Jon Clardy (nacido el 16 de mayo de 1943 en Washington, D.C. , Estados Unidos) es actualmente profesor titular de química biológica y farmacología molecular en la Facultad de Medicina de Harvard, donde ocupa la cátedra Hsien Wu y Daisy Yen Wu . [ 1 ] Su investigación se centra en el aislamiento y la caracterización estructural de productos naturales, y actualmente investiga el papel de las moléculas pequeñas biológicamente activas en la mediación de interacciones simbióticas y enfermedades. [ 2 ]
Biografía
Clardy creció en Arlington, Virginia , Estados Unidos, siendo el mayor de cuatro hermanos. Asistió a la Universidad de Yale , donde obtuvo una licenciatura en 1964 y fue elegido miembro de Phi Beta Kappa . Si bien siempre le había fascinado la biología, durante sus estudios universitarios se interesó más por la química. Realizó una investigación de pregrado en síntesis orgánica, dirigida por R. Stephen Berry , con énfasis en el bencino. [ 3 ] Después de graduarse de Yale, se trasladó a la Universidad de Harvard , donde obtuvo un doctorado en química en 1969. Luego aceptó un puesto docente en el Departamento de Química de la Universidad Estatal de Iowa , donde estuvo afiliado al Laboratorio Ames. En 1978, se trasladó al Departamento de Química de la Universidad de Cornell , donde permaneció hasta 2002, cuando se trasladó al Departamento de Química Biológica y Farmacología Molecular de la Facultad de Medicina de Harvard. En 2004, comenzó el programa de doctorado en Biología Química con Stuart Schreiber y Greg Verdine. [ 4 ] También creó, y continúa impartiendo, una clase popular titulada "Moléculas de la vida" para estudiantes de pregrado de Harvard que no se especializan en ciencias.
Mientras cursaba su doctorado, Clardy conoció a su esposa, Andrea Fleck, graduada de Swarthmore College y escritora. Entre sus obras se incluyen un libro infantil, dos libros sobre el norte del estado de Nueva York y obras de teatro que se han representado en todo el país. Tienen dos hijos.
Descubrimiento de productos naturales
La investigación inicial de Clardy se centró en la elucidación de la estructura de productos naturales principalmente mediante cristalografía de rayos X. Al principio, en la Universidad Estatal de Iowa, Clardy estableció importantes colaboraciones con Bill Fenical, John Faulkner y Paul Scheuer, [ 5 ] lo que llevó a la elucidación de la estructura de numerosos productos naturales marinos como el agente anticancerígeno briostatina , [ 6 ] el insecticida y antifúngico jaspamida , diazonamida A y B , [ 7 ] y muchos otros. Algunos de sus trabajos iniciales más notables se centraron en las neurotoxinas asociadas con la "marea roja", lo que llevó a la determinación de las estructuras tridimensionales de la saxitoxina , [ 8 ] del grupo de la goniautoxina , y el poliéter cíclico brevetoxina B. [ 9 ] Al trasladarse a la Universidad de Cornell, la investigación de Clardy se amplió para incluir una gran variedad de organismos no marinos, incluidos, pero no limitados, hongos, Actinomycetota y C. elegans . Su interés de larga data en los hongos endófitos lo llevó al descubrimiento del ácido torreyánico , una quinona selectivamente citotóxica , los guanacastepenos estructuralmente diversos , el agente antimicótico criptocina y muchos otros.
Recientemente, Clardy se ha centrado en las asociaciones simbióticas entre bacterias y otros organismos como fuentes ricas de nuevas moléculas pequeñas. [ 10 ] En colaboración con Cameron Currie, Clardy investigó las asociaciones entre actinomicetos e insectos como el escarabajo del pino del sur, hormigas y termitas, lo que condujo al descubrimiento de agentes antifúngicos, incluyendo la dentigerumicina [ 11 ] [ 12 ] y la micangimicina. [ 13 ] [ 14 ] El estudio del intercambio químico en interacciones ecológicas complejas sigue siendo un enfoque central del laboratorio de Clardy. [ 15 ]
Cristalografía de rayos X de interacciones entre moléculas pequeñas y proteínas.
