La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa ( EC 4.1.1.32 , PEPCK ) es una enzima de la familia de las liasas que participa en la vía metabólica de la gluconeogénesis . Convierte el oxalacetato en fosfoenolpiruvato y dióxido de carbono . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Se encuentra en dos formas: citosólica y mitocondrial .
Estructura
En humanos existen dos isoformas de PEPCK: una citosólica (SwissProt P35558) y una mitocondrial (SwissProt Q16822), que comparten un 63,4 % de identidad de secuencia. La isoforma citosólica es importante en la gluconeogénesis. Sin embargo, se conoce un mecanismo de transporte para mover el PEP desde las mitocondrias al citosol, mediante proteínas de transporte de membrana específicas. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] El transporte de PEP a través de la membrana mitocondrial interna involucra a la proteína transportadora de tricarboxilato mitocondrial y, en menor medida, al transportador de nucleótidos de adenina . También se ha planteado la posibilidad de un transportador de PEP/piruvato. [ 9 ]
Las estructuras de rayos X de PEPCK proporcionan información sobre la estructura y el mecanismo de la actividad enzimática de PEPCK. La isoforma mitocondrial de PEPCK de hígado de pollo complejada con Mn²⁺ , Mn²⁺ - fosfoenolpiruvato ( PEP) y Mn²⁺ - GDP proporciona información sobre su estructura y cómo esta enzima cataliza reacciones. [ 10 ] Delbaere et al. (2004) resolvieron PEPCK en E. coli y encontraron que el sitio activo se encuentra entre un dominio C-terminal y un dominio N-terminal . Se observó que el sitio activo se cierra al rotar estos dominios. [ 11 ]
Los grupos fosforilo se transfieren durante la acción de la PEPCK, lo que probablemente se ve facilitado por la conformación eclipsada de los grupos fosforilo cuando el ATP está unido a la PEPCK. [ 11 ]
Dado que la formación eclipsada es de alta energía, la transferencia del grupo fosforilo tiene una energía de activación reducida , lo que significa que los grupos se transferirán con mayor facilidad. Es probable que esta transferencia ocurra mediante un mecanismo similar al desplazamiento SN2 . [ 11 ]
En diferentes especies
La transcripción del gen PEPCK se produce en muchas especies, y la secuencia de aminoácidos de PEPCK es distinta para cada especie.
Por ejemplo, su estructura y su especificidad difieren en humanos, Escherichia coli ( E. coli ) y el parásito Trypanosoma cruzi . [ 12 ]
Mecanismo
La PEPCKasa convierte el oxalacetato en fosfoenolpiruvato y dióxido de carbono .
Como la PEPCK actúa en la unión entre la glucólisis y el ciclo de Krebs, provoca la descarboxilación de una molécula de C4, creando una molécula de C3 . Como primer paso comprometido en la gluconeogénesis, la PEPCK descarboxila y fosforila el oxalacetato (OAA) para su conversión a PEP, cuando hay GTP presente. Al transferirse un fosfato, la reacción da como resultado una molécula de GDP. [ 10 ] Cuando la piruvato quinasa , la enzima que normalmente cataliza la reacción que convierte el PEP en piruvato, se inactiva en mutantes de Bacillus subtilis , la PEPCK participa en una de las reacciones anapleróticas de reemplazo , funcionando en la dirección inversa de su función normal, convirtiendo el PEP en OAA. [ 13 ] Aunque esta reacción es posible, la cinética es tan desfavorable que los mutantes crecen a un ritmo muy lento o no crecen en absoluto. [ 13 ]
Función
Gluconeogénesis
La PEPCK-C cataliza un paso irreversible de la gluconeogénesis , el proceso mediante el cual se sintetiza la glucosa. Por lo tanto, se ha considerado que esta enzima es esencial para la homeostasis de la glucosa, como lo demuestran los ratones de laboratorio que desarrollaron diabetes mellitus tipo 2 como resultado de la sobreexpresión de PEPCK-C. [ 14 ]
El papel que desempeña la PEPCK-C en la gluconeogénesis puede estar mediado por el ciclo del ácido cítrico , cuya actividad se encontró directamente relacionada con la abundancia de PEPCK-C. [ 15 ]
Los niveles de PEPCK-C por sí solos no mostraron una alta correlación con la gluconeogénesis en el hígado de ratón, como habían sugerido estudios previos. [ 15 ] Si bien el hígado de ratón expresa casi exclusivamente PEPCK-C, los humanos también presentan una isoenzima mitocondrial (PEPCK-M). La PEPCK-M tiene potencial gluconeogénico por sí misma. [ 2 ] Por lo tanto, el papel de la PEPCK-C y la PEPCK-M en la gluconeogénesis podría ser más complejo e involucrar más factores de lo que se creía anteriormente.
