Haplogrupo L1

El haplogrupo L1 es un haplogrupo de ADN mitocondrial (ADNmt) humano . Es más común en África central y África occidental . Se separó de L1-6 hace unos 140.000 años (140.6+33,7
−33,0 kya 95% IC ). ^[3] Su aparición está asociada con el poblamiento temprano de África por humanos anatómicamente modernos durante el Eemiense , y ahora se encuentra principalmente en los recolectores de África Central .

ADN antiguo

Entre los menos del 1% de subgrupos del macrohaplogrupo L encontrados entre la población de Europa , está presente el haplogrupo L1b; el haplogrupo L1b en Europa , que se encuentra a menudo en África occidental , se ha datado en 10.000 años AP. ^[4]

Distribución

El haplogrupo L1 se encuentra más comúnmente en África central y África occidental . Alcanza su frecuencia más alta entre el pueblo Mbenga . Es probable que antes estuviera más extendido y se limitara a su área actual como resultado de la migración bantú (que se asocia en gran medida con el haplogrupo L2 ). ^[5] El haplogrupo L1 se ha observado en especímenes del cementerio de la isla en Kulubnarti , Sudán , que datan del período cristiano temprano (550-800 d. C.). ^[6] También se ha encontrado que un antiguo individuo de la cultura Beaker en el Camino de las Yeseras en España (San Fernando de Henares, Madrid; [I4245 / RISE695] F) porta el haplogrupo mitocondrial L1b1a. ^[7]

Subclados

L1c

L1c surgió hace unos 85.000 años. Alcanza sus frecuencias más altas en África occidental y central, especialmente entre el pueblo Mbenga . ^[8] (Ver mapa. ^[8] ) Entre los Mbenga, es portado por el 100% de los Ba-Kola , el 97% de los Ba-Benzélé y el 77% de los Biaka . ^[9] Otras poblaciones en las que L1c es particularmente prevalente incluyen al pueblo Bedzan (Tikar) (100%), al pueblo Baka de Gabón (97%) y Camerún (90%), ^[10] los Bakoya (97%) y los Ba-Bongo (82%). ^[8] Común también en Santo Tomé (20%) y Angola (16–24%). ^[11]

L1b

La L1b es mucho más reciente, datada en unos 10.000 años. Es frecuente en África occidental . También se la ha encontrado en Mozambique (1%), Etiopía (2%), Egipto (1%), el valle del Nilo (4%), Kung (1%), Cabo Verde (8%), Senegal (17-20%), Níger / Nigeria (15%), Guinea Bissau (11%), Marruecos (4-5%) y Argelia (1-2%). ^[12]

Filogenética

L1 tiene dos ramas, L1c y L1b (los haplogrupos anteriormente denominados L1d, L1k, L1a, L1f han sido ^{[ año necesario ]} reclasificados en el haplogrupo L0, como L0d, L0k, L0a, L0f; L1e como L5).

Filogenia de L1c: ^[2]

L1c
- L1c1'2'4'6
  - L1c1
    - L1c1a
      - L1c1a1
        L1c1a1a
        L1c1a1a1
        L1c1a1a1a
        
        L1c1a1a1b
        L1c1a1a1b1
        
        L1c1a1a2
        
        L1c1a1b
      - L1c1a2
        L1c1a2a
        L1c1a2a1
        
        L1c1a2a2
        
        L1c1a2b
        
        L1c1a2c
    - L1c1b'c'd
      - L1c1b
      - L1c1c'd
        L1c1c
        
        L1c1d
  - L1c2'4
    - L1c2
      - L1c2a
        L1c2a1
        L1c2a1a
        
        L1c2a1b
        
        L1c2a2
      - L1c2b
        L1c2b1
        
        L1c2b2
    - L1c4
      - L1c4a
      - L1c4b
  - L1c6
- L1c3
  - L1c3a
    - L1c3a1
    - L1c3a1a
  - L1c3b'c
    - L1c3b
      - L1c3b1
        L1c3b1a
        
        L1c3b1b
      - L1c3b2
    - L1c3c

Filogenia de L1b: ^[2]

L1b
- L1b1
  - L1b1a
    - L1b1a1'4
      - L1b1a1
      - L1b1a4
    - L1b1a2
      - L1b1a2a
    - 189
      - L1b1a3
        L1b1a3a
        L1b1a3a1
    - L1b1a5
    - L1b1a6
    - L1b1a7

