Articulo de referencia

Registro de imágenes

Registrar y sumar múltiples exposiciones de la misma escena mejora la relación señal-ruido, lo que permite ver detalles que antes eran imposibles de percibir. En esta fotografía...

Registrar y sumar múltiples exposiciones de la misma escena mejora la relación señal-ruido, lo que permite ver detalles que antes eran imposibles de percibir. En esta fotografía, los Alpes, a pesar de estar a decenas de kilómetros de distancia, se hacen visibles entre la bruma.

El registro de imágenes es el proceso de transformar diferentes conjuntos de datos en un único sistema de coordenadas . Los datos pueden ser múltiples fotografías, datos de diferentes sensores, tiempos, profundidades o puntos de vista. [ 1 ] Se utiliza en visión artificial , imágenes médicas , [ 2 ] reconocimiento automático de objetivos militares y compilación y análisis de imágenes y datos satelitales. El registro es necesario para poder comparar o integrar los datos obtenidos de estas diferentes mediciones.

Clasificación de algoritmos

Basado en intensidad frente a basado en características

Los algoritmos de registro o alineación de imágenes se pueden clasificar en basados ​​en intensidad y basados ​​en características. [ 3 ] Una de las imágenes se denomina imagen objetivo , fija o detectada , y las demás se denominan imágenes móviles o de origen . El registro de imágenes implica la transformación espacial de la(s) imagen(es) de origen/móvil para alinearla(s) con la imagen objetivo. El marco de referencia en la imagen objetivo es estacionario, mientras que los demás conjuntos de datos se transforman para que coincidan con el objetivo. [ 3 ] Los métodos basados ​​en intensidad comparan patrones de intensidad en imágenes mediante métricas de correlación, mientras que los métodos basados ​​en características encuentran correspondencia entre características de la imagen, como puntos, líneas y contornos. [ 3 ] Los métodos basados ​​en intensidad registran imágenes completas o subimágenes. Si se registran subimágenes, los centros de las subimágenes correspondientes se tratan como puntos característicos correspondientes. Los métodos basados ​​en características establecen una correspondencia entre varios puntos especialmente distintivos en las imágenes. Conociendo la correspondencia entre varios puntos en las imágenes, se determina una transformación geométrica para mapear la imagen objetivo a las imágenes de referencia, estableciendo así una correspondencia punto por punto entre las imágenes de referencia y objetivo. [ 3 ] También se han desarrollado métodos que combinan información basada en intensidad y en características. [ 4 ]

Modelos de transformación

Los algoritmos de registro de imágenes también se pueden clasificar según los modelos de transformación que utilizan para relacionar el espacio de la imagen objetivo con el espacio de la imagen de referencia. La primera categoría amplia de modelos de transformación incluye las transformaciones afines , que incluyen rotación, escalado, traslación y cizallamiento. [ 5 ] Las transformaciones afines son de naturaleza global, por lo que no pueden modelar las diferencias geométricas locales entre imágenes. [ 3 ]

La segunda categoría de transformaciones permite transformaciones "elásticas" o "no rígidas". Estas transformaciones son capaces de deformar localmente la imagen objetivo para alinearla con la imagen de referencia. Las transformaciones no rígidas incluyen funciones de base radial ( splines de placa delgada o de superficie, multicuadráticas y transformaciones con soporte compacto [ 3 ] ), modelos de continuo físico (fluidos viscosos) y modelos de grandes deformaciones ( difeomorfismos ).

Las transformaciones se describen comúnmente mediante una parametrización, donde el modelo determina el número de parámetros. Por ejemplo, la traslación de una imagen completa se puede describir mediante un vector de traslación. Estos modelos se denominan modelos paramétricos. Los modelos no paramétricos, por otro lado, no siguen ninguna parametrización, lo que permite que cada elemento de la imagen se desplace arbitrariamente. [ 6 ]

Existen varios programas que implementan tanto la estimación como la aplicación de un campo de curvatura. Esto forma parte de los programas SPM y AIR .

