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APOBEC3B

La probable enzima de edición de ADN dC->dU APOBEC-3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen APOBEC3B . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Este gen pertenece a la familia de g...

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La probable enzima de edición de ADN dC->dU APOBEC-3B es una proteína que en humanos está codificada por el gen APOBEC3B . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Este gen pertenece a la familia de genes de la citidina desaminasa . Es uno de los siete genes o pseudogenes relacionados que se encuentran en un grupo , que se cree que resulta de una duplicación génica , en el cromosoma 22. Los miembros del grupo codifican proteínas que están estructural y funcionalmente relacionadas con la citidina desaminasa APOBEC1 , que edita el ARN de C a U. Se cree que estas proteínas podrían ser enzimas de edición de ARN y desempeñar funciones en el crecimiento o el control del ciclo celular . Este gen, junto con APOBEC3A, se ha asociado en los últimos años con la mutagénesis de varios tipos de cáncer. Las proteínas APOBEC3A y APOBEC3B pueden causar mutaciones específicas en los genomas cancerosos, denominadas mutagénesis APOBEC, y diversos factores, incluidos los genéticos y ambientales, influyen en este patrón de mutación en pacientes, especialmente en aquellos con cáncer de vejiga y de mama. [ 7 ] Este gen también se sobreexpresa en el mieloma múltiple , posiblemente contribuyendo a su formación. [ 8 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000179750 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000009585 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (febrero de 2002). "Un locus específico de antropoides de enzimas huérfanas de edición de ARN C a U en el cromosoma 22". Genomics . 79 (3): 285–96 . doi : 10.1006/geno.2002.6718 . PMID 11863358 . 
  6. ^ Madsen P, Anant S, Rasmussen HH, Gromov P, Vorum H, Dumanski JP, Tommerup N, Collins JE, Wright CL, Dunham I, MacGinnitie AJ, Davidson NO, Celis JE (septiembre de 1999). "La forbolina-1 regulada positivamente por la psoriasis comparte una similitud estructural pero no funcional con la proteína de edición de ARNm apobec-1" . J Invest Dermatol . 113 (2): 162– 9. doi : 10.1046/j.1523-1747.1999.00682.x . PMID 10469298 . 
  7. 1 2 "Entrez Gene: APOBEC3B enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B, polipéptido catalítico similar a 3B" .
  8. ↑ Yamazaki, Hiroyuki; Shirakawa, Kotaro; Matsumoto, Tadahiko; Hirabayashi, Shigeki; Murakawa, Yasuhiro; Kobayashi, Masayuki; Sarca, Anamaría Daniela; Kazuma, Yasuhiro; Matsui, Hiroyuki; Maruyama, Wataru; Fukuda, Hirofumi; Shirakawa, Ryutaro; Shindo, Keisuke; Ri, Masaki; Iida, Shinsuke; Takaori-Kondo, Akifumi (9 de mayo de 2019). "La sobreexpresión endógena de APOBEC3B genera constitutivamente sustituciones y eliminaciones de ADN en células de mieloma" . Informes científicos . 9 (1): 7122. Código Bib : 2019NatSR...9.7122Y . doi : 10.1038/s41598-019-43575- y . PMC 6509214. PMID 31073151 .  

Lecturas adicionales

  • Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Edición de ARN mensajero en mamíferos: nuevos miembros de la familia APOBEC buscan roles en el negocio familiar". Trends Genet . 19 (4): 207– 16. doi : 10.1016/S0168-9525(03)00054-4 . PMID 12683974 . 
  • Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et  al. (1999). "La secuencia de ADN del cromosoma 22 humano" (PDF) . Nature . 402 (6761): 489– 95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 . 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, et  al. (2003). "Exclusión específica de especies de APOBEC3G de los viriones del VIH-1 por Vif" . Cell . 114 (1): 21– 31. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . PMID 12859895 . 
  • Sawyer SL, Emerman M, Malik HS (2006). "Evolución adaptativa antigua de la enzima APOBEC3G de edición de ADN antiviral en primates" . PLOS Biol . 2 (9): E275. doi : 10.1371/journal.pbio.0020275 . PMC 479043. PMID 15269786 .  
  • Yu Q, Chen D, König R, et  al. (2005). "APOBEC3B y APOBEC3C son potentes inhibidores de la replicación del virus de la inmunodeficiencia símica" . J. Biol. Chem . 279 (51): 53379–86 . doi : 10.1074/jbc.M408802200 . PMID 15466872 . 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la colección de genes de mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Rose KM, Marin M, Kozak SL, Kabat D (2005). "Producción regulada y actividades anti-VIH tipo 1 de las citidina deaminasas APOBEC3B, 3F y 3G". AIDS Res. Hum. Retroviruses . 21 (7): 611– 9. doi : 10.1089/aid.2005.21.611 . PMID 16060832 . 
  • Bogerd HP, Wiegand HL, Doehle BP, et  al. (2006). "APOBEC3A y APOBEC3B son potentes inhibidores de la función del retrotransposón LTR en células humanas" . Nucleic Acids Res . 34 (1): 89– 95. doi : 10.1093/nar/gkj416 . PMC 1326241. PMID 16407327 .  
  • Stenglein MD, Harris RS (2006). "APOBEC3B y APOBEC3F inhiben la retrotransposición de L1 mediante un mecanismo independiente de la desaminación del ADN" . J. Biol. Chem . 281 (25): 16837–41 . doi : 10.1074/jbc.M602367200 . PMID 16648136 . 
  • Hakata Y, Landau NR (2007). "Organización funcional invertida de los dominios de la citidina desaminasa APOBEC3 de ratón y humano" . J. Biol. Chem . 281 (48): 36624–31 . doi : 10.1074/jbc.M604980200 . PMID 17020885 . 
  • Kidd JM, Newman TL, Tuzun E, et  al. (2007). "Estratificación poblacional de un polimorfismo de deleción común del gen APOBEC" . PLOS Genet . 3 (4): e63. doi : 10.1371/journal.pgen.0030063 . PMC 1853121. PMID 17447845 .  
  • Un patrón de mutagénesis de la citidina desaminasa APOBEC está muy extendido en los cánceres humanos.

Steven A Roberts, Michael S Lawrence, Leszek J Klimczak, Sara A Grimm, David Fargo, Petar Stojanov, Adam Kiezun, Gregory V Kryukov, Scott L Carter, Gordon Saksena, Shawn Harris, Ruchir R Shah, Michael A Resnick, Gad Getz y Dmitry A Gordenin

  • Candace D Middlebrooks, A Rouf Banday, Konichi Matsuda, et al. Asociación de variantes de la línea germinal en la región APOBEC3 con el riesgo de cáncer y enriquecimiento con mutaciones características de APOBEC en tumores. Nature Genetics 2016.

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