Hispanopedia WikiCAFASP , o Evaluación Crítica de la Predicción de Estructuras Totalmente Automatizada, es un experimento ciego a gran escala en predicción de estructuras de proteínas que estudia el rendimiento de los servidores web de predicción de estructuras automatizada en modelado de homología , reconocimiento de plegamiento y predicción ab initio de estructuras terciarias de proteínas basadas únicamente en la secuencia de aminoácidos . [ 1 ] El experimento se ejecuta una vez cada dos años en paralelo con CASP , que se centra en predicciones que incorporan la intervención y la experiencia humanas. [ 2 ] En comparación con técnicas de evaluación comparativa relacionadas LiveBench y EVA , que se ejecutan semanalmente contra estructuras de proteínas recién resueltas depositadas en el Protein Data Bank , CAFASP genera muchos menos datos, pero tiene la ventaja de producir predicciones que son directamente comparables a las producidas por expertos en predicción humana. Recientemente, CAFASP se ha ejecutado esencialmente integrado en los resultados de CASP en lugar de como un experimento separado.
Referencias
- ↑ Fischer, D.; Barret, C.; Bryson, K.; Elofsson, A.; Godzik, A.; Jones, D.; Karplus, KJ; Kelley, LA; MacCallum, RM; Pawowski, K.; Rost, B.; Rychlewski, L.; Sternberg, M. (1999). "CAFASP-1: Evaluación crítica de métodos de predicción de estructura totalmente automatizados". Proteins . Suppl 3: 209– 217. doi : 10.1002/(SICI)1097-0134(1999)37:3+ < 209::AID-PROT27 > 3.0.CO ; 2-Y . PMID 10526371 .
- ↑ Bourne, PE (2003). "Experimentos CASP y CAFASP y sus hallazgos". Métodos de análisis bioquímico . 44 : 501–507 . PMID 12647401 .
Enlaces externos
- Centro de Predicción de la Estructura de Proteínas
- CAFASP4 (2004)
- CAFASP5 (2006)
- Bioinformática
- Métodos de proteínas
- Esbozos de bioinformática