La patelamida A es un producto natural peptídico producido por Prochloron didemni , un simbionte cianobacteriano de Lissoclinum patella , y fue aislado por primera vez en 1981. [1] La patelamida A es uno de los muchos péptidos didemnidos. Otros péptidos estrechamente relacionados incluyen las patelamidas B, C y D y la trunkamida. Las patelamidas y la trunkamida muestran una citotoxicidad moderada y actividad contra líneas celulares de cáncer resistentes a múltiples fármacos . [2]
Historia
La patelamida A se aisló por primera vez en 1981 del tunicado L. patella recolectado en los arrecifes de la isla Korror, en las islas Palau . [1] L. patella ha sido una fuente rica de productos naturales peptídicos. Además de las patelamidas, las lisoclinamidas, la uliciclamida , la ulithiaciclamida y la ascidiaciclamida se aislaron de L. patella . [3] La estereoquímica absoluta se determinó posteriormente mediante cristalografía de rayos X. [4]
Biosíntesis
La patelamida A se origina a partir de un péptido ribosomal , lo que la convierte en miembro de la superfamilia RiPP de productos naturales . Esto se determinó después de que la secuenciación del genoma de P. didemi mostrara una falta de sintetasas de péptidos no ribosomales. [2] El grupo de genes biosintéticos para la patelamida A contiene los genes patA , patB , patC , patD , patE , patF y patG . [2] Estos genes, cuando se introducen en E. coli , causan la producción de patelamida A, lo que confirma definitivamente su responsabilidad en la biosíntesis de patelamida A. El gen patE codifica el péptido precursor que contiene las secuencias primarias de las patelamidas A y C. Schmidt et al. han propuesto que esta prepatelamida se heterocicla para formar los anillos de oxazolina y tiazolina por PatD2. Se propone que PatG1 está posteriormente involucrada en la oxidación de los anillos de tiazolina a los anillos de tiazol encontrados en la patelamida A. El péptido es entonces escindido, posiblemente por PatA o PatG2, y ciclado, la ciclización es probablemente ayudada por la adenilación por PatD1, formando los dos péptidos cíclicos, patelamidas A y C. [2] Aunque todos los aminoácidos utilizados en la producción de patelamida A son L-aminoácidos, algunos de los aminoácidos encontrados en la patelamida A natural son los D-epímeros. Se propone que la epimerización de estos aminoácidos ocurre espontáneamente. Esto fue determinado por comparación con un sistema similar, lisoclinamida 7. [5]
Referencias
- ^ ab Ireland, C.; Durso, A.; Newman, R.; Hacker, D. (1982). "Péptidos cíclicos antineoplásicos del tunicado marino Lissoclinum patella". J. Org. Chem . 47 (10): 1807–1811. doi :10.1021/jo00349a002.
- ^ abcde Schmidt, E.; Nelson, J.; Rasko, D.; Sudek, S.; Eisen, J.; Haygood, M.; Ravel, J. (2005). "Biosíntesis de patelamida a y C por una vía similar a la microcina en Prochloron didemni, el simbionte cianobacteriano de Lissoclinum patella". Proc. Natl. Sci . 102 (20): 7315–7320. Bibcode :2005PNAS..102.7315S. doi : 10.1073/pnas.0501424102 . PMC 1091749 . PMID 15883371.
- ^ Degnan, B.; Hawkins, C.; Lavin, M.; Mccaffrey, E.; Parry, D.; Vandenbrenk, A.; Watters D. (1989). "Nuevos péptidos cíclicos con actividad citotóxica de la ascidia Lissoclinum patella". J. Med. Chem . 32 (6): 1349–1354. doi :10.1021/jm00126a034. PMID 2724305.
- ^ En, Y.; Doi, M.; Inoue, M.; Ishida, T. (1994). "Patelamida A, un péptido cíclico citotóxico de la ascidia Lissoclinum patella". Acta Crystallogr . 50 (3): 432–434. doi : 10.1107/s010827019300811x . PMID 8018309.
- ^ Milne, B.; Long, P.; Starcevic, A.; Hranueli, D.; Jaspars, M. (2006). "Espontaneidad en la vía biosintética de la patelamida". Org. Biomol. Chem . 4 (4): 631–638. CiteSeerX 10.1.1.1027.4259 . doi :10.1039/b515938e. PMID 16467937.