El canal de potasio dependiente de voltaje subfamilia A miembro 1, también conocido como K v 1.1 , es un canal de potasio dependiente de voltaje relacionado con Shaker que en humanos está codificado por el gen KCNA1 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] El síndrome de Isaacs es el resultado de una reacción autoinmune contra el canal iónico K v 1.1. [ 8 ]
Genómica
El gen se encuentra en la cadena Watson (positiva) del brazo corto del cromosoma 12 (12p13.32). El gen tiene una longitud de 8348 bases y codifica una proteína de 495 aminoácidos (peso molecular predicho de 56,466 kilodaltons ) .
Nombres alternativos
El nombre recomendado para esta proteína es canal de potasio dependiente de voltaje subfamilia A miembro 1, pero en la literatura se han utilizado varias alternativas, entre ellas HuK1 (canal de K + humano I), RBK1 (canal de potasio de rubidio 1), MBK ( canal de K + del cerebro de ratón ), canal de potasio dependiente de voltaje HBK1, subunidad del canal de potasio dependiente de voltaje K v 1.1, canal de K + dependiente de voltaje HuKI y AEMK (asociado con miocimia con ataxia periódica).
Estructura
Se cree que la proteína tiene seis dominios (S1-S6), con el bucle entre S5 y S6 formando el poro del canal. Esta región también posee un motivo de filtro de selectividad conservado. El canal funcional es un homotetrámero. El extremo N-terminal de la proteína se asocia con subunidades β. Estas subunidades regulan la inactivación del canal, así como su expresión. El extremo C-terminal se asocia con una proteína con dominio PDZ implicada en la localización del canal. [ 9 ] [ 10 ]
Función
La proteína funciona como un canal selectivo de potasio a través del cual el ion potasio puede pasar en concordancia con el gradiente electroquímico. Desempeñan un papel en la repolarización de las membranas. [ 9 ]
Edición de ARN
El pre-ARNm de esta proteína está sujeto a edición de ARN . [ 11 ]
Tipo
La edición de ARN de A a I está catalizada por una familia de adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR), las cuales reconocen específicamente las adenosinas dentro de las regiones de doble cadena de los pre-ARNm (por ejemplo, la señal de edición de ARN del canal de potasio ) y las desaminan a inosina . La maquinaria de traducción celular reconoce las inosinas como guanosina. Existen tres miembros de la familia ADAR: ADAR 1-3, siendo ADAR1 y ADAR2 los únicos miembros enzimáticamente activos. Se cree que ADAR3 tiene una función reguladora en el cerebro. ADAR1 y ADAR2 se expresan ampliamente en los tejidos, mientras que ADAR3 se restringe al cerebro. Las regiones de doble cadena del ARN se forman mediante el apareamiento de bases entre residuos en la región cercana al sitio de edición con residuos generalmente en un intrón vecino, aunque a veces también puede ser una secuencia exónica. La región que se aparea con la región de edición se conoce como Secuencia Complementaria de Edición (ECS).
Ubicación
El residuo modificado se encuentra en el aminoácido 400 de la proteína final. Este se localiza en la sexta región transmembrana encontrada, que corresponde al vestíbulo interno del poro. Una estructura de horquilla de tallo-bucle media la edición del ARN. Es probable que ADAR2 sea la enzima de edición preferida en el sitio I/V. La edición produce una alteración del codón de ATT a GTT, lo que resulta en un cambio de aminoácido de isoleucina a valina . La enzima ADAR2 es la principal enzima de edición. El programa MFOLD predijo que la región mínima requerida para la edición formaría una horquilla de repetición invertida imperfecta . Esta región está compuesta por 114 pares de bases. Se han identificado regiones similares en ratones y ratas. La adenosina editada se encuentra en una región dúplex de 6 pares de bases. Experimentos de mutación en la región cercana al dúplex de 6 pares de bases han demostrado que las bases específicas en esta región también eran esenciales para que ocurriera la edición. La región requerida para la edición es inusual en el sentido de que la estructura de horquilla está formada únicamente por secuencias exónicas . En la mayoría de las ediciones de A a I, el ECS se encuentra dentro de una secuencia intrónica . [ 11 ]
Conservación
La edición está altamente conservada, habiéndose observado en calamares, moscas de la fruta, ratones y ratas. [ 11 ]
Regulación
Los niveles de edición varían en diferentes tejidos: 17% en el núcleo caudado , 68% en la médula espinal y 77% en el bulbo raquídeo . [ 12 ]
Consecuencias
Estructura
La edición da como resultado un cambio de codón (I/V) de (ATT) a (GTT), lo que provoca la traducción de una valina en lugar de una isoleucina en la posición del sitio de edición. La valina tiene una cadena lateral más grande. La edición de ARN en esta posición ocurre en un poro conductor de iones altamente conservado del canal. Esto puede afectar la función del canal en el proceso de inactivación rápida. [ 11 ]
Función
Los canales de potasio dependientes de voltaje modulan la excitabilidad abriendo y cerrando un poro selectivo de potasio en respuesta al voltaje. El flujo de iones de potasio se interrumpe por la interacción de una partícula inactivadora , una proteína auxiliar en humanos pero una parte intrínseca del canal en otras especies. Se cree que el cambio de aminoácido I a V interrumpe la interacción hidrofóbica entre la partícula inactivadora y el revestimiento del poro. Esto interrumpe el proceso de inactivación rápida. La cinética de activación no se ve afectada por la edición de ARN. [ 11 ] Los cambios en la cinética de inactivación afectan la duración y la frecuencia del potencial de acción. Un canal editado conduce más corriente y tiene un potencial de acción más corto que el tipo no editado debido a la incapacidad de la partícula inactivadora para interactuar con el residuo en el poro conductor de iones del canal. Esto se determinó mediante análisis electrofisiológico. [ 13 ] La duración de la despolarización de la membrana disminuye, lo que también reduce la eficiencia de la liberación del neurotransmisor. [ 12 ] Dado que la edición puede causar cambios de aminoácidos en 1-4 en los tetrámeros del canal de potasio, puede tener una amplia variedad de efectos en la inactivación del canal.
Desregulación
Se sabe que los cambios en el proceso de inactivación rápida tienen consecuencias conductuales y neurológicas in vivo. [ 11 ]
Clínico
Las mutaciones en este gen causan ataxia episódica tipo 1.
Véase también
- GABRA3 : una subunidad de canal que experimenta una edición de ARN similar.
Referencias
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Lecturas adicionales
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Enlaces externos
- Entrada de GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre Ataxia Episódica Tipo 1, Ataxia Episódica con Miocimia, Ataxia Cerebelosa Hereditaria con Neuromiotonía
- Canal de potasio Kv1.1 en los encabezamientos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- KCNA1+proteína,+humana en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
- Genes en el cromosoma 12 humano
- Canales iónicos