Transformaciones de coordenadas mediante la ley de composición de funciones en lugar de la suma.

Alternativamente, muchos métodos avanzados para la normalización espacial se basan en transformaciones que preservan la estructura, como homeomorfismos y difeomorfismos, ya que transportan subvariedades suaves durante la transformación. Los difeomorfismos se generan en el campo moderno de la Anatomía Computacional a partir de flujos, ya que no son aditivos aunque formen un grupo, sino un grupo bajo la ley de composición de funciones. Por esta razón, los flujos que generalizan las ideas de los grupos aditivos permiten generar grandes deformaciones que preservan la topología, proporcionando transformaciones biyectivas y sobreyectivas. Los métodos computacionales para generar tales transformaciones se denominan a menudo LDDMM [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ], que proporcionan flujos de difeomorfismos como la principal herramienta computacional para conectar sistemas de coordenadas correspondientes a los flujos geodésicos de la Anatomía Computacional .

Hay varios programas que generan transformaciones difeomórficas de coordenadas a través de mapeo difeomórfico, incluidos MRI Studio [ 11 ] y MRI Cloud.org [ 12 ].

Métodos en el dominio espacial frente a métodos en el dominio de la frecuencia

Los métodos espaciales operan en el dominio de la imagen, comparando patrones de intensidad o características en las imágenes. Algunos algoritmos de comparación de características derivan de técnicas tradicionales para el registro manual de imágenes, en las que un operador selecciona puntos de control (PC) correspondientes. Cuando el número de puntos de control supera el mínimo necesario para definir el modelo de transformación adecuado, se pueden utilizar algoritmos iterativos como RANSAC para estimar de forma robusta los parámetros de un tipo de transformación específico (por ejemplo, afín) para el registro de las imágenes.

Los métodos en el dominio de la frecuencia encuentran los parámetros de transformación para el registro de las imágenes mientras trabajan en el dominio de la transformada. Estos métodos funcionan para transformaciones simples, como traslación, rotación y escalado. Al aplicar el método de correlación de fase a un par de imágenes se obtiene una tercera imagen que contiene un único pico. La ubicación de este pico corresponde a la traslación relativa entre las imágenes. A diferencia de muchos algoritmos en el dominio espacial, el método de correlación de fase es resistente al ruido, las oclusiones y otros defectos típicos de las imágenes médicas o satelitales. Además, la correlación de fase utiliza la transformada rápida de Fourier para calcular la correlación cruzada entre las dos imágenes, lo que generalmente resulta en grandes mejoras de rendimiento. El método se puede extender para determinar las diferencias de rotación y escalado entre dos imágenes convirtiendo primero las imágenes a coordenadas log-polares . [ 13 ] [ 14 ] Debido a las propiedades de la transformada de Fourier , los parámetros de rotación y escalado se pueden determinar de manera invariante a la traslación.

Métodos de modalidad única frente a métodos multimodales

Otra clasificación posible es la que se establece entre métodos de una sola modalidad y métodos multimodales. Los métodos de una sola modalidad suelen registrar imágenes de la misma modalidad adquiridas con el mismo tipo de escáner/sensor, mientras que los métodos de registro multimodal tienden a registrar imágenes adquiridas con diferentes tipos de escáner/sensor.

Los métodos de registro multimodal se utilizan a menudo en imágenes médicas, ya que las imágenes de un sujeto se obtienen frecuentemente de diferentes escáneres. Algunos ejemplos incluyen el registro de imágenes de TC / RM cerebral o imágenes PET / TC de cuerpo entero para la localización de tumores, el registro de imágenes de TC con contraste frente a imágenes de TC sin contraste [ 15 ] para la segmentación de partes específicas de la anatomía, y el registro de imágenes de ultrasonido y TC para la localización de la próstata en radioterapia .

Métodos automáticos frente a métodos interactivos

Los métodos de registro se pueden clasificar según el nivel de automatización que ofrecen. Se han desarrollado métodos manuales, interactivos, semiautomáticos y automáticos. Los métodos manuales proporcionan herramientas para alinear las imágenes manualmente. Los métodos interactivos reducen el sesgo del usuario al realizar ciertas operaciones clave automáticamente, aunque siguen dependiendo de la intervención del usuario para guiar el registro. Los métodos semiautomáticos realizan la mayoría de los pasos del registro automáticamente, pero dependen del usuario para verificar su corrección. Los métodos automáticos no permiten ninguna interacción del usuario y realizan todos los pasos del registro automáticamente.

Medidas de similitud para el registro de imágenes

Las similitudes de imágenes se utilizan ampliamente en imágenes médicas . Una medida de similitud de imágenes cuantifica el grado de similitud entre patrones de intensidad en dos imágenes. [ 3 ] La elección de una medida de similitud de imágenes depende de la modalidad de las imágenes que se van a registrar. Ejemplos comunes de medidas de similitud de imágenes incluyen la correlación cruzada , la información mutua , la suma de las diferencias de intensidad al cuadrado y la uniformidad de la imagen de razón. La información mutua y la información mutua normalizada son las medidas de similitud de imágenes más populares para el registro de imágenes multimodales. La correlación cruzada, la suma de las diferencias de intensidad al cuadrado y la uniformidad de la imagen de razón se utilizan comúnmente para el registro de imágenes en la misma modalidad.

En el campo de la Anatomía Computacional han surgido muchas características nuevas para las funciones de coste basadas en métodos de coincidencia mediante grandes deformaciones, incluyendo la coincidencia de medidas , que son conjuntos de puntos o hitos sin correspondencia, la coincidencia de curvas y la coincidencia de superficies mediante corrientes matemáticas y varifolds.

Incertidumbre

Existe cierto grado de incertidumbre al registrar imágenes que presentan diferencias espacio-temporales. Un registro fiable, con un cierto grado de incertidumbre, es fundamental para muchas aplicaciones de detección de cambios, como el diagnóstico médico.

En aplicaciones de teledetección donde un píxel de una imagen digital puede representar varios kilómetros de distancia espacial (como las imágenes LANDSAT de la NASA ), un registro de imagen incierto puede significar que una solución podría estar a varios kilómetros de la verdad sobre el terreno. Varios artículos destacados han intentado cuantificar la incertidumbre en el registro de imágenes para comparar resultados. [ 16 ] [ 17 ] Sin embargo, muchos enfoques para cuantificar la incertidumbre o estimar las deformaciones son computacionalmente intensivos o solo son aplicables a conjuntos limitados de transformaciones espaciales.

Aplicaciones

Registro de dos imágenes de resonancia magnética del cerebro

El registro de imágenes tiene aplicaciones en la teledetección (actualización cartográfica) y la visión artificial. Debido a la gran variedad de aplicaciones posibles, resulta imposible desarrollar un método general optimizado para todos los usos.

El registro de imágenes médicas (por ejemplo, para datos del mismo paciente tomados en diferentes momentos, como la detección de cambios o el seguimiento de tumores (estudios longitudinales) a menudo implica adicionalmente un registro elástico (también conocido como no rígido ) para hacer frente a la deformación del sujeto (debido a la respiración, cambios anatómicos, etc.) y grandes diferencias anatómicas entre diferentes sujetos. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] El registro no rígido de imágenes médicas también se puede utilizar para registrar los datos de un paciente en un atlas anatómico, como el atlas de Talairach para neuroimagen. Otra aplicación del registro de imágenes para imágenes médicas es el registro de varios sujetos en un único espacio de referencia para análisis de cohortes [ 21 ] . En otros casos, el registro no rígido no se utiliza explícitamente ya que los métodos de registro rígido preservan la geometría subyacente, por ejemplo, en imágenes del oído interno . [ 22 ] Esto se prefiere para estructuras con baja variabilidad en la anatomía en la cohorte que se está estudiando.

