POLR2A

La subunidad RPB1 de la ARN polimerasa II dependiente de ADN , también conocida como RPB1 , es una enzima codificada por el gen POLR2A en humanos.

Función

Este gen codifica la subunidad más grande de la ARN polimerasa II , la polimerasa responsable de sintetizar el ARN mensajero en eucariotas . El producto de este gen contiene un dominio carboxilo terminal compuesto por repeticiones de heptapéptidos esenciales para la actividad de la polimerasa . Estas repeticiones contienen residuos de serina y treonina que se fosforilan en la ARN polimerasa que se encuentra en plena transcripción . Además, esta subunidad, junto con otras subunidades de la polimerasa, forma el dominio de unión al ADN, un surco donde la plantilla de ADN se transcribe a ARN. ^{[ 5 ]}

Interacciones

Se ha demostrado que POLR2A interactúa con:

BRCA1 , ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
CREBBP , ^{[ 10 ]}
CTDP1 , ^{[ 7 ]}
CDK8 , ^{[ 10 ]}
GTF2B , ^{[ 7 ]}
GTF2F1 , ^{[ 7 ]}^{[ 10 ]}
GTF2H4 , ^{[ 7 ]}
MED21 , ^{[ 7 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
MED26 , ^{[ 12 ]}
PCAF , ^{[ 10 ]}
POLR2C , ^{[ 13 ]}
POLR2E , ^{[ 13 ]}
POLR2H , ^{[ 13 ]}
POLR2L , ^{[ 13 ]}
PQBP1 , ^{[ 14 ]}
SMARCA2 , ^{[ 10 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}
SMARCA4 ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}
SMARCB1 , ^{[ 10 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}
SMYD3 , ^{[ 18 ]}
SND1 , ^{[ 19 ]}
SUPT5H , ^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}
TAF11 , ^{[ 7 ]}
TBP , ^{[ 7 ]}
TCEA1 , ^{[ 22 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}
TCERG1 , ^{[ 25 ]} y
ZNF74 . ^{[ 26 ]}

