Articulo de referencia

RAB18

La proteína Rab-18 relacionada con Ras es una proteína que en humanos está codificada por el gen RAB18 . [ 5 ] [ 6 ] Es un miembro de la familia Rab de pequeñas GTPasas relacion...

La proteína Rab-18 relacionada con Ras es una proteína que en humanos está codificada por el gen RAB18 . [ 5 ] [ 6 ] Es un miembro de la familia Rab de pequeñas GTPasas relacionadas con Ras . [ 7 ]

Rab18 es una proteína de expresión ubicua con una expresión particularmente alta en el cerebro . [ 8 ] Rab18 se caracterizó por primera vez como una proteína endosómica en células epiteliales del riñón e intestinos de ratón. [ 8 ] Estudios posteriores revelaron que Rab18 tiene una amplia distribución intracelular; localizándose en el complejo de Golgi , el retículo endoplasmático , las gotas lipídicas y el citosol de varios tipos celulares. [ 7 ] [ 9 ] [ 10 ] En el cerebro, Rab18 se ha aislado en asociación con vesículas sinápticas [ 11 ] [ 12 ] y se ha observado que se localiza en gránulos secretores en células neuroendocrinas. [ 13 ]

Se cree que las mutaciones en RAB18 , RAB3GAP1 , RAB3GAP2 o TBC1D20 causan el síndrome de Warburg Micro al alterar la función de RAB18. Los genes RAB3GAP1 , RAB3GAP2 y TBC1D20 proporcionan instrucciones para la creación de proteínas que regulan RAB18. [ 14 ] Las proteínas RAB3GAP1 y RAB3GAP2 interactúan y crean un complejo factor de intercambio de nucleótidos de guanina que activa RAB18. La proteína TBC1D20 puede inactivar RAB18 actuando como una proteína activadora de GTPasa para ella. [ 14 ] [ 15 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000099246 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000073639 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Schafer U, Seibold S, Schneider A, Neugebauer E (febrero de 2000). "Aislamiento y caracterización del gen humano rab18 tras la estimulación de células endoteliales con histamina" . FEBS Lett . 466 (1): 148– 54. doi : 10.1016/S0014-5793(99 ) 01778-0 . PMID 10648831. S2CID 31093183 .  
  6. "Gen Entrez: RAB18 RAB18, miembro de la familia de oncogenes RAS" .
  7. 1 2 Dejgaard SY, Murshid A, Erman A, Kizilay O, Verbich D, Lodge R, Dejgaard K, Ly-Hartig TB, Pepperkok R, Simpson JC, Presley JF (agosto de 2008). "Rab18 y Rab43 tienen funciones clave en el tráfico ER-Golgi" . J. Cell Sci . 121 (Pt 16): 2768–81 . doi : 10.1242/jcs.021808 . PMID 18664496 . 
  8. 1 2 Lütcke A, Parton RG, Murphy C, Olkkonen VM, Dupree P, Valencia A, Simons K, Zerial M (diciembre de 1994). "Clonación y localización subcelular de nuevas proteínas rab revelan una expresión polarizada y específica del tipo celular" (PDF) . J. Cell Sci . 107 (12): 3437–48 . doi : 10.1242/jcs.107.12.3437 . PMID 7706395 . 
  9. Martin S, Driessen K, Nixon SJ, Zerial M, Parton RG (diciembre de 2005). "Localización regulada de Rab18 en gotas lipídicas: efectos de la estimulación lipolítica y la inhibición del catabolismo de las gotas lipídicas" ( PDF) . J. Biol. Chem . 280 (51): 42325–35 . doi : 10.1074/jbc.M506651200 . PMID 16207721. S2CID 30398568 .  
  10. Ozeki S, Cheng J, Tauchi-Sato K, Hatano N, Taniguchi H, Fujimoto T (junio de 2005). "Rab18 se localiza en gotas lipídicas e induce su estrecha aposición a la membrana derivada del retículo endoplasmático" . J. Cell Sci . 118 (Pt 12): 2601–11 . doi : 10.1242/jcs.02401 . PMID 15914536 . 
  11. Burré J, Beckhaus T, Corvey C, Karas M, Zimmermann H, Volknandt W (septiembre de 2006). "Proteínas de vesículas sinápticas en condiciones de reposo y activación: análisis mediante electroforesis diferencial en gel 2D". Electrophoresis . 27 (17): 3488– 96. doi : 10.1002/elps.200500864 . PMID 16944461. S2CID 43618245 .  
  12. Takamori S, Holt M, Stenius K, Lemke EA, Grønborg M, Riedel D, Urlaub H, Schenck S, Brügger B, Ringler P, Müller SA, Rammner B, Gräter F, Hub JS, De Groot BL, Mieskes G, Moriyama Y, Klingauf J, Grubmüller H, Heuser J, Wieland F, Jahn R (noviembre) 2006). "Anatomía molecular de un orgánulo de tráfico". Celúla . 127 (4): 831– 46. doi : 10.1016/j.cell.2006.10.030 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E357-D . PMID 17110340 . S2CID 6703431 .  
  13. Vazquez-Martinez R, Cruz-Garcia D, Duran-Prado M, Peinado JR, Castaño JP, Malagon MM (julio de 2007). " Rab18 inhibe la actividad secretora en células neuroendocrinas al interactuar con gránulos secretores" . Traffic . 8 (7): 867– 82. doi : 10.1111/j.1600-0854.2007.00570.x . PMID 17488286. S2CID 9987968 .  
  14. 1 2 "Deficiencia de RAB18: MedlinePlus Genetics" . Consultado el 27 de septiembre de 2023 .
  15. Handley MT, Carpanini SM, Mali GR, Sidjanin DJ, Aligianis IA, Jackson IJ, FitzPatrick DR (2015). "El síndrome de Warburg Micro es causado por deficiencia o desregulación de RAB18" . Open Biology . 5 (6). doi : 10.1098/rsob.150047 . PMC 4632505. PMID 26063829. 150047.  