En radioterapia, el registro rígido de imágenes (RIR) es un elemento fundamental en la mayoría de los sistemas de software de imágenes. Consiste en alinear las imágenes aplicando ajustes de traslación y rotación, hasta seis grados de libertad: tres para la traslación a lo largo de los ejes x, y y z, y tres para la rotación alrededor de estos ejes. El RIR alinea las imágenes adecuadamente utilizando estos seis parámetros, lo que permite una planificación y administración precisas del tratamiento. [ 23 ]

En astrofotografía , la alineación y el apilamiento de imágenes se utilizan con frecuencia para aumentar la relación señal-ruido en objetos débiles. Sin apilamiento, se puede utilizar para crear secuencias de imágenes a intervalos de tiempo, como la rotación de un planeta o un tránsito solar. Mediante puntos de control (introducidos de forma automática o manual), el ordenador realiza transformaciones en una imagen para alinear las características principales con una segunda imagen o varias imágenes. Esta técnica también se puede utilizar con imágenes de diferentes tamaños, permitiendo combinar imágenes tomadas con distintos telescopios o lentes.

En la criomicroscopía electrónica de transmisión (crio-TEM) , la inestabilidad provoca la deriva de la muestra y se requieren muchas adquisiciones rápidas con un registro de imagen preciso para preservar la alta resolución y obtener imágenes con una alta relación señal-ruido. Para datos con baja relación señal-ruido, el mejor registro de imagen se logra mediante la correlación cruzada de todas las permutaciones de imágenes en una pila de imágenes. [ 24 ]

El registro de imágenes es una parte esencial de la creación de imágenes panorámicas. Existen diversas técnicas que se pueden implementar en tiempo real y ejecutar en dispositivos integrados como cámaras y teléfonos con cámara.

Véase también

Referencias

  1. Lisa Gottesfeld Brown, Un estudio de técnicas de registro de imágenes ( resumen ), archivo de ACM Computing Surveys, volumen 24, número 4, diciembre de 1992), páginas 325-376
  2. Imágenes biológicas y mapeo cerebral
  3. 1 2 3 4 5 6 7 A. Ardeshir Goshtasby: Registro de imágenes 2D y 3D para aplicaciones médicas, de teledetección e industriales. Archivado el 16 de febrero de 2009 en Wayback Machine , Wiley Press, 2005.
  4. Papademetris, Xenophon; Jackowski, Andrea P.; Schultz, Robert T.; Staib, Lawrence H.; Duncan, James S. (2004). "Registro no rígido integrado de intensidad y características puntuales". Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2004. Lecture Notes in Computer Science. Vol.  3216. pp. 763–770 . doi : 10.1007/978-3-540-30135-6_93 . ISBN  978-3-540-22976-6ISSN 0302-9743 
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  6. Sotiras, A.; Davatzikos, C.; Paragios, N. (julio de 2013). "Registro de imágenes médicas deformables: una encuesta" . Transacciones IEEE sobre imágenes médicas . 32 (7): 1153– 1190. Código bibliográfico : 2013ITMI...32.1153S . doi : 10.1109/TMI.2013.2265603 . PMC 3745275 . PMID 23739795 .  
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  • Registro de imágenes de resonancia magnética multimodal mediante Matlab .
  • elastix Archivado el 19/04/2012 en Wayback Machine : una caja de herramientas para el registro rígido y no rígido de imágenes.
  • niftyreg : una caja de herramientas para realizar registros de imágenes robustos, rígidos, afines (mediante coincidencia de bloques) y no rígidos (mediante una versión modificada del algoritmo de deformación de forma libre) casi en tiempo real.
  • Técnicas de registro de imágenes usando MATLAB
  • La aplicación Image Compare compara automáticamente dos imágenes y resalta sus diferencias. Esta aplicación funciona en navegadores de escritorio y móviles sin necesidad de instalación.