Referencias

1 2 3 ENSG00000181222 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000284832, ENSG00000181222 – Ensembl , mayo de 2017
1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000005198 – Ensembl , mayo de 2017
↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
↑ "Gen Entrez: polipéptido A de la polimerasa (ARN) II (dirigida por ADN) POLR2A, 220 kDa" .
↑ Krum SA, Miranda GA, Lin C, Lane TF (diciembre de 2003). "BRCA1 se asocia con la ARN polimerasa II procesiva" . J. Biol. Chem . 278 (52): 52012–20 . doi : 10.1074/jbc.M308418200 . PMID 14506230 .
1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 ( 11): 5605– 10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825. PMID 9159119 .
↑ Chiba N, Parvin JD (octubre de 2001). "Redistribución de BRCA1 entre cuatro complejos proteicos diferentes tras el bloqueo de la replicación" . J. Biol. Chem . 276 (42): 38549–54 . doi : 10.1074/jbc.M105227200 . PMID 11504724 .
↑ Krum SA, Womack JE, Lane TF (septiembre de 2003). "El gen BRCA1 bovino muestra respuestas clásicas al estrés genotóxico, pero baja actividad de activación transcripcional in vitro" . Oncogene . 22 (38): 6032–44 . doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . PMID 12955082 .
1 2 3 4 5 6 7 Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (septiembre de 1998). "Un complejo de ARN polimerasa II humana que contiene factores que modifican la estructura de la cromatina" . Mol . Cell. Biol . 18 (9): 5355– 63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120. PMID 9710619 .
↑ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (octubre de 1997). "CA150, una proteína nuclear asociada con la holoenzima de la ARN polimerasa II, participa en la transcripción del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 activada por Tat" . Mol . Cell. Biol . 17 (10): 6029–39 . doi : 10.1128/MCB.17.10.6029 . PMC 232452. PMID 9315662 .
↑ Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades mediadoras de mamíferos consensuadas identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional" . Mol. Cell . 14 (5): 685–91 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .
1 2 3 4 Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (julio de 1997). "Interacciones entre las subunidades de la ARN polimerasa II humana" . J. Biol. Chem . 272 (27): 16815–21 . doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . PMID 9201987 .
↑ Humbert S, Saudou F (mayo de 2002). " Hacia la especificidad celular en SCA1" . Neuron . 34 (5): 669–70 . doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . PMID 12062012. S2CID 15993809 .
1 2 3 Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (marzo de 2001). "Purificación y caracterización de complejos de remodelación de cromatina Brg1 y hBrm que contienen mSin3A" . Genes Dev . 15 (5): 603– 18. doi : 10.1101/gad.872801 . PMC 312641. PMID 11238380 .
^ Wang W , Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (octubre de 1996) . "Purificación y heterogeneidad bioquímica del complejo SWI-SNF de mamíferos" . EMBO J. 15 (19): 5370– 82. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x . PMC 452280 . PMID 8895581 .
↑ Zhao K, Wang W, Rando OJ, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree GR (noviembre de 1998). "Unión rápida y dependiente de fosfoinositol del complejo BAF similar a SWI/SNF a la cromatina después de la señalización del receptor de linfocitos T" . Cell . 95 ( 5): 625–36 . doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . PMID 9845365. S2CID 3184211 .
↑ Hamamoto R, Furukawa Y, Morita M, Iimura Y, Silva FP, Li M, Yagyu R, Nakamura Y (agosto de 2004). "SMYD3 codifica una histona metiltransferasa involucrada en la proliferación de células cancerosas". Nat . Cell Biol . 6 (8): 731– 40. doi : 10.1038/ncb1151 . PMID 15235609. S2CID 13456531 .
^ Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (septiembre de 2002). "Identificación de p100 como coactivador de STAT6 que une STAT6 con la ARN polimerasa II" . EMBO J. 21 (18): 4950–8.doi : 10.1093 / emboj /cdf463 . PMC 126276 . PMID 12234934 .
↑ Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp PA (septiembre de 1999). "La proteína Tat-SF1 se asocia con las proteínas RAP30 y SPT5 humanas" . Mol . Cell. Biol . 19 (9): 5960–8 . doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462. PMID 10454543 .
^ Wada T, Takagi T, Yamaguchi Y, Ferdous A, Imai T, Hirose S, Sugimoto S, Yano K, Hartzog GA, Winston F, Buratowski S, Handa H (febrero de 1998). "DSIF, un nuevo factor de alargamiento de la transcripción que regula la procesividad de la ARN polimerasa II, está compuesto de homólogos humanos Spt4 y Spt5" . Desarrollo de genes . 12 (3): 343– 56. doi : 10.1101/gad.12.3.343 . PMC 316480 . PMID 9450929 .
↑ Conaway RC, Kong SE, Conaway JW (agosto de 2003). "TFIIS y GreB: dos factores de elongación de la transcripción con ideas afines y dedos pegajosos" . Cell . 114 ( 3): 272–4 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00607-X . PMID 12914690. S2CID 14209300 .
↑ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (octubre de 1998). "FCP1, la subunidad que interactúa con RAP74 de una proteína fosfatasa humana que desfosforila el dominio carboxilo-terminal de la ARN polimerasa IIO" . J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601 . doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .
↑ Pan G, Aso T, Greenblatt J (septiembre de 1997). "Interacción de los factores de elongación TFIIS y elongina A con una holoenzima de ARN polimerasa II humana capaz de iniciar la transcripción de forma específica en el promotor y sensible a los activadores transcripcionales" . J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71 . doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .
↑ Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C, Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL (agosto de 2000). "Módulos de interacción de proteínas que organizan la función nuclear: los dominios FF de CA150 se unen al fosfoCTD de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (16): 9015–20 . Bibcode : 2000PNAS...97.9015C . doi : 10.1073 / pnas.160266597 . PMC 16813. PMID 10908677 .
↑ Grondin B, Côté F, Bazinet M, Vincent M, Aubry M (octubre de 1997). "Interacción directa de la proteína de dedo de zinc KRAB/Cys2-His2 ZNF74 con una forma hiperfosforilada de la subunidad más grande de la ARN polimerasa II" . J. Biol. Chem . 272 (44): 27877–85 . doi : 10.1074/jbc.272.44.27877 . PMID 9346935 .