Animales
En los animales, este es un paso limitante de la gluconeogénesis , el proceso mediante el cual las células sintetizan glucosa a partir de precursores metabólicos. El nivel de glucosa en sangre se mantiene dentro de límites bien definidos, en parte gracias a la regulación precisa de la expresión del gen PEPCK. Para enfatizar la importancia de PEPCK en la homeostasis de la glucosa , la sobreexpresión de esta enzima en ratones produce síntomas de diabetes mellitus tipo II , la forma más común de diabetes en humanos. Debido a la importancia de la homeostasis de la glucosa en sangre, varias hormonas regulan un conjunto de genes (incluido PEPCK) en el hígado que modulan la tasa de síntesis de glucosa.
La PEPCK-C está controlada por dos mecanismos hormonales diferentes. Su actividad aumenta tras la secreción de cortisol por la corteza suprarrenal y de glucagón por las células alfa del páncreas. El glucagón eleva indirectamente la expresión de la PEPCK-C al aumentar los niveles de AMPc (mediante la activación de la adenilil ciclasa) en el hígado, lo que conduce a la fosforilación de S133 en una lámina beta de la proteína CREB . Posteriormente, CREB se une al gen de la PEPCK-C en el elemento de respuesta al AMPc (CRE) e induce la transcripción de la PEPCK-C. Por otro lado, el cortisol, al ser liberado por la corteza suprarrenal, atraviesa la membrana lipídica de las células hepáticas (debido a su naturaleza hidrofóbica, puede atravesar directamente las membranas celulares) y se une al receptor de glucocorticoides (GR). Este receptor se dimeriza y el complejo cortisol/GR pasa al núcleo, donde se une a la región del Elemento de Respuesta a los Glucocorticoides (GRE) de manera similar a CREB y produce resultados similares (síntesis de más PEPCK-C).
En conjunto, el cortisol y el glucagón pueden tener enormes efectos sinérgicos, activando el gen PEPCK-C a niveles que ni el cortisol ni el glucagón podrían alcanzar por sí solos. El PEPCK-C es más abundante en el hígado, el riñón y el tejido adiposo. [ 3 ]
Un estudio colaborativo entre la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos (EPA) y la Universidad de New Hampshire investigó el efecto del DE-71, una mezcla comercial de PBDE , sobre la cinética de la enzima PEPCK y determinó que el tratamiento in vivo del contaminante ambiental compromete el metabolismo de la glucosa y los lípidos hepáticos, posiblemente mediante la activación del receptor de xenobióticos de pregnano ( PXR ), y puede influir en la sensibilidad a la insulina de todo el organismo. [ 16 ]
Investigadores de la Universidad Case Western Reserve han descubierto que la sobreexpresión de PEPCK citosólica en el músculo esquelético de ratones hace que sean más activos, más agresivos y vivan más tiempo que los ratones normales; véase superratones metabólicos .
Plantas
PEPCK ( EC 4.1.1.49 ) es una de las tres enzimas de descarboxilación utilizadas en los mecanismos de concentración de carbono inorgánico de las plantas C4 y CAM. Las otras son la enzima málica dependiente de NADP y la enzima málica dependiente de NAD . [ 17 ] [ 18 ] En la fijación de carbono C4 , el dióxido de carbono se fija primero mediante la combinación con fosfoenolpiruvato para formar oxalacetato en el mesófilo . En las plantas C4 de tipo PEPCK, el oxalacetato se convierte luego en aspartato , que viaja a la vaina del haz . En las células de la vaina del haz , el aspartato se convierte de nuevo en oxalacetato . PEPCK descarboxila el oxalacetato de la vaina del haz , liberando dióxido de carbono , que luego es fijado por la enzima Rubisco . Por cada molécula de dióxido de carbono producida por PEPCK, se consume una molécula de ATP .
La PEPCK actúa en plantas que realizan fijación de carbono C4 , donde su acción se ha localizado en el citosol , a diferencia de los mamíferos, donde se ha descubierto que la PEPCK actúa en las mitocondrias . [ 19 ]
Aunque se encuentra en muchas partes diferentes de las plantas, solo se ha visto en tipos celulares específicos, incluidas las áreas del floema . [ 20 ]
También se ha descubierto que, en el pepino ( Cucumis sativus L. ), los niveles de PEPCK aumentan debido a múltiples efectos que se sabe que disminuyen el pH celular de las plantas, aunque estos efectos son específicos de la parte de la planta. [ 20 ]
Los niveles de PEPCK aumentaron en las raíces y los tallos cuando las plantas se regaron con cloruro de amonio a un pH bajo (pero no a un pH alto ) o con ácido butírico . Sin embargo, los niveles de PEPCK no aumentaron en las hojas bajo estas condiciones.
En las hojas, un contenido de CO2 del 5% en la atmósfera conduce a una mayor abundancia de PEPCK. [ 20 ]
bacterias
En un esfuerzo por explorar el papel de la PEPCK, los investigadores provocaron la sobreexpresión de la PEPCK en bacterias E. coli a través de ADN recombinante . [ 21 ]
Se ha demostrado que la PEPCK de Mycobacterium tuberculosis activa el sistema inmunitario en ratones al aumentar la actividad de las citoquinas . [ 22 ]
Como resultado, se ha descubierto que la PEPCK puede ser un ingrediente apropiado en el desarrollo de una vacuna de subunidades eficaz contra la tuberculosis . [ 22 ]
Importancia clínica
Actividad en el cáncer
Hasta hace poco, la PEPCK no se había tenido en cuenta en la investigación oncológica. Se ha demostrado que en muestras de tumores humanos y líneas celulares de cáncer humano (células de cáncer de mama, colon y pulmón), la PEPCK-M, y no la PEPCK-C, se expresaba en niveles suficientes para desempeñar un papel metabólico relevante. [ 1 ] [ 23 ] Por lo tanto, la PEPCK-M podría tener un papel en las células cancerosas, especialmente en condiciones de limitación de nutrientes u otras situaciones de estrés.
Regulación
En los humanos
La PEPCK-C se ve potenciada, tanto en su producción como en su activación, por numerosos factores. La transcripción del gen de la PEPCK-C es estimulada por el glucagón , los glucocorticoides , el ácido retinoico y el adenosín 3',5'-monofosfato ( AMPc ), mientras que es inhibida por la insulina . [ 24 ] De estos factores, la insulina, una hormona deficiente en la diabetes mellitus tipo 1, se considera dominante, ya que inhibe la transcripción de muchos de los elementos estimuladores. [ 24 ] La actividad de la PEPCK también es inhibida por el sulfato de hidrazina , y esta inhibición, por lo tanto, disminuye la tasa de gluconeogénesis. [ 25 ]
En la acidosis prolongada , la PEPCK-C se regula positivamente en las células del borde en cepillo del túbulo proximal renal , para secretar más NH 3 y, por lo tanto, producir más HCO 3 − . [ 26 ]
La actividad específica de GTP de la PEPCK es máxima cuando hay Mn²⁺ y Mg²⁺ disponibles . [ 21 ] Además, la cisteína hiperreactiva (C307) participa en la unión de Mn²⁺ al sitio activo. [ 10 ]
Plantas
Como se mencionó anteriormente, la abundancia de PEPCK aumentó cuando las plantas se regaron con cloruro de amonio de bajo pH, aunque el pH alto no tuvo este efecto. [ 20 ]
Clasificación
Se clasifica bajo el número CE 4.1.1. Existen tres tipos principales, que se distinguen por la fuente de energía que impulsa la reacción:
Referencias
- 1 2 Méndez-Lucas A, Hyroššová P, Novellasdemunt L, Viñals F, Perales JC (agosto de 2014). "La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa mitocondrial (PEPCK-M) es un gen de respuesta al estrés del retículo endoplasmático (RE) pro-supervivencia involucrado en la adaptación de las células tumorales a la disponibilidad de nutrientes" . The Journal of Biological Chemistry . 289 (32): 22090– 102. doi : 10.1074/jbc.M114.566927 . PMC 4139223. PMID 24973213 .
- 1 2 Méndez-Lucas A, Duarte JA, Sunny NE, Satapati S, He T, Fu X, et al. (julio de 2013). "La expresión de PEPCK-M en el hígado de ratón potencia, no reemplaza, la gluconeogénesis mediada por PEPCK-C" . Journal of Hepatology . 59 (1): 105–13 . doi : 10.1016/j.jhep.2013.02.020 . PMC 3910155. PMID 23466304 .
- 1 2 Chakravarty K, Cassuto H, Reshef L, Hanson RW (2005). "Factores que controlan la transcripción específica de tejido del gen de la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa-C". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 40 (3): 129– 54. doi : 10.1080/10409230590935479 . PMID 15917397 . S2CID 633399 .
