Christensenella hongkongensis

Christensenella hongkongensis es una especie de cocobacilo grampositivo clínicamente relevante , aislado por primera vez de pacientes en Hong Kong y Canadá en 2006. ^{[ 2 ]} Aunque la especie sigue siendo relativamente rara, tiene una alta tasa de mortalidad de hasta el 50%. ^{[ 3 ]} Se cree que Christensenella tiene una amplia distribución mundial, ya que se ha aislado de hemocultivos de pacientes en todo el mundo, incluyendo Hong Kong, Corea del Sur, Nueva Zelanda, Canadá, Suecia, Francia e Italia. Se han observadomenos de 15 casos de C. hongkongensis en todo el mundo. ^{[ 4 ]}

Christensenella hongkongensis es una especie de bacteria perteneciente a la familia Christensenellaceae dentro del filo Bacillota (o Firmicutes ) . Bacillota incluye un grupo diverso de bacterias Gram positivas . Dentro de la clase Clostridia , C. hongkongensis se clasifica además en el orden Clostridiales , distinguiéndose de los bacilos por carecer de respiración aeróbica . ^{[ 5 ]} En consecuencia, C. hongkongensis forma parte del género Christensenella , una bacteria no formadora de esporas, anaeróbica e inmóvil que pertenece a una nueva familia, Christensenella, conocida por su efecto en el intestino mediante la producción de butirato . ^{[ 5 ]}

La secuenciación del gen del ARN ribosomal 16S de Christensenella hongkongensis reveló parientes filogenéticos, con una identidad del 96-97%, con Christensenella minuta , Christensenella massiliensis , Christensenella intestinhominis y Christensenella timonesis . ^{[ 5 ]} Las secuencias del gen del ARNr 16S se recuperaron de NCBI y se alinearon usando MAFT . Se construyó un árbol filogenético usando el método de máxima verosimilitud , donde las ramas cercanas se enumeran a continuación: ^{[ 5 ]}

Christensenella hongkongensis reside en la microbiota intestinal humana, fermentando compuestos orgánicos como el azúcar para producir subproductos como el butirato . ^{[ 14 ]} Además, la bacteria requiere un sustrato o fuente de nutrientes adecuados para su crecimiento, desarrollándose mejor en el ambiente con bajo contenido de oxígeno del colon humano, donde puede fermentar carbohidratos , que le sirven como fuente de energía y carbono. ^{[ 15 ]}

Christensenella hongkongensis es anaeróbica , implicando la fermentación de compuestos orgánicos ; debido a su relación compartida con Christensenella minuta , es probable que pueda utilizar manosa , arabinosa , glucosa , ramnosa , salicina y xilosa para generar energía. ^{[ 14 ]} La fermentación de estos productos también implica la oxidación parcial del piruvato para producir ácidos orgánicos como el butirato . ^{[ 16 ]}

Tras la reclasificación de Catabacter hongkongensis a Christensenella hongkongensis , se utilizó FastANI para realizar comparaciones por pares de la Identidad Nucleotídica Promedio (ANI) entre los seis genomas de ambos géneros. Posteriormente, las similitudes genéticas entre los genomas se representaron gráficamente y se visualizaron utilizando el paquete ggplot 2 de la biblioteca ^de visualización en R. ^{[ 7} ] A continuación, los genomas se analizaron con mayor detalle en función de su composición genética para obtener más información sobre sus vías metabólicas y características genómicas . También se utilizó ABRicate , un software desarrollado para detectar la resistencia antimicrobiana en microorganismos, para identificar genes específicos que confieren dicha resistencia. ^{[ 7 ]}

Al final, los investigadores descubrieron que las seis especies de bacterias tienen tamaños de genoma que van desde 2,5 a 3,3 pares de MegaBase y contienen de 48,52 a 52,07% de contenido de Guanina + Citosina (GC) . ^{[ 7 ]} Los valores ANI de las cepas Catabacteraceae y Christensenellaceae (HKU16T y ABBA15k) también revelaron una similitud del 98,97% entre sus genomas, lo que finalmente indica que las dos cepas pertenecen a la misma especie. ^{[ 7 ]} De manera similar, los seis genomas tuvieron valores ANI que van desde 77,56% y 83,48%, expresando sus similitudes de secuencia de nucleótidos . ^{[ 7 ]} Específicamente, Christensenella intestinihominis (AF73-05CM02PP) y C. minuta (DSM 22607T) exhibieron el valor de similitud ANI más alto de 83,48% entre las diferentes especies, lo que sugiere que tienen la relación genética más cercana a pesar de estar clasificadas como especies distintas. ^{[ 7 ]}