Lecturas adicionales

Jeang KT (1998). "Tat, quinasa asociada a Tat y transcripción". J. Biomed. Sci . 5 (1): 24– 7. doi : 10.1007/BF02253352 . PMID 9570510 .
Yankulov K, Bentley D (1998). "Control transcripcional: cofactores Tat y elongación transcripcional" . Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y . doi : 10.1016/ S0960-9822 (98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646 .
Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (2000). "Funciones reguladoras de Cdk9 y de ciclina T1 en la expresión génica de la vía de transactivación tat del VIH". J. Cell. Biochem . 75 (3): 357– 68. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3 < 357::AID-JCB1 > 3.0.CO ; 2 -K . PMID 10536359. S2CID 43685090 .
Szentirmay MN, Sawadogo M (2000). " Organización espacial de la transcripción de la ARN polimerasa II en el núcleo" . Nucleic Acids Res . 28 (10): 2019– 25. doi : 10.1093/nar/28.10.2019 . PMC 105382. PMID 10773068 .
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). " Múltiples modos de regulación transcripcional por el transactivador Tat del VIH-1" . IUBMB Life . 51 (3): 175– 81. doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID 11547919. S2CID 10931640 .

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 ENSG00000181222 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000284832, ENSG00000181222 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000005198 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .

[5] "Gen Entrez: polipéptido A de la polimerasa (ARN) II (dirigida por ADN) POLR2A, 220 kDa" .

[pmid14506230-6] Krum SA, Miranda GA, Lin C, Lane TF (diciembre de 2003). "BRCA1 se asocia con la ARN polimerasa II procesiva" . J. Biol. Chem . 278 (52): 52012–20 . doi : 10.1074/jbc.M308418200 . PMID 14506230 .

[pmid9159119-7] 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R, Anderson SF, Chao DM, Wei W, Ye L, Young RA, Livingston DM, Parvin JD (mayo de 1997). "BRCA1 es un componente de la holoenzima de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 ( 11): 5605– 10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . PMC 20825. PMID 9159119 .

[pmid11504724-8] Chiba N, Parvin JD (octubre de 2001). "Redistribución de BRCA1 entre cuatro complejos proteicos diferentes tras el bloqueo de la replicación" . J. Biol. Chem . 276 (42): 38549–54 . doi : 10.1074/jbc.M105227200 . PMID 11504724 .

[pmid12955082-9] Krum SA, Womack JE, Lane TF (septiembre de 2003). "El gen BRCA1 bovino muestra respuestas clásicas al estrés genotóxico, pero baja actividad de activación transcripcional in vitro" . Oncogene . 22 (38): 6032–44 . doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . PMID 12955082 .

[pmid9710619-10] 1 2 3 4 5 6 7 Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (septiembre de 1998). "Un complejo de ARN polimerasa II humana que contiene factores que modifican la estructura de la cromatina" . Mol . Cell. Biol . 18 (9): 5355– 63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120. PMID 9710619 .

[pmid9315662-11] Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (octubre de 1997). "CA150, una proteína nuclear asociada con la holoenzima de la ARN polimerasa II, participa en la transcripción del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 activada por Tat" . Mol . Cell. Biol . 17 (10): 6029–39 . doi : 10.1128/MCB.17.10.6029 . PMC 232452. PMID 9315662 .

[pmid15175163-12] Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, Banks CA, Jin J, Cai Y, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades mediadoras de mamíferos consensuadas identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional" . Mol. Cell . 14 (5): 685–91 . doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .

[pmid9201987-13] 1 2 3 4 Acker J, de Graaff M, Cheynel I, Khazak V, Kedinger C, Vigneron M (julio de 1997). "Interacciones entre las subunidades de la ARN polimerasa II humana" . J. Biol. Chem . 272 (27): 16815–21 . doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . PMID 9201987 .

[pmid12062018-14] Humbert S, Saudou F (mayo de 2002). " Hacia la especificidad celular en SCA1" . Neuron . 34 (5): 669–70 . doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . PMID 12062012. S2CID 15993809 .

[pmid11238380-15] 1 2 3 Sif S, Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE (marzo de 2001). "Purificación y caracterización de complejos de remodelación de cromatina Brg1 y hBrm que contienen mSin3A" . Genes Dev . 15 (5): 603– 18. doi : 10.1101/gad.872801 . PMC 312641. PMID 11238380 .