- ↑ Robinson BH (mayo de 1971). "Transporte de fosfoenolpiruvato por el sistema transportador de tricarboxilato en mitocondrias de mamíferos" . FEBS Letters . 14 (5): 309– 312. Bibcode : 1971FEBSL..14..309R . doi : 10.1016 / 0014-5793(71)80287-9 . PMID 11945784. S2CID 9617975 .
- ↑ Söling HD, Walter U, Sauer H, Kleineke J (diciembre de 1971). "Efectos de análogos sintéticos del fosfoenolpiruvato sobre la piruvato quinasa muscular y hepática, la enolasa muscular, la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa hepática y sobre el sistema de transporte de transportadores de ácido tricarboxílico intra/extramitocondrial". FEBS Letters . 19 (2): 139– 143. Bibcode : 1971FEBSL..19..139S . doi : 10.1016/0014-5793(71)80498-2 . PMID 11946196 . S2CID 40637963 .
- ↑ Kleineke J, Sauer H, Söling HD (enero de 1973). "Sobre la especificidad del sistema transportador de tricarboxilato en las mitocondrias del hígado de rata" . FEBS Letters . 29 (2): 82– 6. Bibcode : 1973FEBSL..29...82K . doi : 10.1016/0014-5793(73)80531-9 . PMID 4719206. S2CID 30730789 .
- ↑ Shug AL, Shrago E (julio de 1973). "Inhibición del transporte de fosfoenolpiruvato a través de los sistemas transportadores de nucleótidos de tricarboxilato y adenina de las mitocondrias del hígado de rata". Biochemical and Biophysical Research Communications . 53 (2): 659– 65. Bibcode : 1973BBRC...53..659S . doi : 10.1016/0006-291X(73)90712-2 . PMID 4716993 .
- ↑ Sul HS, Shrago E, Shug AL (enero de 1976). "Relación del transporte de fosfoenolpiruvato, la inhibición de la translocasa de nucleótidos de adenina por la acil coenzima A y el eflujo de iones de calcio en las mitocondrias del corazón de cobaya". Archives of Biochemistry and Biophysics . 172 (1): 230–7 . doi : 10.1016/0003-9861(76)90071-0 . PMID 1252077 .
- ↑ Satrústegui J, Pardo B, Del Arco A (enero de 2007). "Transportadores mitocondriales como nuevos objetivos para la señalización intracelular de calcio". Physiological Reviews . 87 (1): 29– 67. doi : 10.1152/physrev.00005.2006 . PMID 17237342 .
- 1 2 3 Holyoak T, Sullivan SM, Nowak T (julio de 2006). "Perspectivas estructurales sobre el mecanismo de la catálisis de PEPCK". Biochemistry . 45 (27): 8254– 63. doi : 10.1021/bi060269g . PMID 16819824 .
- 1 2 3 Delbaere LT, Sudom AM, Prasad L, Leduc Y, Goldie H (marzo de 2004). "Estudios de estructura/función de la transferencia de fosforilo por la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteínas y proteómica . 1697 ( 1– 2): 271– 8. doi : 10.1016/j.bbapap.2003.11.030 . PMID 15023367 .
- ↑ Trapani S, Linss J, Goldenberg S, Fischer H, Craievich AF, Oliva G (noviembre de 2001). "Estructura cristalina de la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa dimérica (PEPCK) de Trypanosoma cruzi a una resolución de 2 Å". Journal of Molecular Biology . 313 (5): 1059–72 . doi : 10.1006/jmbi.2001.5093 . PMID 11700062 .
- 1 2 Zamboni N, Maaheimo H, Szyperski T, Hohmann HP, Sauer U (octubre de 2004). "La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa también cataliza la carboxilación C 3 en la interfaz de la glucólisis y el ciclo de Krebs de Bacillus subtilis". Ingeniería metabólica . 6 (4): 277– 84. doi : 10.1016/j.ymben.2004.03.001 . PMID 15491857 .
- ↑ Centro Médico Vanderbilt. "Laboratorio Granner, Investigación sobre PEPCK." 2001. En línea. Internet. Consultado a las 22:46, 13/04/07. www.mc.vanderbilt.edu/root/vumc.php?site=granner&doc=119
- 1 2 Burgess SC, He T, Yan Z, Lindner J, Sherry AD, Malloy CR, et al. (abril de 2007). " La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa citosólica no controla por sí sola la tasa de gluconeogénesis hepática en el hígado intacto del ratón" . Cell Metabolism . 5 (4): 313–20 . doi : 10.1016/j.cmet.2007.03.004 . PMC 2680089. PMID 17403375 .
