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Virus de Playa de Oro

El virus Playa de Oro ( OROV ) es una probable especie de ortohantavirus que se encuentra en los roedores Oryzomys couesi y Sigmodon mascotensis en el estado mexicano de Colima ...

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El virus Playa de Oro ( OROV ) es una probable especie de ortohantavirus que se encuentra en los roedores Oryzomys couesi y Sigmodon mascotensis en el estado mexicano de Colima . Se cree que el primero es el huésped principal . Se han determinado las secuencias de partes del genoma de ARN del virus; estas difieren entre un 7 y un 10 % en la composición de aminoácidos y entre un 22 y un 24 % en la composición de nucleótidos con respecto a virus estrechamente relacionados.

El virus Playa de Oro fue identificado como una nueva especie en 2008 y está estrechamente relacionado con los virus Bayou , Catacamas , Muleshoe y Black Creek Canal , que se encuentran en otras especies de Oryzomys y Sigmodon . El virus Catacamas se encuentra en una población diferente de Oryzomys couesi , y la presencia de virus distintos en estas dos especies se ha utilizado como argumento para clasificar a las dos poblaciones del huésped como especies separadas.

Historia y ocurrencia

El virus Playa de Oro se identificó por primera vez en roedores recolectados en 2004 como parte de un estudio de mamíferos silvestres en Playa de Oro en Manzanillo , Colima , oeste de México. El descubrimiento fue publicado en 2008 por Yong-Kyu Chu y colegas. [ 1 ] Entre 600 pequeños mamíferos, se encontraron anticuerpos contra el virus hantavirus Sin Nombre en 23 individuos (de 358 estudiados) de Oryzomys couesi , una rata arrocera que fue la especie más común encontrada, seis (de 87) de la rata algodonera Sigmodon mascotensis , y uno (de 77) del ratón pigmeo Baiomys musculus . Además, doce O.  couesi y un S.  mascotensis produjeron ARN de hantavirus . Los virus se encontraron en machos con más frecuencia que en hembras. [ 2 ] Debido a que las secuencias de aminoácidos en las partes secuenciadas del genoma del virus diferían entre un 7 y un 10 % de hantavirus estrechamente relacionados, Chu y sus colegas identificaron el virus encontrado en Playa de Oro como una nueva especie, llamada virus de Playa de Oro u OROV. Aunque los autores no pudieron probar que el virus cumpliera con todos los criterios para identificar una nueva especie de virus, argumentaron que era probable que sí los cumpliera. [ 3 ] Actualmente se trata como una especie probable del género Hantavirus . [ 4 ]

Virología

Los hantavirus tienen un genoma que consta de tres segmentos de ARN monocatenario de sentido negativo (véase Virus de ARN: Replicación ), denominados segmento grande (L), mediano (M) y pequeño (S). [ 2 ] Se ha secuenciado el segmento S completo y un fragmento del segmento M. [ 5 ]

El segmento S consta de 1953  bases, de las cuales 1287 (a partir de la posición 43) codifican la proteína de la nucleocápside . Además, un segundo marco de lectura abierto de 192 bases se encuentra en el centro de esta secuencia (a partir de la posición 122), como en otros hantavirus. Entre tres especímenes de O.  couesi , la secuencia en este segmento difirió solo en un 1%, y todos los cambios fueron mutaciones silenciosas . Los aminoácidos del segmento S difieren entre un 7 y un 10% de los de los hantavirus relacionados: virus Bayou (BAYV; de la rata arrocera de pantano , Oryzomys palustris ), virus Catacamas (CATV; de una población de Oryzomys couesi en Honduras ) y virus del canal Black Creek (BCCV; de la rata algodonera hispida , Sigmodon hispidus ). La secuencia de nucleótidos difiere en un 24% de la de estos virus. [ 5 ]

Entre los fragmentos de 1537 bases de la secuencia del segmento M, se observaron varios sitios variables, incluyendo algunas mutaciones no silenciosas. La secuencia difiere entre un 8 y un 10 % de BAYV, CATV y BCCV en términos de aminoácidos y en un 22 % en términos de nucleótidos. [ 5 ]

Epidemiología y efectos

Debido a que el OROV ocurre frecuentemente en Oryzomys couesi , Chu y colegas sugirieron que es el huésped principal del virus y que las infecciones en Sigmodon mascotensis son el resultado de la transmisión entre estas dos especies de roedores, que se encuentran muy cerca. [ 6 ] El síndrome pulmonar por hantavirus , la enfermedad causada por hantavirus como el virus Sin Nombre, nunca se ha reportado en México, pero se han encontrado anticuerpos contra hantavirus en muestras de sangre humana en Yucatán y se sabe que varios roedores silvestres son reservorios de especies de hantavirus. [ 7 ] Por lo tanto, existe un riesgo potencial de infección por OROV en humanos. [ 8 ] Antes del descubrimiento del OROV, se había identificado una especie de hantavirus en México: el virus El Moro Canyon del pequeño roedor Reithrodontomys megalotis . [ 9 ]

Relaciones

Según los análisis filogenéticos basados ​​en las secuencias de los segmentos S y M, OROV está más estrechamente relacionado con el clado formado por BAYV, CATV, BCCV y el virus Muleshoe (MUL; de la rata algodonera hispida). [ 10 ] En 2009, Piet Maes y colegas propusieron que los virus estrechamente relacionados BAYV, BCCV y MUL se unieran en una sola especie. [ 11 ] Chu y colegas se sorprendieron al encontrar que la misma especie, Oryzomys couesi , albergaba diferentes virus (OROV y CATV), aunque observaron que las subespecies infectadas por los dos virus eran diferentes. [ 12 ] En 2010, Delton Hanson y colegas sugirieron, basándose en varias líneas de evidencia, incluida la presencia de diferentes hantavirus, que las poblaciones del oeste de México de Oryzomys couesi representan una especie diferente, Oryzomys mexicanus . [ 13 ]

Referencias

  1. ^ Chu y otros. 2008 , págs. 180-181.
  2. 1 2 Chu et al. 2008 , pág. 182.
  3. ^ Chu y otros. 2008 , págs. 186-187.
  4. ↑ Mahy 2009 , pág. 373.
  5. ^ Chu y col. 2008 , pág. 183.
  6. ↑ Chu et al. 2008 , pág. 186.
  7. ^ Chu y otros. 2008 , págs. 180, 185–186.
  8. ↑ Chu et al. 2008 , pág. 187.
  9. ↑ Chu et al. 2008 , pág. 180.
  10. ^ Chu y otros. 2008 , pág. 184, fig. 1.
  11. ↑ Maes et al. 2009 , tabla 1.
  12. ↑ Chu et al. 2008 , pág. 181.
  13. ↑ Hanson et al. 2010 , págs. 342–343.

Literatura citada

  • Chu, YK; Owen, RD; Sánchez-Hernández, C.; Romero-Almaraz, MDL; Jonsson, CB (2008). "Caracterización genética y filogenia de un hantavirus del Occidente de México". Investigación de virus . 131 (2): 180– 188. doi : 10.1016/j.virusres.2007.09.007 . PMID 17963942 . 
  • Hanson, JD; Indorf, JL; Swier, VJ; Bradley, RD (2010). "Divergencia molecular dentro del complejo Oryzomys palustris : evidencia de múltiples especies" . Journal of Mammalogy . 91 (2): 336– 347. doi : 10.1644/08-MAMM-A-342.1 .
  • Maes, P.; Klempa, B.; Clemente, J.; Matthijnssens, J.; Gajdusek, DC; Krüger, DH; Van Ranst, M. (2009). "Una propuesta de nuevos criterios para la clasificación de hantavirus, basados ​​en secuencias de proteínas de los segmentos S y M". Infección, genética y evolución . 9 (5): 813– 820. Código Bib : 2009InfGE...9..813M . doi : 10.1016/j.meegid.2009.04.012 . PMID 19393771 . 
  • Mahy, BWJ (2009). Diccionario de Virología (4.ª  ed.). Academic Press. pág.  510. ISBN 978-0-12-373732-8.