Articulo de referencia

Haplogrupo E-P2

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El haplogrupo E-P2 , también conocido como E1b1 , es un haplogrupo de ADN del cromosoma Y humano . E-P2 tiene dos ramas basales, E-V38 y E-M215 . E-P2 tuvo una presencia antigua en el Levante ; actualmente, se distribuye principalmente en África , donde posiblemente se originó, y se presenta con menor frecuencia en Oriente Medio y Europa .

Orígenes

Semino et al. (2004) sugirieron un origen en África Oriental afirmando: "Tanto la filogeografía como la varianza de microsatélites sugieren que E-P2 y su derivado, E-M35, probablemente se originaron en África oriental". [ 2 ]

Trombetta et al. (2011) también sugirieron un origen en África Oriental :

La nueva topología aquí descrita tiene importantes implicaciones respecto a los orígenes del haplogrupo E-P2. Aplicando el principio de parsimonia filogeográfica, la resolución de la trifurcación E-M215 a favor de un ancestro común de E-M2 y E-M329 respalda firmemente la hipótesis de que el haplogrupo E-P2 se originó en África oriental, como se sugirió previamente, y que los cromosomas E-M2, tan frecuentemente observados en África subsahariana, descienden de un ancestro común presente en África oriental. [ 3 ]

ADN antiguo

Se encontró que una muestra de los restos natufienses portaba el haplogrupo E1b1 (1/5; 20%). [ 4 ]

En la cueva de Mota , en Etiopía , los restos de un antiguo varón etíope, datados en 4500 años antes del presente, presentaban el haplogrupo paterno E1b1 y el haplogrupo materno L3x2a . [ 5 ] [ 6 ]

Distribución

Los principales subclados de E1b1 (E-P2): E1b1a (E-V38) y E1b1b (E-M215) en poblaciones dadas. [ 7 ]

El haplogrupo E-P2 se encuentra principalmente en África , sobre todo en forma de sus subclados predominantes E-M215 y E-V38 . E-M215 es más común en el norte de África y el Cuerno de África , y también se encuentra con menor frecuencia en Oriente Medio , Europa y el sur de África . E-V38 es más común en África Occidental , África Central , el sur de África y la región de los Grandes Lagos africanos , y se presenta con menor frecuencia en el norte de África y Oriente Medio.

El paraclado, denominado E-P2*, e incluyendo los casos que no se encuentran ni en E-V38 ni en E-M215, es raro o inexistente, y hasta el momento no se ha encontrado ninguno. [ 3 ]

Semino et al. (2004) encontraron E-P2 (xM35,xM2) en el 10,4% de 48 amhara etíopes , el 12,8% de 78 oromo etíopes , el 1,9% de 53 bantúes sudafricanos y el 2,9% de 139 senegaleses . [ 8 ]

Wood et al. (2005) informaron haber encontrado E-P2(xP1, xM35) en el 11% (1/9) de una muestra de oromo de Etiopía, el 11% (1/9) de una muestra de Iraqw de Tanzania, el 10% (2/20) de una muestra mixta de hablantes de varias lenguas semíticas del sur de Etiopía, el 6% (1/18) de una muestra de amhara de Etiopía, el 3% (1/30) de una muestra de ewe de Ghana, el 3% (1/32) de una muestra de fante de Ghana y el 3% (1/34) de una muestra de wolof de Gambia/Senegal. [ 9 ]

Stefflova et al. (2009) informaron de un individuo de una muestra de 199 hombres afroamericanos de Filadelfia con E-P2 (xM35, xM2). [ 10 ]

Cruciani et al. (2002) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en: el 18% de 22 judíos etíopes , el 2% de 49 Mossi de Burkina Faso , el 3% de 37 Rimaibe también de Burkina Faso, y el 6% de 17 Fulbe de Camerún . [ 11 ]

Semino et al. (2002) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en el 18,2% de 88 etíopes. [ 12 ] [ 13 ]

Moran et al. (2004) encontraron E-P2 (xM35, xM2) en atletas etíopes y grupos de control y reportaron los siguientes resultados: Control general: 4% (4/95), Control Arsi: 8% (7/85), 5-10K: 22% (5/23) y Atletismo: 11% (2/11). [ 14 ]

Subclados

E-M215

El haplogrupo E-M215 es un subclado del haplogrupo E-P2. [ 1 ]

E-V38

El haplogrupo E-V38 es un subclado del haplogrupo E-P2. [ 1 ]

E-M329

Artículo principal: Haplogrupo E-M329

El haplogrupo E-M329 es un subclado del haplogrupo E-P2. [ 1 ]

Filogenética

Historia filogenética

Antes de 2002, existían en la literatura académica al menos siete sistemas de nomenclatura para el árbol filogenético del cromosoma Y. Esto generó una considerable confusión. En 2002, los principales grupos de investigación se unieron y formaron el Consorcio del Cromosoma Y (YCC). Publicaron un artículo conjunto que creó un nuevo árbol único que todos acordaron utilizar. Posteriormente, un grupo de científicos aficionados interesados ​​en la genética de poblaciones y la genealogía genética formó un grupo de trabajo para crear un árbol amateur con el objetivo de que fuera, ante todo, actual. La tabla a continuación reúne todos estos trabajos hasta el punto del emblemático árbol del YCC de 2002. Esto permite a un investigador que revise literatura publicada anteriormente cambiar rápidamente entre las diferentes nomenclaturas.

