Azidofenilalanina

La azidofenilalanina ( 4-azido- L -fenilalanina ) es un derivado de aminoácido no natural de la L- fenilalanina , que presenta un grupo azida en la posición para del anillo fenilo . Es un reactivo de química clic bioortogonal que puede incorporarse genéticamente a proteínas mediante técnicas de código genético expandido para el marcaje y la funcionalización sitio-específicos. ^{[ 1 ]} El compuesto actúa como un reportero vibracional de entornos proteicos locales debido a su grupo azida ^{[ 2 ]} y se utiliza en el entrecruzamiento fotoinducido para estudios de interacción proteica. ^{[ 3 ]}

La azidofenilalanina tiene la fórmula molecular C ₉ H ₁₀ N ₄ O ₂ y un peso molecular de 206,20 g/mol. ^{[ 4 ]} Su nombre IUPAC es ácido (2 S )-2-amino-3-(4-azidofenil)propanoico. Se presenta como un sólido blanquecino y es soluble en agua, DMSO y DMF . ^{[ 5 ]}

Al igual que muchas otras azidas , el compuesto aislado presenta propiedades explosivas. ^{[ 5 ] [ 6 ]} Es sensible a la luz y debe almacenarse a -20 °C en la oscuridad.

Se ha descrito una síntesis de azidofenilalanina sin cromatografía. Parte de la L- fenilalanina e incluye la yodación para formar 4-yodo- L -fenilalanina, seguida de la protección con Boc , la azidación catalizada por Cu(I) utilizando azida de sodio ₍ NaN₃ ), la desprotección con ácido sulfúrico y la purificación por recristalización . ^{[ 5 ]} Este método evita los riesgos de explosión asociados a los métodos anteriores.

Como análogo de la L- fenilalanina, la azidofenilalanina se incorpora a las proteínas durante la traducción en lugar de la fenilalanina. ^{[ 7 ]} El grupo azida permite reacciones bioortogonales , como las cicloadiciones de azida-alquino catalizadas por cobre o promovidas por tensión , para la modificación de proteínas.

La azidofenilalanina se emplea en el marcaje metabólico para detectar la síntesis de proteínas nacientes como una alternativa no radiactiva a los métodos tradicionales. Facilita el marcaje de proteínas en sitios específicos para la obtención de imágenes microscópicas, la purificación y los estudios FRET . Entre sus aplicaciones se incluyen el control fotoquímico de proteínas fluorescentes , la síntesis de ligandos para la complejación de metales en EPR / NMR y el estudio de la dinámica de las proteínas durante el plegamiento o la catálisis. Se incorpora mediante pares ortogonales de ARNt/sintetasa en sistemas como E. coli . ^{[ 7 ]}