Véase también

Referencias

^ Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (4 de junio de 2009). "Corrección de datos suplementarios para la selección purificadora: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado". The American Journal of Human Genetics . 84 (6): 82–93. doi :10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979 . PMID 19500773.
^ abc van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 de octubre de 2008). "Árbol filogenético completo actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano". Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
^ "Corrección para la selección purificadora: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado Material complementario" (PDF) . American Journal of Human Genetics : 82. 2009. Archivado desde el original (PDF) el 2009-12-29.
^ Borbély, Noémi (2024). "Información filogenética sobre los legados genéticos de las comunidades de habla húngara en la cuenca de los Cárpatos" (PDF) . Scientific Reports . 14 : 11480. Bibcode :2024NatSR..1411480B. doi :10.1038/s41598-024-61978-4. ISSN 2045-2322. OCLC 10243951083. PMC 11106325 . PMID 38769390. S2CID 269928158.
^ Silva, Marina; Alshamali, Farida; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Jesús Trovoada, María; Černý, Viktor; Pereira, Luisa; Soares, Pedro (2015). "60.000 años de interacciones entre África central y oriental documentadas por el principal haplogrupo L2 mitocondrial africano". Ciencia. Representante . 5 : 12526. Código Bib : 2015NatSR...512526S. doi :10.1038/srep12526. PMC 4515592 . PMID 26211407.
^ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). "Libro de resúmenes del Intercongreso IUAES 2016 - ¿Una comunidad dividida? Revelando el genoma de la comunidad de Kulubnarti medieval usando secuenciación de próxima generación". Libro de resúmenes del Intercongreso IUAES 2016 . IUAES: 115.
^ Iñigo Olalde et al. El fenómeno del vaso campaniforme y la transformación genómica del noroeste de Europa, 2017
^ abc Quintana-Murci; et al. (2008). "Huellas maternas de ascendencia común profunda y flujo genético asimétrico entre cazadores-recolectores pigmeos y agricultores de habla bantú". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (5): 1596–601. Bibcode :2008PNAS..105.1596Q. doi : 10.1073/pnas.0711467105 . PMC 2234190 . PMID 18216239.
^ Sarah A. Tishkoff et al. 2007, Historia de las poblaciones de habla chasquida de África inferida a partir de la variación genética del ADNmt y del cromosoma Y. Molecular Biology and Evolution 2007 24(10):2180-2195
^ Lluis Quintana-Murci et al. Diversidad del ADNmt en África central: de la caza y la recolección a la agricultura. CNRS-Institut Pasteur, París
^ Batini, Chiara et al 2006, Filogeografía del haplogrupo mitocondrial humano L1c: Firmas genéticas de la prehistoria de África Central
^ Rosa, Alexandra; et al. (2004). "Perfil de ADNmt de guineanos de África occidental: hacia una mejor comprensión de la región de Senegambia" (PDF) . Anales de genética humana . 68 (4): 340–52. doi :10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. hdl : 10400.13/3044 . PMID 15225159. S2CID 15391342 . Consultado el 5 de junio de 2017 .

Enlaces externos

PhyloTree.org - subárbol de ADNmt L, van Oven y Kayser M. 2009.
Propagación del haplogrupo L1, de National Geographic
Las secuencias de ADNmt del haplogrupo L africano muestran violaciones de la evolución en tiempo real
Haplogrupo L1b de Ian Logan.
Haplogrupo L1c de Ian Logan.
L1 YFull MTree 1.02.00 (en construcción)

[Soares-1] Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (4 de junio de 2009). "Corrección de datos suplementarios para la selección purificadora: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado". The American Journal of Human Genetics . 84 (6): 82–93. doi :10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979 . PMID 19500773.

[vanOven-2] van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 de octubre de 2008). "Árbol filogenético completo actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano". Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.

[soares_supplementary-3] "Corrección para la selección purificadora: un reloj molecular mitocondrial humano mejorado Material complementario" (PDF) . American Journal of Human Genetics : 82. 2009. Archivado desde el original (PDF) el 2009-12-29.

[Borbély-4] Borbély, Noémi (2024). "Información filogenética sobre los legados genéticos de las comunidades de habla húngara en la cuenca de los Cárpatos" (PDF) . Scientific Reports . 14 : 11480. Bibcode :2024NatSR..1411480B. doi :10.1038/s41598-024-61978-4. ISSN 2045-2322. OCLC 10243951083. PMC 11106325 . PMID 38769390. S2CID 269928158.

[5] Silva, Marina; Alshamali, Farida; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Jesús Trovoada, María; Černý, Viktor; Pereira, Luisa; Soares, Pedro (2015). "60.000 años de interacciones entre África central y oriental documentadas por el principal haplogrupo L2 mitocondrial africano". Ciencia. Representante . 5 : 12526. Código Bib : 2015NatSR...512526S. doi :10.1038/srep12526. PMC 4515592 . PMID 26211407.

[6] Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). "Libro de resúmenes del Intercongreso IUAES 2016 - ¿Una comunidad dividida? Revelando el genoma de la comunidad de Kulubnarti medieval usando secuenciación de próxima generación". Libro de resúmenes del Intercongreso IUAES 2016 . IUAES: 115.

[IOlalde-7] Iñigo Olalde et al. El fenómeno del vaso campaniforme y la transformación genómica del noroeste de Europa, 2017

[Quintana08-8] Quintana-Murci; et al. (2008). "Huellas maternas de ascendencia común profunda y flujo genético asimétrico entre cazadores-recolectores pigmeos y agricultores de habla bantú". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (5): 1596–601. Bibcode :2008PNAS..105.1596Q. doi : 10.1073/pnas.0711467105 . PMC 2234190 . PMID 18216239.

[Tishkoff-9] Sarah A. Tishkoff et al. 2007, Historia de las poblaciones de habla chasquida de África inferida a partir de la variación genética del ADNmt y del cromosoma Y. Molecular Biology and Evolution 2007 24(10):2180-2195

[10] Lluis Quintana-Murci et al. Diversidad del ADNmt en África central: de la caza y la recolección a la agricultura. CNRS-Institut Pasteur, París

[Batini-11] Batini, Chiara et al 2006, Filogeografía del haplogrupo mitocondrial humano L1c: Firmas genéticas de la prehistoria de África Central

[Rosa2004-12] Rosa, Alexandra; et al. (2004). "Perfil de ADNmt de guineanos de África occidental: hacia una mejor comprensión de la región de Senegambia" (PDF) . Anales de genética humana . 68 (4): 340–52. doi :10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. hdl : 10400.13/3044 . PMID 15225159. S2CID 15391342 . Consultado el 5 de junio de 2017 .