Detergente escindible

Los detergentes escindibles , también conocidos como tensioactivos escindibles , ^{[ 1 ] [ 2 ]} son ​​tensioactivos especiales ( detergentes ) que se utilizan en bioquímica y especialmente en proteómica para mejorar la desnaturalización y la solubilidad de las proteínas . El detergente se inactiva mediante escisión, generalmente en condiciones ácidas , para que la muestra sea compatible con un procedimiento posterior o para eliminar selectivamente los productos de la escisión.

Las aplicaciones de los detergentes escindibles incluyen la digestión de proteínas con proteasas , como la digestión en gel con tripsina después de SDS-PAGE y la extracción de péptidos de geles de electroforesis . Los detergentes escindibles se utilizan principalmente en la preparación de muestras para espectrometría de masas .

PPS, disponible como PPS Silent Surfactant de Expedeon , es la abreviatura de 3-(4-(1,1-bis(hexiloxi)etil)piridinio-1-il)propano-1-sulfonato de sodio. Este detergente acetálico se divide en condiciones ácidas en hexanol y el 3-acetil-1-(3-sulfopropil)piridinio zwitteriónico .

'ProteaseMAX' es la marca comercial de Promega para el 3-((1-(furan-2-il)undeciloxi)carbonilamino)propano-1-sulfonato de sodio. Este detergente escindible es sensible al calor y al ácido y se degrada durante una digestión típica con tripsina en el compuesto lipofílico sin carga 1-(furan-2-il)undecan-1-ol y el ácido zwitteriónico 3-aminopropano-1-sulfónico (homotaurina), que se puede eliminar mediante extracción en fase sólida C18 durante el procesamiento de la muestra.

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RapiGest SF, nombre comercial del 3-[(2-metil-2-undecil-1,3-dioxolan-4-il)metoxi]-1-propanosulfonato de sodio, es un detergente aniónico escindible por ácido comercializado por Waters Corporation y AOBIOUS INC .

Los compuestos de la matriz MALDI, como el ácido α-ciano-4-hidroxicinámico, se han unido mediante un enlazador que consiste en acetales de formaldehído asimétricos al dodecanol . ^{[ 3 ]} Este tipo de detergente escindible es inherentemente compatible con MALDI y no es necesario eliminarlo antes del análisis.

También se han desarrollado tensioactivos escindibles por luz ultravioleta o fluoruro , pero no se utilizan actualmente. ^{[ 4 ]}