Publicaciones de investigación

Los siguientes equipos de investigación, según sus publicaciones, estuvieron representados en la creación del árbol YCC.

Árboles filogenéticos

Este árbol filogenético de subclados de haplogrupos se basa en el árbol YCC 2008 de Karafet (2008) [ 15 ] y en investigaciones publicadas posteriores.

Véase también

Genética

Subclados E del ADN-Y

Árbol genealógico del cromosoma Y

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 "E-P177 YTree" .
  2. 1 2 Semino, Ornella; et al. (mayo de 2004). "Origen, difusión y diferenciación de los haplogrupos E y J del cromosoma Y: inferencias sobre la neolitización de Europa y eventos migratorios posteriores en el área mediterránea" . American Journal of Human Genetics . 74 (5): 1023– 1034. doi : 10.1086/386295 . ISSN 0002-9297 . OCLC 4922408279. PMC 1181965. PMID 15069642. 17859431.     
  3. 1 2 3 Trombetta et al. (2011)
  4. Martiniano, Rui; Sanctis, Bianca De; Hallast, Pille; Durbin, Richard (20 de diciembre de 2020). "Material complementario: colocación de secuencias de ADN antiguas en filogenias de referencia" . Biología Molecular y Evolución . 39 (2): 2020.12.19.423614. bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614 . doi : 10.1093/molbev/msac017 . PMC 8857924 . PMID 35084493 . S2CID 229549849 .    
  5. Llorente, M. Gallego; et al. (13 de noviembre de 2015). "El genoma etíope antiguo revela una extensa mezcla euroasiática en África Oriental" . Science . 350 ( 6262): 820– 822. Bibcode : 2015Sci...350..820L . doi : 10.1126/science.aad2879 . hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789 .   
  6. Llorente, M. Gallego; et al. (13 de noviembre de 2015). "Materiales suplementarios: El genoma etíope antiguo revela una extensa mezcla euroasiática en África oriental" ( PDF) . Science . 350 (6262): 820– 822. Bibcode : 2015Sci...350..820L . doi : 10.1126/science.aad2879 . hdl : 2318/1661894 . PMID 26449472. S2CID 25743789 .   
  7. Badro, Danielle A.; Douaihy, Bouchra; Haber, Marc; Youhanna, Sonia C.; Salloum, Angélique; Ghassibe-Sabbagh, Michella; Johnsrud, Brian; Khazen, Georges; Matisoo-Smith, Elizabeth; Soria-Hernanz, David F.; Wells, R. Spencer; Tyler-Smith, Chris; Platt, Daniel E.; Zalloua, Pierre A.; Consorcio, The Genographic (30-01-2013). "La genética del cromosoma Y y del ADNmt revela contrastes significativos en las afinidades de las poblaciones modernas de Oriente Medio con las poblaciones europeas y africanas" . PLOS ONE . 8 (1) e54616. Bibcode : 2013PLoSO...854616B . doi : 10.1371 / journal.pone.0054616 . ISSN 1932-6203 . PMC 559847. PMID 23382925 .   
  8. Semino et al. (2004)
  9. Wood et al. (2005)
  10. Stefflova et al. (2009)
  11. Cruciani et al. (2002)
  12. Semino et al. (2002)
  13. Underhill et al. (2000)
  14. Moran et al. (2004)
  15. Karafet et al. (2008)

Bibliografía

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  • Wood, Elizabeth T; Stover, Daryn A; Ehret, Christopher; Destro-Bisol, Giovanni; Spedini, Gabriella; McLeod, Howard; Louie, Leslie; Bamshad, Mike; Strassmann, Beverly I; Soodyall, Himla; Hammer, Michael F (2005), "Patrones contrastantes de variación del cromosoma Y y del ADNmt en África: evidencia de procesos demográficos sesgados por sexo", European Journal of Human Genetics , 13 (7): 867–76 , doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 , PMID 15856073 

Fuentes para tablas de conversión

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  • Haplogrupo E y subclados del ADN-Y de ISOGG
  • Proyecto de ADN de las Islas Británicas archivado el 24/10/2014 en Wayback Machine.
  • E1b1.org – Proyecto internacional de ADN-Y del haplogrupo E1b1 y sus subclados
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