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APOBEC3D

La probable enzima de edición de ADN dC->dU, APOBEC-3D, es una proteína que en humanos está codificada por el gen APOBEC3D . [ 3 ] [ 4 ] Este gen pertenece a la familia de genes...

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La probable enzima de edición de ADN dC->dU, APOBEC-3D, es una proteína que en humanos está codificada por el gen APOBEC3D . [ 3 ] [ 4 ]

Este gen pertenece a la familia de genes de la citidina desaminasa . Es uno de los siete genes o pseudogenes relacionados que se encuentran en un grupo , que se cree que es resultado de una duplicación génica , en el cromosoma 22. Los miembros de este grupo codifican proteínas que están estructural y funcionalmente relacionadas con la citidina desaminasa APOBEC1, que edita el ARN de C a U, e inhiben los retrovirus , como el VIH , mediante la desaminación de residuos de citosina en el ADNc retroviral naciente . [ 4 ]

Función

APOBEC3D es una de las enzimas APOBEC3 humanas implicadas en la restricción del VIH-1 . [ 5 ] [ 6 ] El VIH-1 Vif contrarresta a APOBEC3D reclutando la maquinaria de ubiquitina ligasa, lo que conduce a su poliubiquitinación y degradación proteasómica en las células productoras del virus. [ 5 ] [ 6 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000243811 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  3. ↑ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, et al. (febrero de 2002). "Un locus específico de antropoides de enzimas huérfanas de edición de ARN de C a U en el cromosoma 22". Genomics . 79 (3): 285– 296. doi : 10.1006/geno.2002.6718 . PMID 11863358 .  
  4. 1 2 "Entrez Gene: APOBEC3D enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B, polipéptido catalítico similar 3D (putativo)" .
  5. 1 2 Delviks-Frankenberry KA, Desimmie BA, Pathak VK (mayo de 2020). "Perspectivas estructurales sobre la restricción lentiviral mediada por APOBEC3" . Viruses . 12 ( 6): 587. doi : 10.3390/v12060587 . PMC 7354603. PMID 32471198 .  
  6. 1 2 Feng Y, Baig TT, Love RP, Chelico L (2014). "Supresión de la restricción del VIH-1 mediada por APOBEC3 por Vif" . Frontiers in Microbiology . 5 450. doi : 10.3389/fmicb.2014.00450 . PMC 4144255. PMID 25206352 .  

Lecturas adicionales

  • Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Edición de ARN mensajero en mamíferos: nuevos miembros de la familia APOBEC buscan roles en el negocio familiar". Trends in Genetics . 19 (4): 207– 216. doi : 10.1016/S0168-9525(03)00054-4 . PMID 12683974 . 
  • Harris RS, Liddament MT (2004). "Restricción retroviral por proteínas APOBEC". Nature Reviews. Immunology . 4 (11): 868– 877. doi : 10.1038/nri1489 . PMID 15516966. S2CID 10789405 .  
  • Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, et  al. (Diciembre de 1999). "La secuencia de ADN del cromosoma 22 humano" . Naturaleza . 402 (6761): 489– 495. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 . 
  • Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, et  al. (marzo de 2000). "Secuenciación de escopeta del transcriptoma humano con etiquetas de secuencia expresada ORF" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (7): 3491– 3496. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267. PMID 10737800 .  
  • Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, Navarro F, König R, Bollman B, et  al. (julio de 2003). "Exclusión específica de especies de APOBEC3G de los viriones del VIH-1 por Vif" . Cell . 114 (1): 21–31 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . PMID 12859895 . 
  • Sawyer SL, Emerman M, Malik HS (2006). "Evolución adaptativa antigua de la enzima APOBEC3G de edición de ADN antiviral en primates" . PLoS Biology . 2 (9): E275. doi : 10.1371/journal.pbio.0020275 . PMC 479043. PMID 15269786 .  
  • Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, et  al. (2004). " Un enfoque basado en la anotación del genoma para clonar el ORFeoma humano" . Genome Biology . 5 (10) R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604. PMID 15461802 .  
  • Dang Y, Wang X, Esselman WJ, Zheng YH (2006). "Identificación de APOBEC3DE como otro factor antirretroviral de la familia APOBEC humana" . Journal of Virology . 80 (21): 10522– 10533. doi : 10.1128/JVI.01123-06 . PMC 1641744. PMID 16920826 .  
  • Kinomoto M, Kanno T, Shimura M, Ishizaka Y, Kojima A, Kurata T, et  al. (2007). "Todas las proteínas de la familia APOBEC3 inhiben diferencialmente la retrotransposición de LINE-1" . Nucleic Acids Research . 35 (9): 2955– 2964. doi : 10.1093/nar/gkm181 . PMC 1888823. PMID 17439959 .  
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