Dominio PKD

El dominio PKD (enfermedad renal poliquística) se identificó por primera vez en la proteína de la enfermedad renal poliquística , policistina-1 (gen PKD1 ), y contiene un pliegue similar a Ig que consiste en un sándwich beta de siete hebras en dos láminas con una topología de clave griega , aunque algunos miembros tienen hebras adicionales. ^[1] La policistina-1 es una gran glicoproteína de la superficie celular involucrada en interacciones adhesivas proteína-proteína y proteína-carbohidrato; sin embargo, no está claro si el dominio PKD media alguna de estas interacciones.

Los dominios PKD también se encuentran en otras proteínas, generalmente en las partes extracelulares de las proteínas involucradas en interacciones con otras proteínas. Por ejemplo, los dominios con un pliegue de tipo PKD se encuentran en las proteínas de la capa S de las arqueas que protegen a la célula de ambientes extremos ^[2] y en el receptor humano SorCS2 ^[3] .

Proteínas humanas que contienen este dominio

GPNMB ; PKD1 ; PKD1L1 ; PMEL ; SORCS1; SORCS2 ; SORCS3

Referencias

^ Bycroft M, Bateman A, Clarke J, Hamill SJ, Sandford R, Thomas RL, Chothia C (1999). "La estructura de un dominio PKD de la policistina-1: implicaciones para la enfermedad renal poliquística". EMBO J . 18 (2): 297–305. doi :10.1093/emboj/18.2.297. PMC 1171124 . PMID 9889186.
^ Joachimiak A, Springer TA, Zhang RG, Wang JH, Liu JH, Jing H, Takagi J, Lindgren S (2002). "Las proteínas de la capa superficial de las arqueas contienen dominios de hélice beta, PKD y beta y están relacionadas con las proteínas de la superficie celular de los metazoos". Structure . 10 (10): 1453–1464. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00840-7 . PMID 12377130.
^ Hermans-Borgmeyer I, Hampe W, Schaller HC, Rezgaoui M (2001). "Los genes de los receptores humanos que contienen el dominio VPS10 son grandes y contienen muchos exones pequeños". Hum. Genet . 108 (6): 529–36. doi :10.1007/s004390100504. PMID 11499680. S2CID 23375354.

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[PUB00001323-1] Bycroft M, Bateman A, Clarke J, Hamill SJ, Sandford R, Thomas RL, Chothia C (1999). "La estructura de un dominio PKD de la policistina-1: implicaciones para la enfermedad renal poliquística". EMBO J . 18 (2): 297–305. doi :10.1093/emboj/18.2.297. PMC 1171124 . PMID 9889186.

[PUB00014157-2] Joachimiak A, Springer TA, Zhang RG, Wang JH, Liu JH, Jing H, Takagi J, Lindgren S (2002). "Las proteínas de la capa superficial de las arqueas contienen dominios de hélice beta, PKD y beta y están relacionadas con las proteínas de la superficie celular de los metazoos". Structure . 10 (10): 1453–1464. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00840-7 . PMID 12377130.

[PUB00035973-3] Hermans-Borgmeyer I, Hampe W, Schaller HC, Rezgaoui M (2001). "Los genes de los receptores humanos que contienen el dominio VPS10 son grandes y contienen muchos exones pequeños". Hum. Genet . 108 (6): 529–36. doi :10.1007/s004390100504. PMID 11499680. S2CID 23375354.