[pmid8895581-16] Wang W , Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (octubre de 1996) . "Purificación y heterogeneidad bioquímica del complejo SWI-SNF de mamíferos" . EMBO J. 15 (19): 5370– 82. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x . PMC 452280 . PMID 8895581 .

[pmid9845365-17] Zhao K, Wang W, Rando OJ, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree GR (noviembre de 1998). "Unión rápida y dependiente de fosfoinositol del complejo BAF similar a SWI/SNF a la cromatina después de la señalización del receptor de linfocitos T" . Cell . 95 ( 5): 625–36 . doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . PMID 9845365. S2CID 3184211 .

[pmid15235609-18] Hamamoto R, Furukawa Y, Morita M, Iimura Y, Silva FP, Li M, Yagyu R, Nakamura Y (agosto de 2004). "SMYD3 codifica una histona metiltransferasa involucrada en la proliferación de células cancerosas". Nat . Cell Biol . 6 (8): 731– 40. doi : 10.1038/ncb1151 . PMID 15235609. S2CID 13456531 .

[pmid12234934-19] Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (septiembre de 2002). "Identificación de p100 como coactivador de STAT6 que une STAT6 con la ARN polimerasa II" . EMBO J. 21 (18): 4950–8.doi : 10.1093 / emboj /cdf463 . PMC 126276 . PMID 12234934 .

[pmid10454543-20] Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp PA (septiembre de 1999). "La proteína Tat-SF1 se asocia con las proteínas RAP30 y SPT5 humanas" . Mol . Cell. Biol . 19 (9): 5960–8 . doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC 84462. PMID 10454543 .

[pmid9450929-21] Wada T, Takagi T, Yamaguchi Y, Ferdous A, Imai T, Hirose S, Sugimoto S, Yano K, Hartzog GA, Winston F, Buratowski S, Handa H (febrero de 1998). "DSIF, un nuevo factor de alargamiento de la transcripción que regula la procesividad de la ARN polimerasa II, está compuesto de homólogos humanos Spt4 y Spt5" . Desarrollo de genes . 12 (3): 343– 56. doi : 10.1101/gad.12.3.343 . PMC 316480 . PMID 9450929 .

[pmid12914699-22] Conaway RC, Kong SE, Conaway JW (agosto de 2003). "TFIIS y GreB: dos factores de elongación de la transcripción con ideas afines y dedos pegajosos" . Cell . 114 ( 3): 272–4 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00607-X . PMID 12914690. S2CID 14209300 .

[pmid9765293-23] Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (octubre de 1998). "FCP1, la subunidad que interactúa con RAP74 de una proteína fosfatasa humana que desfosforila el dominio carboxilo-terminal de la ARN polimerasa IIO" . J. Biol. Chem . 273 (42): 27593–601 . doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 . PMID 9765293 .

[pmid9305922-24] Pan G, Aso T, Greenblatt J (septiembre de 1997). "Interacción de los factores de elongación TFIIS y elongina A con una holoenzima de ARN polimerasa II humana capaz de iniciar la transcripción de forma específica en el promotor y sensible a los activadores transcripcionales" . J. Biol. Chem . 272 (39): 24563–71 . doi : 10.1074/jbc.272.39.24563 . PMID 9305922 .

[pmid10908677-25] Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C, Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL (agosto de 2000). "Módulos de interacción de proteínas que organizan la función nuclear: los dominios FF de CA150 se unen al fosfoCTD de la ARN polimerasa II" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (16): 9015–20 . Bibcode : 2000PNAS...97.9015C . doi : 10.1073 / pnas.160266597 . PMC 16813. PMID 10908677 .

[pmid9346935-26] Grondin B, Côté F, Bazinet M, Vincent M, Aubry M (octubre de 1997). "Interacción directa de la proteína de dedo de zinc KRAB/Cys2-His2 ZNF74 con una forma hiperfosforilada de la subunidad más grande de la ARN polimerasa II" . J. Biol. Chem . 272 (44): 27877–85 . doi : 10.1074/jbc.272.44.27877 . PMID 9346935 .

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

Función

Interacciones

Referencias

Lecturas adicionales

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