CAMEO3D

La Evaluación Automatizada Continua de Modelos (CAMEO) es un proyecto comunitario para evaluar continuamente la precisión y confiabilidad de los servidores de predicción de la estructura de proteínas de manera totalmente automatizada. ^{[ 1 ]} CAMEO es un complemento continuo y totalmente automatizado del experimento bianual CASP . ^{[ 2 ]}

Actualmente, CAMEO evalúa predicciones para estructuras proteicas tridimensionales (3D), predicciones de sitios de unión de ligandos en proteínas (LB) y herramientas de estimación de la calidad del modelo (QE).

CAMEO realiza una evaluación ciega de las técnicas de predicción de la estructura de proteínas basándose en las publicaciones semanales de estructuras experimentales recién determinadas por el Protein Data Bank (PDB) . Las secuencias de aminoácidos de las estructuras de proteínas que pronto se publicarán se envían a los servidores web participantes. Los servidores web devuelven sus predicciones a CAMEO, y las predicciones recibidas antes de que se hayan publicado las estructuras experimentales se incluyen en la evaluación de la precisión de la predicción. A diferencia del experimento CASP , la comparación entre la predicción y los datos de referencia está completamente automatizada y, por lo tanto, requiere medidas de distancia numéricas que sean robustas frente a los movimientos relativos de los dominios . ^{[ 3 ]}

CAMEO se desarrolló como parte del módulo Protein Model Portal ^{[ 4 ]} de la Structural Biology Knowledge Base ^{[ 5 ]} , dentro de la Protein Structure Initiative . CAMEO está siendo desarrollado por el grupo de biología estructural computacional del SIB Swiss Institute of Bioinformatics y el Biozentrum de la Universidad de Basilea .

Proyectos anteriores con objetivos similares fueron EVA y LiveBench .

• Software de predicción de la estructura de proteínas

• Página principal de CAMEO
• Portal de modelos de proteínas