Clardy, en colaboración con Stuart Schreiber y sus colegas, obtuvo la estructura cristalina de los complejos FK506/ FKBP12 y rapamicina /FKBP12. [ 16 ] Poco después, Schreiber y Clardy determinaron la estructura del complejo FK506/rapamicina/FRAP, un estudio innovador que reveló la capacidad de una molécula pequeña permeable a la célula para facilitar la dimerización de proteínas. [ 17 ] Vertex, una empresa farmacéutica emergente, se fundó para diseñar una versión no tóxica de FK506. [ 18 ] En colaboración con Walter Leal, Clardy y sus colegas obtuvieron una estructura cristalina por rayos X de la feromona volátil de insectos bombykol con su ligando ubicado en las antenas de las polillas hembras del gusano de seda. [ 19 ] Además de mejorar la comprensión de esta interacción altamente específica entre moléculas pequeñas y proteínas, este estudio marcó la primera estructura tridimensional de una proteína de unión a odorantes. [ 20 ]
ADNe
Clardy también es conocido por su trabajo en la elucidación de productos naturales producidos por bacterias no cultivables y se le atribuye, junto con Jo Handelsman y Robert M. Goodman , ser pionero en el campo de la metagenómica . Con Sean Brady, desarrolló un método para insertar ADN directamente del ADN ambiental (ADNe), como el del suelo, en bibliotecas de cósmidos, buscar grupos de genes biosintéticos e identificar los productos de estos genes. [ 21 ] Utilizando este método, dilucidaron las estructuras de numerosos antibióticos previamente inalcanzables mediante técnicas de laboratorio tradicionales, como productos naturales derivados de N-aciltirosinas de cadena larga. [ 22 ]
Referencias
- ↑ "BCMP | Departamento de Química Biológica y Farmacología Molecular" . Bcmp.med.harvard.edu . Consultado el 28 de septiembre de 2013 .
- ↑ "Jon Clardy | Laboratorio Clardy" . Clardy.med.harvard.edu . Consultado el 28 de septiembre de 2013 .
- ↑ Berry, RS, Clardy, J. y Schafer, ME. Bencino. J. Am. Chem. Soc. 86, 2738–2739 (1964)
- ↑ "Los biólogos químicos | Revista Harvard, marzo-abril de 2005" . Revista Harvard . Harvardmagazine.com. Marzo de 2005. Consultado el 28 de septiembre de 2013 .
- ↑ Boletín informativo de la Sociedad Americana de Farmacognosia. 1-3 (2004)
- ↑ Pettit, GR et al. Aislamiento y estructura de la briostatina 1. J. Am. Chem. Soc. 104, 6846–6848 (1982)
- ↑ Lindquist, N., Fenical, W., Van Duyne, GD y Clardy, J. Aislamiento y determinación estructural de las diazonamidas A y B, metabolitos citotóxicos inusuales de la ascidia marina Diazona chinensis. J. Am. Chem. Soc. 113, 2303–2304 (1991)
- ^ Schantz, EJ y col. Estructura de la saxitoxina. J. Am. Química. Soc. 97, 1238-1239 (1975)
- ↑ Lin, Y.-Y. et al. Aislamiento y estructura de la brevetoxina B del dinoflagelado causante de la "marea roja" Ptychodiscus brevis (Gymnodinium breve). J. Am. Chem. Soc. 103, 6773–6775 (1981)
- ↑ "Sobre escarabajos y bacterias | The Scientist Magazine" . Archivado del original el 2 de octubre de 2013. Consultado el 25 de agosto de 2014 .
- ↑ Oh, D.-C., Poulsen, M., Currie, CR y Clardy, J. Dentigerumicina: un mediador bacteriano de la simbiosis hormiga-hongo. Nat Chem Biol 5, 391–393 (2009)
- ↑ Willson, E. y Yarnell, A. En complicidad: hongos, hormigas y bacterias. Chemical & Engineering News 87, 15 (2009)
- ↑ Scott, JJ et al. Protección bacteriana del mutualismo escarabajo-hongo. Science 322, 63 (2008)
- ↑ Drahl, C. Las bacterias de los escarabajos poseen un agente antifúngico. Chemical & Engineering News 86, 47 (2008)
- ↑ "Jon Clardy" . Academy.asm.org. Archivado del original el 25 de abril de 2013. Consultado el 28 de septiembre de 2013 .
- ↑ Van Duyne, GD, Standaert, RF, Karplus, PA, Schreiber, SL, Clardy J. Estructura atómica de FKBP-FK506, un complejo inmunofilina-inmunosupresor. Science 252, 839-842 (1991)
- ↑ Choi, J., Chen, J., Schreiber SL, Clardy J. Estructura del complejo FKBP12-rapamicina que interactúa con el dominio de unión de la FRAP humana. Science 273, 239-242 (1996)
- ↑ La molécula de mil millones de dólares: La búsqueda del fármaco perfecto, Barry Werth, 1994
- ↑ Sandler, BH, Nikonova, L., Leal, WS y Clardy, J. Atracción sexual en la polilla del gusano de seda: estructura del complejo proteína de unión a feromonas-bombykol. Chemistry & Biology 7, 143–151 (2000)
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- ↑ Brady, SF, Chao, CJ y Clardy, J. Nuevas familias de productos naturales a partir de un grupo de genes de ADN ambiental (ADNe). J. Am. Chem. Soc. 124, 9968–9969 (2002)
- ↑ Brady, SF, Chao, CJ y Clardy, J. Síntesis de N-aciltirosina de cadena larga a partir de ADN ambiental. Appl. Environ. Microbiol. 70, 6865–6870 (2004)
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