Lecturas adicionales

  • Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, et  al. (1995). "Evaluación inicial de la diversidad genética humana y los patrones de expresión basados ​​en 83 millones de nucleótidos de secuencia de ADNc" (PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3–174 . PMID 7566098 . 
  • Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la caperuza de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Hillier LD, Lennon G, Becker M, et  al. (1997). "Generación y análisis de 280.000 etiquetas de secuencia expresada humana" . Genome Res . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 . 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et  al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, et  al. (2000). "Perfil de expresión génica en el eje hipotálamo-hipófisis-suprarrenal humano y clonación de ADNc de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (17): 9543–8 . Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901. PMID 10931946 .  
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et  al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos cDNA humanos completos que codifican proteínas" . Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .  
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et  al. (2001). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Rep . 1 (3): 287– 92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Behrends U, Schneider I, Rössler S, et  al. (2003). "Nuevos antígenos tumorales identificados mediante cribado de anticuerpos autólogos de bibliotecas de ADNc de meduloblastoma infantil" . Int . J. Cancer . 106 (2): 244– 51. doi : 10.1002/ijc.11208 . PMID 12800201. S2CID 36836051 .  
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et  al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 . 
  • Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, et  al. (2004). "La secuencia de ADN y el análisis comparativo del cromosoma 10 humano" . Nature . 429 (6990): 375–81 . Bibcode : 2004Natur.429..375D . doi : 10.1038/nature02462 . PMID 15164054 . 
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et  al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et  al. (2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Dou T, Ji C, Gu S, et  al. (2006). "Clonación y caracterización de una nueva variante de empalme del gen humano Rab18 (RAB18)". DNA Seq . 16 (3): 230– 4. doi : 10.1080/10425170500061681 . PMID 16147880. S2CID 45143893 .  
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et  al. (2006). "La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (Número especial sobre bases de datos): D415–8. doi : 10.1093/nar/ gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .