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Proyecto de Genética del Ratón

El Proyecto de Genética del Ratón (MGP) es un programa a gran escala de producción y fenotipado de ratones mutantes cuyo objetivo es identificar nuevos organismos modelo para el...

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El Proyecto de Genética del Ratón (MGP) es un programa a gran escala de producción y fenotipado de ratones mutantes cuyo objetivo es identificar nuevos organismos modelo para el estudio de enfermedades. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

Con sede en el Wellcome Trust Sanger Institute , el proyecto utiliza ratones knockout, la mayoría de los cuales fueron generados por el Consorcio Internacional de Ratones Knockout . Para cada línea mutante, grupos de siete ratones machos y siete hembras pasan por un proceso de análisis estándar destinado a detectar rasgos que difieren de los ratones C57BL/6 sanos. [ 1 ] El proceso recopila numerosas mediciones de viabilidad, fertilidad, peso corporal, infección, audición, morfología, hematología, comportamiento, química sanguínea e inmunidad, y las compara con controles de tipo silvestre mediante un modelo estadístico mixto . [ 5 ] Estos datos se comparten inmediatamente entre la comunidad científica y médica a través de una base de datos de acceso abierto personalizada , [ 6 ] y los resúmenes se muestran en otros recursos en línea, incluida la base de datos Mouse Genome Informatics y la Wiki de genes basada en Wikipedia . [ 4 ]

A julio de 2013, el MGP informa tener más de 900 líneas mutantes disponibles públicamente para la comunidad científica internacional, [ 4 ] y análisis "sustancialmente completos" para más de 650 líneas mutantes, [ 6 ] de las cuales más del 75 por ciento tienen al menos un fenotipo anormal. [ 1 ] Entre estos se encuentran nuevos descubrimientos de genes implicados en enfermedades, incluyendo:

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 Ayadi A, Birling MC, Bottomley J, et  al. (octubre de 2012). "Iniciativas de fenotipado a gran escala en ratones: descripción general de la Clínica Europea de Enfermedades del Ratón (EUMODIC) y del Proyecto de Genética del Ratón del Instituto Wellcome Trust Sanger" . Mamm . Genome . 23 ( 9–10 ): 600–10 . doi : 10.1007/s00335-012-9418-y . PMC 3463797. PMID 22961258 .  
  2. ↑ Gerdin AK (2010). "El programa de genética de ratones Sanger: caracterización de alto rendimiento de ratones knockout". Acta Ophthalmologica . 88 (S248). doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  3. 1 2 van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "El conjunto de herramientas de genética del ratón: revelando función y mecanismo" . Genome Biol . 12 (6): 224. doi : 10.1186/gb-2011-12-6-224 . PMC 3218837. PMID 21722353 .  
  4. 1 2 3 White JK, Gerdin AK, Karp NA, et al. (julio de 2013). "Generación a nivel genómico y fenotipado sistemático de ratones knockout revelan nuevas funciones para muchos genes" . Cell . 154 ( 2): 452– 64. doi : 10.1016/j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207. PMID 23870131 .   
  5. ↑ Karp NA, Melvin D, Mott RF (2012). "Análisis robusto y sensible de fenotipos knockout de ratones" . PLoS ONE . 7 (12) e52410. Bibcode : 2012PLoSO...752410K . doi : 10.1371/ journal.pone.0052410 . PMC 3530558. PMID 23300663 .  
  6. 1 2 Portal de recursos para ratones , Instituto Wellcome Trust Sanger .
  7. ↑ Alderton GK (marzo de 2011). " Inestabilidad genómica: ampliando el alcance de la anemia de Fanconi". Nat. Rev. Cancer . 11 (3): 158– 159. doi : 10.1038/nrc3027 . PMID 21451554. S2CID 26277627 .  
  8. ↑ Crossan GP, ​​van der Weyden L, Rosado IV, Langevin F, Gaillard PH, McIntyre RE, Gallagher F, Kettunen MI, Lewis DY, Brindle K, Arends MJ, Adams DJ, Patel KJ (febrero de 2011). "La interrupción de Slx4 en ratones, un regulador de nucleasas específicas de estructura, reproduce el fenotipo de la anemia de Fanconi" . Nat . Genet . 43 (2): 147– 52. doi : 10.1038/ng.752 . PMC 3624090. PMID 21240276 .  
  9. ↑ Bassett JH, Gogakos A, White JK, Evans H, Jacques RM, van der Spek AH, Ramirez-Solis R, Ryder E, Sunter D, Boyde A, Campbell MJ, Croucher PI, Williams GR (2012). "Fenotipado esquelético de alto rendimiento de 100 ratones knockout identifica 9 nuevos genes que determinan la resistencia ósea" . PLoS Genet. 8 (8) e1002858. doi : 10.1371/journal.pgen.1002858 . PMC 3410859. PMID 22876197 .  
  10. ↑ McIntyre RE, Lakshminarasimhan Chavali P, Ismail O, Carragher DM, Sanchez-Andrade G, Forment JV, Fu B, Del Castillo Velasco-Herrera M, Edwards A, van der Weyden L, Yang F, Ramirez-Solis R, Estabel J, Gallagher FA, Logan DW, Arends MJ, Tsang SH, Mahajan VB, Scudamore CL, White JK, Jackson SP, Gergely F, Adams DJ (2012). "La interrupción de Cenpj en ratones, un regulador de la biogénesis de los centriolos, fenocopia el síndrome de Seckel" . PLOS Genet . 8 (11) e1003022. doi : 10.1371/journal.pgen.1003022 . PMC 3499256. PMID 23166506 .  
  11. ↑ Nijnik A, Clare S, Hale C, Chen J, Raisen C, Mottram L, Lucas M, Estabel J, Ryder E, Adissu H, Adams NC, Ramirez-Solis R, White JK, Steel KP, Dougan G, Hancock RE (julio de 2012). " El papel del transportador de esfingosina-1-fosfato Spns2 en la función del sistema inmunitario" . J. Immunol. 189 (1): 102–11 . doi : 10.4049/jimmunol.1200282 . PMC 3381845. PMID 22664872 .  
  12. ↑ Nijnik A, Clare S, Hale C, Raisen C, McIntyre RE, Yusa K, Everitt AR, Mottram L, Podrini C, Lucas M, Estabel J, Goulding D, Adams N, Ramirez-Solis R, White JK, Adams DJ, Hancock RE, Dougan G (febrero de 2012). "El papel crítico de la histona H2A-deubiquitinasa Mysm1 en la hematopoyesis y la diferenciación de linfocitos" . Blood . 119 (6): 1370–9 . doi : 10.1182/blood-2011-05-352666 . PMID 22184403 . 
  • El portal del ratón Sanger , que contiene todos los datos de MGP.
  • El MGP Biomart , para la extracción de datos fenotípicos