Solo las dos cepas de Christensenella hongkongensis a las que se hizo referencia (HKU16T, ABBA 15k) han sido analizadas y publicadas en sus genomas. ^{[ 17 ]} Por lo tanto, se ha encontrado que C. hongkongensis tiene un contenido promedio de GC del 48,66 % y un tamaño promedio del genoma y recuento de proteínas de 3000377 pares de bases y 2848 proteínas con un recuento de contigs de 123,5. ^{[ 7 ]}

Christensenella hongkongensis es una bacteria estrictamente anaeróbica que tampoco forma esporas y cuyas formas se asemejan a bacilos cortos . Las tinciones de Gram revelaron una tinción variable que dependía de la edad del cultivo, pero generalmente Gram positiva. ^{[ 7 ]} También se confirmó que la especie es móvil y expresa flagelos como lo revelan las tinciones flagelares. ^{[ 8 ]} C. hongkongensis también se identificó como catalasa positiva y tiene un perfil metabólico diverso siendo capaz de utilizar carbohidratos como arabinosa , glucosa , manosa y xilosa . ^{[ 18 ]} La especie expresó crecimiento en agar sangre de oveja y se observó la formación de colonias después de una incubación de 48 horas a 37  °C. ^{[ 8 ]} La bacteria no expresó actividad hemolítica , y tampoco tuvo la capacidad de producir indol o reducir nitrato . ^{[ 8 ]} La investigación y la literatura disponibles sobre la especie no revelaron detalles específicos sobre las condiciones óptimas de crecimiento y los tiempos de generación .

Los síntomas de la infección por C. hongkongensis incluyen fiebre, vómitos, distensión abdominal y estreñimiento. La bacteria ha estado presente en casos de bacteriemia. ^{[ 2 ] [ 19 ]} Para identificar con precisión C. hongkongensis , se recomienda la secuenciación del ARNr 16S. ^{[ 2 ]} Otros métodos de identificación, como MALDI-TOF , no han podido identificar la bacteria correctamente. ^{[ 20 ]}

El tratamiento antibiótico se administra habitualmente en caso de infección por C. hongkongensis . Se ha demostrado que C. hongkongensis es sensible a antibióticos como la kanamicina, la vancomicina , la cefuroxima , la ciprofloxacina y el metronidazol . ^{[ 2 ] [ 3 ]} En un caso, el paciente se recuperó sin ningún tratamiento antibiótico. ^{[ 20 ]}

La prevalencia de C. hongkongensis en la literatura surge de su asociación con infecciones graves, específicamente enfermedades gastrointestinales . Varios casos de la bacteria se encuentran en pacientes que sufren afecciones como oclusión intestinal , infecciones intestinales agudas y sepsis . Se predice que a menudo también ejemplifica los efectos de estas afecciones subyacentes. ^{[ 9 ]} La especie también se identificó en muestras de agua europeas. Esto revela la presencia del organismo en ambientes externos y sugiere que una fuente potencial de infección en el tracto gastrointestinal es a través del consumo de agua o alimentos contaminados. ^{[ 21 ]} Esto resalta la necesidad de mejorar el saneamiento y la gestión de la calidad del agua en regiones donde la bacteria puede estar presente. Los resultados clínicos de C. hongkongensis también generan preocupación debido a la posible tasa de mortalidad , a pesar de la información limitada sobre su epidemiología . Todos los pacientes identificados en la literatura con neoplasias malignas avanzadas habían muerto, probablemente debido a la translocación gastrointestinal (paso de bacterias del tracto gastrointestinal a otras partes del cuerpo). ^{[ 9 ]} La morbilidad que probablemente causa C. hongkongensis es bacteriemia y posible choque séptico. ^{[ 8 ] [ 22 ]} La bacteriemia se refiere a la presencia de bacterias en el torrente sanguíneo de los pacientes y suele ser asintomática, pero puede provocar infecciones o sepsis si no se trata adecuadamente. ^{[ 8 ]}