es un monómero en solución y a menudo experimenta heterodimerización (y en algunos casos oligomerización) de la proteína . [ 7 ]
Interacción de proteínas
El dominio SAM de Ste50p interactúa frecuentemente con el dominio SAM de Ste11p. Mediante esta interacción, forman enlaces . El dominio SAM de una proteína se une al dominio SAM de otra proteína. Los dominios SAM no se autoasocian in vitro. [ 7 ] Existe evidencia significativa de oligomerización de Ste50p in vivo. [ 8 ]
Proteínas humanas que contienen este dominio
ANKS1A ; ANKS1B ; ANKS3 ; ANKS4B ; ANKS6 ; BFAR ; BICC1 ; CASKIN1 ; CASKIN2 ; CENTD1 ; CNKSR2 ; CNKSR3 ; DDHD2 ; EPHA1 ; EPHA10 ; EPHA2 ; EPHA5 ; EPHA6 ; EPHA7 ; EPHA8 ; EPHB1 ; EPHB2 ; EPHB3 ; EPHB4 ; FAM59A ; HPH2 ; INPPL1 ; L3MBTL3 ; APS1 ; APS2 ; APS3 ; PPFIA1 ; PPFIA2 ; PPFIA3 ; PPFIA4 ; PPFIBP1 ; PPFIBP2 ; SAMD1 ; SAMD13 ; SAMD14 ; SAMD3 ; SAMD4A ; SAMD4B ; SAMD5 ; SAMD7 ; SAMD8 ; SAMD9 ; SARM1 ; SCMH1 ; SCML1 ; SCML2 ; SEC23IP ; SGMS1 ; SHANK1 ; SHANK2 ; SHANK3 ; STARD13 ; UBP1 ; USH1G ; ZCCHC14 ; p63 ; p73 ;
Referencias
- ↑ Bork P, Ponting CP, Hofmann K, Schultz J (1997). "SAM como dominio de interacción proteica involucrado en la regulación del desarrollo" . Protein Sci . 6 (1): 249– 253. doi : 10.1002/pro.5560060128 . PMC 2143507. PMID 9007998 .
- ↑ Pawson T, Stapleton D, Balan I, Sicheri F (1999). "La estructura cristalina de un dominio SAM del receptor Eph revela un mecanismo para la dimerización modular". Nat. Struct. Biol . 6 (1): 44– 49. doi : 10.1038/4917 . PMID 9886291 . S2CID 1202526 .
- 1 2 Simon J, Peterson AJ, Kyba M, Bornemann D, Morgan K, Brock HW (1997). "Un dominio compartido por las proteínas del grupo Polycomb Scm y ph media interacciones heterotípicas y homotípicas" . Mol . Cell. Biol . 17 (11): 6683– 6692. doi : 10.1128/MCB.17.11.6683 . PMC 232522. PMID 9343432 .
- 1 2 Goodwill KE, Thanos CD, Bowie JU (1999). "Estructura oligomérica del dominio SAM del receptor EphB2 humano" . Science . 283 (5403): 833– 836. doi : 10.1126/science.283.5403.833 . PMID 9933164 .
- ↑ Bowie JU, Kim CA (2003). "Dominios SAM: estructura uniforme, diversidad de funciones". Trends Biochem. Sci . 28 (12): 625– 628. doi : 10.1016/j.tibs.2003.11.001 . PMID 14659692 .
- ↑ Posas, F.; Witten, EA; Saito, H. (1998). "Requisito de STE50 para la activación inducida por estrés osmótico de la cinasa de la cinasa de la proteína cinasa activada por mitógeno STE11 en la vía de respuesta al glicerol de alta osmolaridad" . Biología molecular y celular . 18 (10): 5788– 5796. doi : 10.1128/mcb.18.10.5788 . PMC 109165. PMID 9742096 .
- 1 2 3 Grimshaw SJ, Mott HR, Stott KM, Nielsen PR, Evetts KA, Hopkins LJ, Nietlispach D, Owen D (enero de 2004). "Estructura del dominio del motivo alfa estéril (SAM) de la proteína STE50 moduladora de la vía de la proteína quinasa activada por mitógeno de Saccharomyces cerevisiae y análisis de su interacción con el SAM de STE11" . J. Biol. Chem . 279 (3): 2192–201 . doi : 10.1074/jbc.M305605200 . PMID 14573615 .
- ↑ Slaughter, BD; Huff JM; Wiegraebe W; Schwartz JW; Li R (2008). "Oligomerización de proteínas basada en el dominio SAM observada mediante espectroscopia de fluctuación de fluorescencia en células vivas" . PLOS ONE . 3 (4) e1931. doi : 10.1371/journal.pone.0001931 . PMC 2291563. PMID 18431466 .
Evolución estructural de p53, p63 y p73: Implicaciones para la formación de heterotetrámeros
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