- ↑ Nash JT, Szabo DT, Carey GB (2012). "Los éteres de difenilo polibromados alteran la cinética de la enzima fosfoenolpiruvato carboxiquinasa hepática en ratas Wistar macho: implicaciones para el metabolismo de lípidos y glucosa". Journal of Toxicology and Environmental Health. Parte A. 76 ( 2): 142– 56. doi : 10.1080/15287394.2012.738457 . PMID 23294302. S2CID 24458236 .
- ↑ Kanai R, Edwards, GE (1998). "La bioquímica de la fotosíntesis C4" . En Sage RF, Monson RK (eds.). Biología de las plantas C4 . Elsevier. pp. 49–87 . ISBN 978-0-08-052839-7.
{{cite book}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace ) - ↑ Christopher JT, Holtum J (septiembre de 1996). "Patrones de partición de carbono en hojas de especies de metabolismo ácido de Crasulaceae durante la desacidificación" . Plant Physiology . 112 (1): 393–399 . doi : 10.1104/pp.112.1.393 . PMC 157961. PMID 12226397 .
- ↑ Voznesenskaya EV, Franceschi VR, Chuong SD, Edwards GE (julio de 2006). "Caracterización funcional de la anatomía foliar de la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa tipo C 4 : análisis inmuno-, citoquímicos y ultraestructurales" . Annals of Botany . 98 (1): 77–91 . doi : 10.1093/aob/mcl096 . PMC 2803547. PMID 16704997 .
- 1 2 3 4 Chen ZH, Walker RP, Técsi LI, Lea PJ, Leegood RC (mayo de 2004). "La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa en plantas de pepino aumenta tanto por amonio como por acidificación, y está presente en el floema". Planta . 219 (1): 48– 58. Bibcode : 2004Plant.219...48C . doi : 10.1007/s00425-004-1220-y . PMID 14991407 . S2CID 23800457 .
- 1 2 Aich S, Imabayashi F, Delbaere LT (octubre de 2003). "Expresión, purificación y caracterización de una carboxiquinasa de PEP dependiente de GTP bacteriana". Protein Expression and Purification . 31 (2): 298– 304. doi : 10.1016/S1046-5928(03)00189-X . PMID 14550651 .
- 1 2 Liu K, Ba X, Yu J, Li J, Wei Q, Han G, et al. (agosto de 2006). "La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa de Mycobacterium tuberculosis induce fuertes respuestas inmunitarias mediadas por células en ratones". Bioquímica molecular y celular . 288 ( 1–2 ): 65–71 . doi : 10.1007/s11010-006-9119-5 . PMID 16691317. S2CID 36284611 .
- ↑ Leithner K, Hrzenjak A, Trötzmüller M, Moustafa T, Köfeler HC, Wohlkoenig C, et al. (febrero de 2015). "La activación de PCK2 media una respuesta adaptativa al agotamiento de glucosa en el cáncer de pulmón" . Oncogene . 34 ( 8): 1044– 50. doi : 10.1038/onc.2014.47 . PMID 24632615. S2CID 11902696 .
- 1 2 O'Brien RM, Lucas PC, Forest CD, Magnuson MA, Granner DK (agosto de 1990). "Identificación de una secuencia en el gen PEPCK que media un efecto negativo de la insulina en la transcripción". Science . 249 (4968): 533– 7. Bibcode : 1990Sci...249..533O . doi : 10.1126/science.2166335 . PMID 2166335 .
- ↑ Mazzio E, Soliman KF (enero de 2003). "El papel de la glucólisis y la gluconeogénesis en la citoprotección de las células de neuroblastoma contra la toxicidad del ion 1-metil-4-fenilpiridinio". Neurotoxicología . 24 (1): 137–47 . Bibcode : 2003NeuTx..24..137M . doi : 10.1016/S0161-813X(02)00110-9 . PMID 12564389 .
- ↑ Walter F. Boron (2005). Fisiología médica: un enfoque celular y molecular . Elsevier/Saunders. pág. 858. ISBN 978-1-4160-2328-9.
Enlaces externos
- Fosfoenolpiruvato+Carboxiquinasa+(ATP) en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Fosfoenolpiruvato+Carboxiquinasa+(GTP) en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- "Ratones poderosos" (ratones PEPCK-Cmus) https://web.archive.org/web/20071107175951/http://blog.case.edu/case-news/2007/11/02/mightymouse
- Genes en el cromosoma 20 humano
- Genes en el cromosoma 14 humano
- CE 4.1.1