ARID1A

La proteína 1A que contiene un dominio interactivo rico en AT es una proteína que en humanos está codificada por el gen ARID1A . ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

ARID1A es un miembro de la familia SWI/SNF , cuyos miembros poseen actividades de helicasa y ATPasa y se cree que regulan la transcripción de ciertos genes alterando la estructura de la cromatina alrededor de esos genes. La proteína codificada es parte del gran complejo de remodelación de la cromatina dependiente de ATP SWI/SNF, que es necesario para la activación transcripcional de genes normalmente reprimidos por la cromatina. La proteína tiene dos grandes regiones intrínsecamente desordenadas (IDR) que median la interacción con socios de unión. ^{[ 8 ]} También posee al menos dos dominios conservados que son importantes para su función. Primero, tiene un dominio ARID , que es un dominio de unión al ADN que puede unirse específicamente a una secuencia de ADN rica en AT que se sabe que es reconocida por un complejo SWI/SNF en el locus de la beta-globina . Segundo, el extremo C-terminal de la proteína puede estimular la activación transcripcional dependiente del receptor de glucocorticoides . La proteína codificada por este gen confiere especificidad al complejo SWI/SNF y lo recluta a sus dianas mediante interacciones proteína-ADN o proteína-proteína. ^{[ 9 ] [ 10 ]} Se han encontrado dos variantes de transcripción que codifican isoformas diferentes para este gen. ^{[ 7 ]}

El gen que codifica ARID1A es la subunidad SWI/SNF que muta con mayor frecuencia en los cánceres. ^{[ 11 ]} Este gen se ha encontrado comúnmente mutado en diferentes cánceres que conducen a la pérdida de función, incluidos los cánceres gástricos , ^{[ 12 ]} cáncer de colon , ^{[ 13 ]} carcinoma de células claras de ovario , ^{[ 14 ]} cáncer de hígado , ^{[ 15 ]} linfoma ^{[ 9 ]} y cáncer de páncreas . ^{[ 16 ]} En el cáncer de mama, las metástasis distantes adquieren mutaciones de inactivación en ARID1A que no se observan en el tumor primario, y la expresión reducida de ARID1A confiere resistencia a diferentes fármacos como trastuzumab e inhibidores de mTOR . Estos hallazgos proporcionan una razón para que los tumores acumulen mutaciones de ARID1A. ^{[ 17 ] [ 18 ]}

La ausencia de este gen/proteína parece proteger a las ratas de algunos tipos de daño hepático. ^{[ 19 ]}

ARID1A interactúa con las subunidades SWI/SNF SMARCB1 ^{[ 20 ] [ 21 ]} y SMARCA4 . ^{[ 21 ] [ 22 ]} Las regiones intrínsecamente desordenadas de ARID1A permiten que el complejo SWI/SNF interactúe con múltiples factores de transcripción a través de la unión del dominio ARM de la beta-catenina . ^{[ 8 ]}

• ARID1A+proteína,+humana en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
• Localización del genoma humano ARID1A y página de detalles del gen ARID1A en el navegador genómico de UCSC .
• Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O14497 (proteína 1A que contiene un dominio interactivo rico en AT) en el PDBe-KB .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .