In enzymology, pyruvate synthase (EC1.2.7.1) is an enzyme that catalyzes the interconversion of pyruvate and acetyl-CoA. It is also called pyruvate:ferredoxin oxidoreductase (PFOR).
When the equilibrium favours the synthesis of pyruvic acid the reaction is:[1]
The substrates are acetyl-CoA, carbon dioxide, two protons, and reduced ferredoxin. The products are then pyruvic acid, coenzyme A, and oxidized ferredoxin.
Function
This enzyme participates in four metabolic pathways: pyruvate metabolism, propanoate metabolism, butanoate metabolism, and reductive carboxylate cycle (CO2 fixation).[1]
Its major role is the extraction of reducing equivalents by the decarboxylation. In aerobic organisms, this conversion is catalysed by pyruvate dehydrogenase, which also uses thiamine pyrophosphate (TPP) but relies on lipoate as the electron acceptor. Unlike the aerobic enzyme complex PFOR transfers reducing equivalents to flavins or iron-sulflur clusters. This process links glycolysis to the Wood–Ljungdahl pathway.
Nomenclature
This enzyme belongs to the family of oxidoreductases, specifically those acting on the aldehyde or oxo group of donor with an iron-sulfur protein as acceptor.[2] The systematic name of this enzyme class is pyruvate:ferredoxin 2-oxidoreductase (CoA-acetylating). Other names in common use include:
- pyruvate oxidoreductase,
- pyruvate synthetase,
- pyruvate:ferredoxin oxidoreductase,
- pyruvic-ferredoxin oxidoreductase.
Structure
PFOR adopta una estructura dimérica, mientras que cada subunidad monomérica está compuesta por una o varias cadenas de polipéptidos. [ 2 ] Cada subunidad monomérica de PFOR consta de seis dominios que se unen a una molécula de TPP y tres clústeres [4Fe-4S] . [ 3 ]
Mecanismo catalítico
Una reacción PFOR comienza con el ataque nucleofílico del C2 del TPP sobre el carbono 2-oxo del piruvato, lo que forma un aducto de lactil-TPP. A continuación, el aducto de lactil-TPP libera la fracción CO₂ , formando un intermedio aniónico, que luego transfiere un electrón a un clúster [4Fe-4S]. Estos pasos conducen a un intermedio radical estable que puede observarse mediante experimentos de resonancia paramagnética electrónica (RPE). El intermedio radical reacciona con una molécula de CoA, transfiere otro electrón del intermedio radical a un clúster [4Fe-4S] y forma un producto de acetil-CoA. [ 4 ]
Medicamentos relacionados
inhibidores
- La nitazoxanida es un fármaco antiparasitario de amplio espectro e inhibidor de PFOR aprobado por la FDA que se utiliza para el tratamiento de la giardiasis y la criptosporidiosis . [ 5 ] [ 6 ]
- Tizoxanida , un metabolito activo de la nitazoxanida.
- Amixicile , un derivado soluble en agua de la nitazoxanida, es un potente inhibidor de la piruvato:ferredoxina oxidorreductasa y se encuentra en estudios preclínicos para tratar infecciones por Helicobacter pylori y Clostridioides difficile . [ 7 ] [ 8 ]
Otros
- El metronidazol , un antibiótico de amplio espectro que actúa contra organismos anaeróbicos, recibe electrones de la ferredoxina reducida producida por la PFOR, convirtiéndose así en un radical libre nitroso altamente reactivo que destruye el ADN y otras biomoléculas vitales. [ 9 ]
Referencias
- ^ a b Enzima 1.2.7.1 en la base de datos de vías metabólicas KEGG .
- ^ a b Gibson MI, Chen PYT, Drennan CL (2016). "Una filogenia estructural para comprender la función de la 2-oxoácido oxidorreductasa" . Current Opinion in Structural Biology . 41 : 54–61 . doi : 10.1016/j.sbi.2016.05.011 . PMC 5381805. PMID 27315560 .
- ^ Chen PYT, Aman H, Can M, Ragsdale SW, Drennan CL (2018). "Sitio de unión para la coenzima A revelado en la estructura de la piruvato:ferredoxina oxidorreductasa de Moorella thermoacetica" . Proc Natl Acad Sci USA . 115 (15 ) : 3846–3851 . Bibcode : 2018PNAS..115.3846C . doi : 10.1073/pnas.1722329115 . PMC 5899475. PMID 29581263 .
- ^ Ragsdale SW (2003). "Piruvato ferredoxina oxidorreductasa y su intermediario radical". Chemical Reviews . 103 (6): 2333– 2346. doi : 10.1021/cr020423e . PMID 12797832 .
- ^ Di Santo N, Ehrisman J (2013). "Perspectiva de investigación: papel potencial de la nitazoxanida en el tratamiento del cáncer de ovario. ¿Fármaco antiguo, nuevo propósito?" . Cancers (Basel) . 5 (3): 1163– 1176. doi : 10.3390/cancers5031163 . PMC 3795384 . PMID 24202339 .
La nitazoxanida [NTZ: 2-acetiloxi-N-(5-nitro-2-tiazolil)benzamida] es un agente antiparasitario tiazolida con excelente actividad contra una amplia variedad de protozoos y helmintos. ... La nitazoxanida (NTZ) es un compuesto principal de una clase de compuestos antiparasitarios de amplio espectro llamados tiazolidas. Está compuesto por un anillo de nitrotiazol y una fracción de ácido salicílico unidos por un enlace amida... NTZ generalmente se tolera bien y no se han observado eventos adversos significativos en ensayos en humanos [13]. ... In vitro, NTZ y tizoxanida actúan contra una amplia gama de organismos, incluidas las especies de protozoos Blastocystis hominis, C. parvum, Entamoeba histolytica, G. lamblia y Trichomonas vaginalis [13].
- ^ "Información de prescripción de nitazoxanida" (PDF) . Administración de Alimentos y Medicamentos de los Estados Unidos . Romark Pharmaceuticals. 3 de marzo de 2004. págs. 1–9 . Consultado el 3 de enero de 2016 .
- ^ Warren CA, van Opstal E, Ballard TE, Kennedy A, Wang X, Riggins M, Olekhnovich I, Warthan M, Kolling GL, Guerrant RL, Macdonald TL, Hoffman PS (agosto de 2012). "Amixicile, un nuevo inhibidor de la piruvato: ferredoxina oxidorreductasa, muestra eficacia contra Clostridium difficile en un modelo de infección en ratones" . Antimicrob . Agents Chemother . 56 (8): 4103–11 . doi : 10.1128/AAC.00360-12 . PMC 3421617. PMID 22585229 .
- ^ Hoffman PS, Bruce AM, Olekhnovich I, Warren CA, Burgess SL, Hontecillas R, Viladomiu M, Bassaganya-Riera J, Guerrant RL, Macdonald TL (2014). "Estudios preclínicos de amixicile, un tratamiento sistémico desarrollado para el tratamiento de infecciones por Clostridium difficile que también muestra eficacia contra Helicobacter pylori" . Antimicrob. Agents Chemother . 58 (8): 4703–12 . doi : 10.1128/AAC.03112-14 . PMC 4136022. PMID 24890599 .
- ^ Brunton, Laurence L. (2011). Goodman & Gilman's: The Pharmacological Basis of Therapeutics (12.ª ed.). Nueva York: McGraw-Hill Medical. pág. 1429. ISBN 978-0-07-162442-8.
Lecturas adicionales
- Evans MC, Buchanan BB (1965). "Fotorreducción de ferredoxina y su uso en la fijación de dióxido de carbono por un sistema subcelular de una bacteria fotosintética" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 53 (6): 1420– 5. Bibcode : 1965PNAS...53.1420E . doi : 10.1073/pnas.53.6.1420 . PMC 219872. PMID 5217644 .
- Gehring U, Arnon DI (1972). "Purificación y propiedades de la α-cetoglutarato sintasa de una bacteria fotosintética" . J. Biol. Chem . 247 (21): 6963–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)44680-2 . PMID 4628267 .
- Uyeda K, Rabinowitz JC (1971). "Piruvato-ferredoxina oxidorreductasa. 3. Purificación y propiedades de la enzima" . J. Biol. Chem . 246 (10): 3111–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)62202-1 . PMID 5574389 .
- Uyeda K, Rabinowitz JC (1971). "Piruvato-ferredoxina oxidorreductasa. IV. Estudios sobre el mecanismo de reacción" . J. Biol. Chem . 246 (10): 3120– 5. doi : 10.1016/S0021-9258(18)62203-3 . PMID 4324891 .
- Charon MH, Volbeda A, Chabriere E, Pieulle L, Fontecilla-Camps JC (1999). "Estructura y mecanismo de transferencia de electrones de la piruvato:ferredoxina oxidorreductasa". Curr. Opin. Struct. Biol . 9 (6): 663– 9. doi : 10.1016/S0959-440X(99)00027-5 . PMID 10607667 .
- CE 1.2.7
- Enzimas de estructura conocida
- Esbozos EC 1.2